More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11309 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11309  oligopeptide-transport integral membrane protein ABC transporter oppB  100 
 
 
325 aa  639    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3928  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.54 
 
 
325 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4002  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.54 
 
 
325 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3943  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.54 
 
 
325 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.104136 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  76.92 
 
 
325 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.982552  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  75.69 
 
 
325 aa  499  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.161114  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.6 
 
 
326 aa  340  1e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.501197  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1951  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.07 
 
 
325 aa  338  7e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.497916  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7099  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.37 
 
 
327 aa  331  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.6 
 
 
328 aa  299  5e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10217  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3278  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.32 
 
 
325 aa  278  7e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000912922  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.82 
 
 
327 aa  275  5e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08480  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  45.22 
 
 
344 aa  273  2.0000000000000002e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7778  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.24 
 
 
322 aa  232  5e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.413078 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0817  ABC peptide/nickel transport system permease protein  46.21 
 
 
336 aa  228  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1117  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.18 
 
 
327 aa  228  1e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.559973  normal  0.0105879 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0920  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
330 aa  224  2e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.311537 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1254  ABC transporter, permease protein  37.8 
 
 
327 aa  223  3e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000126232 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1834  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.77 
 
 
326 aa  222  8e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31130  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  37.24 
 
 
338 aa  218  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.72 
 
 
327 aa  217  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.95 
 
 
328 aa  210  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4534  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.33 
 
 
336 aa  205  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.463935 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.45 
 
 
327 aa  204  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1632  putative ABC transporter permease  38.32 
 
 
336 aa  194  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214794  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0873  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.41 
 
 
320 aa  194  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0307537  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.63 
 
 
332 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1563  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.23 
 
 
321 aa  188  1e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0231928  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.6 
 
 
321 aa  186  6e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0405  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.6 
 
 
321 aa  186  6e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0351  peptide ABC transporter, permease protein  35.15 
 
 
319 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.33 
 
 
331 aa  185  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0408  peptide ABC transporter, permease protein  35.15 
 
 
319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.599742  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.85 
 
 
321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181911  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.13 
 
 
322 aa  182  7e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.95 
 
 
319 aa  182  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.540957  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1766  peptide ABC transporter, permease protein  34.56 
 
 
321 aa  181  1e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5079  oligopeptide ABC transporter, permease protein  31.8 
 
 
318 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823719  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.45 
 
 
321 aa  181  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0206  oligopeptide ABC transporter, permease  31.5 
 
 
318 aa  179  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4683  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.08 
 
 
305 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.64 
 
 
321 aa  178  9e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0692911 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.83 
 
 
319 aa  178  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.72 
 
 
311 aa  178  1e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0210  oligopeptide ABC transporter, permease  32.14 
 
 
318 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0232  oligopeptide ABC transporter permease protein  32.14 
 
 
318 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0384  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
319 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.512992 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0249  oligopeptide ABC transporter, permease protein  32.14 
 
 
318 aa  177  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0267  oligopeptide ABC transporter, permease protein  31.52 
 
 
318 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0246  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
307 aa  177  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0542782  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4598  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.12 
 
 
319 aa  176  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.930375  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.63 
 
 
318 aa  176  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1620  peptide ABC transporter, permease protein  33.03 
 
 
321 aa  176  6e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.911317 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.93 
 
 
324 aa  175  9e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0219  oligopeptide ABC transporter permease  34.42 
 
 
307 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0242  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.42 
 
 
307 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1411  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.03 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.6 
 
 
321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000859188  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.45 
 
 
321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.16 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.981811  normal  0.0447006 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0982  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  33.02 
 
 
306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3500  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.12 
 
 
355 aa  173  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0791674  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.03 
 
 
321 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1434  peptide ABC transporter, permease protein  33.03 
 
 
326 aa  173  5e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393954  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.93 
 
 
322 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0569  oligopeptide ABC transporter, permease  31.53 
 
 
321 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00798  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  32.72 
 
 
306 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.72 
 
 
306 aa  171  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0726  oligopeptide ABC transporter, permease protein  31.23 
 
 
322 aa  171  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0787  oligopeptide ABC transporter, permease protein  31.23 
 
 
322 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0625  oligopeptide ABC transporter permease  31.23 
 
 
322 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0895389  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0856  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  32.72 
 
 
306 aa  171  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.72 
 
 
306 aa  171  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0658  oligopeptide ABC transporter permease protein  31.23 
 
 
322 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.975917  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0902  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  32.72 
 
 
306 aa  171  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.7 
 
 
309 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2554  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  32.93 
 
 
321 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0889  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  32.72 
 
 
306 aa  171  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.952014  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00815  hypothetical protein  32.72 
 
 
306 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.558182  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0715  oligopeptide ABC transporter, permease protein  31.23 
 
 
322 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000364541 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1275  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  31.29 
 
 
317 aa  170  2e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000495045  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0568  oligopeptide ABC transporter, permease  31.23 
 
 
322 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0951  glutathione ABC transporter permease  32.41 
 
 
306 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.258662  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2257  oligopeptide ABC transporter, permease component  32.93 
 
 
321 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.54 
 
 
306 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6122  normal  0.137292 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0980  glutathione ABC transporter permease  32.41 
 
 
306 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.12 
 
 
320 aa  170  3e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000461837  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.23 
 
 
306 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221048  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1613  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.61 
 
 
339 aa  169  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.97 
 
 
321 aa  169  5e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0918  inner membrane ABC transporter permease protein YddR  32.1 
 
 
306 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.64 
 
 
333 aa  169  5e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391976  normal  0.26803 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31 
 
 
320 aa  169  5e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000183272  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.28 
 
 
315 aa  169  7e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0891  glutathione ABC transporter, permease protein  32.1 
 
 
306 aa  169  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.976092  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1001  glutathione ABC transporter permease  32.1 
 
 
306 aa  169  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.58 
 
 
318 aa  168  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0511  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.43 
 
 
314 aa  168  1e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.42 
 
 
325 aa  168  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2517  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  32.41 
 
 
306 aa  167  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503163  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>