More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4430 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
325 aa  639    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.982552  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  86.46 
 
 
325 aa  569  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.161114  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3928  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  83.38 
 
 
325 aa  550  1e-155  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4002  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  83.38 
 
 
325 aa  550  1e-155  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3943  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  83.38 
 
 
325 aa  548  1e-155  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.104136 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11309  oligopeptide-transport integral membrane protein ABC transporter oppB  76.92 
 
 
325 aa  476  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1951  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.91 
 
 
325 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.497916  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.76 
 
 
326 aa  332  8e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.501197  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7099  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.45 
 
 
327 aa  317  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.6 
 
 
328 aa  311  7.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10217  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.12 
 
 
327 aa  271  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3278  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.23 
 
 
325 aa  261  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000912922  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08480  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  43.06 
 
 
344 aa  258  7e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1254  ABC transporter, permease protein  38.67 
 
 
327 aa  228  1e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000126232 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.33 
 
 
327 aa  225  9e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1117  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.51 
 
 
327 aa  224  1e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.559973  normal  0.0105879 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0920  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
330 aa  216  2.9999999999999998e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.311537 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1834  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.91 
 
 
326 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7778  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.46 
 
 
322 aa  216  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.413078 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0817  ABC peptide/nickel transport system permease protein  41.61 
 
 
336 aa  216  5e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4534  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.83 
 
 
336 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.463935 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31130  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  37.54 
 
 
338 aa  214  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1632  putative ABC transporter permease  39.82 
 
 
336 aa  206  6e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214794  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.26 
 
 
328 aa  204  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.34 
 
 
332 aa  199  7e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.37 
 
 
327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1411  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.35 
 
 
319 aa  191  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1563  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.98 
 
 
321 aa  189  4e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0231928  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0384  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.24 
 
 
319 aa  189  7e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.512992 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0405  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.23 
 
 
321 aa  188  1e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.23 
 
 
321 aa  188  1e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5079  oligopeptide ABC transporter, permease protein  32.42 
 
 
318 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823719  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0206  oligopeptide ABC transporter, permease  32.12 
 
 
318 aa  183  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4598  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.42 
 
 
319 aa  183  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.930375  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2554  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  33.84 
 
 
321 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2257  oligopeptide ABC transporter, permease component  33.84 
 
 
321 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0351  peptide ABC transporter, permease protein  33.63 
 
 
319 aa  181  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0408  peptide ABC transporter, permease protein  33.63 
 
 
319 aa  180  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.599742  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0569  oligopeptide ABC transporter, permease  33.84 
 
 
321 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0873  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.7 
 
 
320 aa  181  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0307537  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.23 
 
 
334 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.95 
 
 
324 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.93 
 
 
322 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1434  peptide ABC transporter, permease protein  34.66 
 
 
326 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393954  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.35 
 
 
321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181911  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0246  oligopeptide ABC transporter, permease protein  32.76 
 
 
307 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0542782  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0267  oligopeptide ABC transporter, permease protein  32.73 
 
 
318 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.06 
 
 
321 aa  178  1e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.33 
 
 
318 aa  177  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.96 
 
 
321 aa  178  1e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.1 
 
 
321 aa  178  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0249  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.23 
 
 
318 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0210  oligopeptide ABC transporter, permease  33.23 
 
 
318 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1766  peptide ABC transporter, permease protein  38.18 
 
 
321 aa  177  2e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0232  oligopeptide ABC transporter permease protein  33.23 
 
 
318 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0787  oligopeptide ABC transporter, permease protein  32.63 
 
 
322 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0726  oligopeptide ABC transporter, permease protein  32.63 
 
 
322 aa  176  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0625  oligopeptide ABC transporter permease  32.63 
 
 
322 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0895389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0658  oligopeptide ABC transporter permease protein  32.63 
 
 
322 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.975917  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0715  oligopeptide ABC transporter, permease protein  32.63 
 
 
322 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000364541 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.72 
 
 
319 aa  177  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.53 
 
 
320 aa  177  3e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000461837  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0568  oligopeptide ABC transporter, permease  32.63 
 
 
322 aa  176  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.05 
 
 
333 aa  176  5e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391976  normal  0.26803 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.52 
 
 
318 aa  176  6e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.15 
 
 
321 aa  176  7e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0692911 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.34 
 
 
331 aa  175  8e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1184  dipeptide ABC transporter, permease protein  32.44 
 
 
333 aa  175  8e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0134333  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1620  peptide ABC transporter, permease protein  35.53 
 
 
321 aa  175  9.999999999999999e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.911317 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.43 
 
 
322 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0219  oligopeptide ABC transporter permease  34.01 
 
 
307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1869  ABC-type transport system protein  34.05 
 
 
324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.76 
 
 
321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.793124  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.53 
 
 
334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0242  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.01 
 
 
307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3500  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.4 
 
 
355 aa  174  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0791674  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.63 
 
 
319 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.540957  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.93 
 
 
321 aa  172  9e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000859188  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0004  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.13 
 
 
320 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.101832  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.93 
 
 
332 aa  169  4e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00733957  hitchhiker  0.00049009 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.21 
 
 
336 aa  170  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0434  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.4 
 
 
358 aa  170  4e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0891876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.09 
 
 
364 aa  169  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
319 aa  169  6e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.981811  normal  0.0447006 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.82 
 
 
309 aa  169  7e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2322  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  32.11 
 
 
348 aa  169  7e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0982  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  34.25 
 
 
306 aa  169  7e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.13 
 
 
325 aa  169  8e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.04 
 
 
326 aa  169  8e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.05 
 
 
321 aa  168  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0759  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.52 
 
 
306 aa  167  2e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000961636  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
334 aa  167  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1343  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.45 
 
 
326 aa  167  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.545551 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.93 
 
 
336 aa  167  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.13 
 
 
326 aa  167  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.75386 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1275  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  31.27 
 
 
317 aa  167  2.9999999999999998e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000495045  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1613  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.53 
 
 
339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.23 
 
 
315 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000049983  normal  0.670386 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.94 
 
 
306 aa  166  4e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00815  hypothetical protein  33.94 
 
 
306 aa  166  4e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.558182  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>