More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1323 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1323  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
341 aa  674    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0238996  normal  0.501572 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.48 
 
 
343 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.12 
 
 
355 aa  261  1e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.4 
 
 
335 aa  238  1e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.905382  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.36 
 
 
353 aa  229  6e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.934161  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  36.94 
 
 
339 aa  223  3e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 
334 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.28 
 
 
320 aa  216  5e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000183272  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.47 
 
 
336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.721542  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0926  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.63 
 
 
335 aa  213  5.999999999999999e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0268081  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0163  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.73 
 
 
361 aa  212  7e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2348  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
338 aa  212  7e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.43 
 
 
306 aa  212  9e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.44 
 
 
335 aa  210  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.948745  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.33 
 
 
364 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1184  dipeptide ABC transporter, permease protein  33.93 
 
 
333 aa  209  4e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0134333  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 
336 aa  209  5e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0066  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.93 
 
 
334 aa  208  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.12 
 
 
334 aa  204  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0928  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.84 
 
 
347 aa  203  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2531  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.42 
 
 
335 aa  203  4e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.21 
 
 
321 aa  202  5e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1437  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.94 
 
 
326 aa  202  5e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.01 
 
 
347 aa  202  9e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.699223  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.71 
 
 
321 aa  201  9.999999999999999e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.59 
 
 
321 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0692911 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  35.01 
 
 
336 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1583  alkaline phosphatase  33.83 
 
 
335 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.354079  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1620  peptide ABC transporter, permease protein  35.8 
 
 
321 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.911317 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2045  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.71 
 
 
351 aa  199  3.9999999999999996e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100967  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.01 
 
 
336 aa  199  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1235  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.63 
 
 
341 aa  199  7e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1341  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.18 
 
 
352 aa  199  7.999999999999999e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.238943  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  34.73 
 
 
336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  34.43 
 
 
336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.04 
 
 
345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0169075  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  34.73 
 
 
336 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0408  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.07 
 
 
340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.449597  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.94 
 
 
335 aa  197  3e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0375099  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1527  nickel-transporting ATPase  35.5 
 
 
338 aa  197  3e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 
334 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0103751  normal  0.0395583 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2715  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.17 
 
 
383 aa  197  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1249  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.15 
 
 
352 aa  197  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0758  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.91 
 
 
338 aa  196  4.0000000000000005e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0353588 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0391  Nickel-transporting ATPase  34.55 
 
 
334 aa  196  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.941274  normal  0.201292 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58440  ABC transporter permease  34.12 
 
 
336 aa  196  6e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.514083  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.61 
 
 
334 aa  196  6e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000955673 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1766  peptide ABC transporter, permease protein  34.91 
 
 
321 aa  196  7e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.32 
 
 
306 aa  194  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000653909  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2357  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.63 
 
 
336 aa  194  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0452163  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.43 
 
 
336 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.43 
 
 
336 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0547  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.32 
 
 
306 aa  194  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.472252  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  33.23 
 
 
336 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.43 
 
 
319 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5350  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  31.58 
 
 
359 aa  194  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0131  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.49 
 
 
326 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0245  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.85 
 
 
339 aa  193  4e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.76239  normal  0.869294 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
334 aa  192  5e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_931  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  34.51 
 
 
305 aa  192  6e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.541229  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.13 
 
 
335 aa  192  6e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5117  ABC transporter permease  33.83 
 
 
336 aa  192  8e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.12 
 
 
332 aa  191  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  34.03 
 
 
337 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0942  nickel-transporting ATPase  34.51 
 
 
305 aa  191  1e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.541988  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4239  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.34 
 
 
336 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0349667  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.02 
 
 
321 aa  191  1e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0183  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  33.83 
 
 
336 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0196  peptide/opine/nickel ABC transporter inner membrane protein  35.74 
 
 
356 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0448682 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1905  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.15 
 
 
365 aa  191  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.074595  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  34.13 
 
 
336 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4119  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  30.68 
 
 
341 aa  191  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2054  peptide ABC transporter permease  35.13 
 
 
336 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0359637  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.23 
 
 
336 aa  191  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532586  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2204  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.49 
 
 
347 aa  191  2e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000400167 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3995  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.23 
 
 
325 aa  190  2.9999999999999997e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.65 
 
 
352 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0522734  normal  0.204601 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5358  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  33.04 
 
 
315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4562  dipeptide ABC transporter, permease protein  32.34 
 
 
336 aa  190  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0270  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.63 
 
 
321 aa  189  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.97 
 
 
332 aa  189  4e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.739242 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.06 
 
 
347 aa  189  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0789045  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
316 aa  189  5e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1081  peptide ABC transporter, permease protein  32.25 
 
 
337 aa  189  5.999999999999999e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.446829  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.84 
 
 
340 aa  189  5.999999999999999e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3887  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  32.82 
 
 
355 aa  189  5.999999999999999e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2947  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  32.54 
 
 
338 aa  189  7e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.728806  normal  0.808903 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.13 
 
 
338 aa  189  7e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0727691 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.44 
 
 
333 aa  188  9e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3774  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.9 
 
 
320 aa  188  9e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542684  normal  0.67395 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03394  dipeptide transporter  32.44 
 
 
339 aa  188  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3988  dipeptide transporter permease DppB  32.44 
 
 
339 aa  188  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03345  hypothetical protein  32.44 
 
 
339 aa  188  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4480  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.47 
 
 
356 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.598069 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0172  dipeptide transporter permease DppB  32.44 
 
 
339 aa  188  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  33.23 
 
 
336 aa  188  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4035  dipeptide transporter permease DppB  32.44 
 
 
339 aa  188  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.71 
 
 
315 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3862  dipeptide transporter permease DppB  32.44 
 
 
339 aa  188  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4911  dipeptide transporter permease DppB  32.44 
 
 
381 aa  188  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>