More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0428 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
343 aa  670    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1323  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.99 
 
 
341 aa  379  1e-104  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0238996  normal  0.501572 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.75 
 
 
355 aa  228  8e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.93 
 
 
353 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.934161  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2348  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.51 
 
 
338 aa  211  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  33.03 
 
 
339 aa  201  1.9999999999999998e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.31 
 
 
335 aa  200  3e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.905382  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.43 
 
 
320 aa  197  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000183272  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
334 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.84 
 
 
336 aa  192  7e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0089  dipeptide transporter permease DppB  33.33 
 
 
339 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297234  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4074  dipeptide transporter permease DppB  33.33 
 
 
339 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  35.93 
 
 
336 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  35.63 
 
 
336 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0139  dipeptide transporter permease DppB  32.65 
 
 
351 aa  189  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.33 
 
 
336 aa  189  7e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4097  dipeptide transporter permease DppB  33.33 
 
 
339 aa  189  9e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0926  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.74 
 
 
335 aa  188  9e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0268081  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  35.33 
 
 
336 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1184  dipeptide ABC transporter, permease protein  29.38 
 
 
333 aa  188  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0134333  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.16 
 
 
364 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0050  dipeptide transporter permease DppB  33.33 
 
 
339 aa  188  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0045  dipeptide transporter permease DppB  33.04 
 
 
339 aa  188  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03394  dipeptide transporter  32.45 
 
 
339 aa  187  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0169  Alkaline phosphatase  32.45 
 
 
339 aa  187  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3988  dipeptide transporter permease DppB  32.45 
 
 
339 aa  187  3e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3742  dipeptide transporter permease DppB  32.45 
 
 
339 aa  187  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0185  dipeptide transporter permease DppB  32.74 
 
 
339 aa  187  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.446355  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4035  dipeptide transporter permease DppB  32.45 
 
 
339 aa  187  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03345  hypothetical protein  32.45 
 
 
339 aa  187  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3862  dipeptide transporter permease DppB  32.45 
 
 
339 aa  187  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4911  dipeptide transporter permease DppB  32.45 
 
 
381 aa  187  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  35.03 
 
 
336 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0172  dipeptide transporter permease DppB  32.45 
 
 
339 aa  187  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0330  nickel-transporting ATPase  32.82 
 
 
334 aa  186  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3949  dipeptide transporter permease DppB  32.15 
 
 
339 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3841  dipeptide transporter permease DppB  32.15 
 
 
339 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3827  dipeptide transporter permease DppB  32.15 
 
 
339 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4009  dipeptide transporter permease DppB  32.15 
 
 
339 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3905  dipeptide transporter permease DppB  32.15 
 
 
339 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.73 
 
 
335 aa  186  6e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.948745  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  32.74 
 
 
339 aa  186  7e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3887  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  35.28 
 
 
355 aa  184  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2947  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  32.35 
 
 
338 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.728806  normal  0.808903 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.73 
 
 
336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.73 
 
 
336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0163  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.74 
 
 
361 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.14 
 
 
324 aa  184  3e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  32.63 
 
 
336 aa  183  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2054  peptide ABC transporter permease  34.57 
 
 
336 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0359637  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.23 
 
 
334 aa  182  6e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0717  putative dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter, permease protein  31.14 
 
 
337 aa  182  9.000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.529173  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.73 
 
 
332 aa  182  9.000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2357  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.25 
 
 
336 aa  181  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0452163  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  33.83 
 
 
336 aa  182  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0183  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  34.12 
 
 
336 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3370  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.03 
 
 
352 aa  182  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0408  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.33 
 
 
340 aa  181  2e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.449597  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1905  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 
365 aa  181  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.074595  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  33.83 
 
 
336 aa  180  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0928  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.04 
 
 
347 aa  179  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1879  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.56 
 
 
345 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.716973 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.37 
 
 
347 aa  179  5.999999999999999e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.699223  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0066  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.13 
 
 
334 aa  179  7e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.44 
 
 
336 aa  179  8e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.721542  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3866  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.82 
 
 
346 aa  179  9e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1235  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
341 aa  178  1e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.13 
 
 
338 aa  178  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0727691 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3964  hypothetical protein  31.83 
 
 
335 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.1929 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.23 
 
 
311 aa  177  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0812  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.34 
 
 
336 aa  177  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153061  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0547  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.24 
 
 
306 aa  177  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.472252  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.24 
 
 
306 aa  177  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000653909  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1081  peptide ABC transporter, permease protein  32.24 
 
 
337 aa  176  4e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.446829  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2531  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.03 
 
 
335 aa  176  5e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7019  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  32.73 
 
 
333 aa  176  6e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536293  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  33.43 
 
 
337 aa  176  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.37 
 
 
345 aa  176  7e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0169075  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4239  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.04 
 
 
336 aa  175  8e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0349667  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1583  alkaline phosphatase  31.64 
 
 
335 aa  175  9e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.354079  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5375  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  31.18 
 
 
342 aa  175  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.296899  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3776  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.46 
 
 
356 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.642947  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.46 
 
 
356 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00157663  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.74 
 
 
335 aa  175  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.04 
 
 
334 aa  174  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1530  dipeptide ABC transporter, permease protein  31.85 
 
 
335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.755182  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3026  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.43 
 
 
334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.44 
 
 
311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.13 
 
 
336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4562  dipeptide ABC transporter, permease protein  31.74 
 
 
336 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0480  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.04 
 
 
334 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00673258  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.12 
 
 
329 aa  173  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3851  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.93 
 
 
355 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4179  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.93 
 
 
355 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.800769  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.87 
 
 
356 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0210654  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4480  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.87 
 
 
356 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.598069 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3005  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.93 
 
 
325 aa  172  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.12 
 
 
332 aa  172  5e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.474892  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0391  Nickel-transporting ATPase  32.34 
 
 
334 aa  173  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.941274  normal  0.201292 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>