More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6302 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0196  peptide/opine/nickel ABC transporter inner membrane protein  93.54 
 
 
356 aa  651    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0448682 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
356 aa  703    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  86.8 
 
 
356 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  82.3 
 
 
356 aa  600  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.767005 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4480  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  82.02 
 
 
356 aa  592  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.598069 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1252  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  82.02 
 
 
356 aa  593  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.74 
 
 
356 aa  592  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0210654  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5713  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.46 
 
 
356 aa  587  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.076951 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3776  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.46 
 
 
356 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.642947  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.46 
 
 
356 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00157663  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2561  ABC transporter, permease protein  82.02 
 
 
356 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1049  ABC transporter, permease protein  82.3 
 
 
356 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1391  ABC transporter, permease protein  82.3 
 
 
356 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0350688  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1310  ABC transporter, permease protein  82.3 
 
 
356 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38015  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0248  ABC transporter, permease protein  82.3 
 
 
356 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0519  ABC transporter, permease protein  82.3 
 
 
356 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.872577  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1443  ABC transporter, permease protein  84.55 
 
 
330 aa  568  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1275  ABC transporter, permease protein  84.52 
 
 
336 aa  559  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.572487  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  78.37 
 
 
356 aa  545  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.8 
 
 
352 aa  426  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0522734  normal  0.204601 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1249  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.77 
 
 
352 aa  425  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3866  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.73 
 
 
346 aa  420  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3370  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.12 
 
 
352 aa  413  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2715  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.62 
 
 
383 aa  414  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4179  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.22 
 
 
355 aa  408  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.800769  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3851  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.22 
 
 
355 aa  408  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.42 
 
 
346 aa  408  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2045  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.86 
 
 
351 aa  407  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100967  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0373  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.04 
 
 
356 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.112359  normal  0.427552 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3887  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  60.19 
 
 
355 aa  403  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.49 
 
 
347 aa  402  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0789045  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.83 
 
 
364 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1905  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.58 
 
 
365 aa  395  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.074595  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1879  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.74 
 
 
345 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.716973 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.48 
 
 
356 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0806  ABC dipeptide transporter, inner membrane subunit DppB  60.18 
 
 
356 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.557497  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3536  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.22 
 
 
355 aa  387  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.857231 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2705  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.23 
 
 
345 aa  387  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3249  dipeptide ABC transporter, permease protein DppB, putative  63.11 
 
 
345 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0957202  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.53 
 
 
358 aa  374  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1918  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  56.06 
 
 
333 aa  368  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1693  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.57 
 
 
342 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162218  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1879  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.57 
 
 
342 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.240236  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1029  dipeptide ABC transporter, permease protein  52.01 
 
 
357 aa  363  3e-99  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.234633  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3199  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.56 
 
 
369 aa  359  3e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.166157  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.59 
 
 
336 aa  356  3.9999999999999996e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.61 
 
 
365 aa  355  5e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285903  normal  0.173747 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5441  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.93 
 
 
364 aa  349  5e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.582701  hitchhiker  0.00744073 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.34 
 
 
336 aa  347  2e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3740  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.32 
 
 
337 aa  342  5.999999999999999e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0800  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  60.12 
 
 
356 aa  332  5e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3384  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.61 
 
 
360 aa  331  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.245336 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2057  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.69 
 
 
352 aa  311  1e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.239018  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4039  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter permease  48.06 
 
 
349 aa  304  1.0000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3687  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.06 
 
 
349 aa  304  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3552  ABC dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, permease protein  48.06 
 
 
349 aa  304  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.52 
 
 
340 aa  300  2e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.33 
 
 
350 aa  300  3e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1759  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.5 
 
 
347 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.91 
 
 
346 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0835992  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2348  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.74 
 
 
338 aa  273  3e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.94 
 
 
335 aa  272  6e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.948745  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.03 
 
 
334 aa  269  5e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.15 
 
 
336 aa  259  6e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0717  putative dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter, permease protein  44.65 
 
 
337 aa  258  8e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.529173  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  43.93 
 
 
336 aa  257  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2054  peptide ABC transporter permease  43.21 
 
 
336 aa  256  6e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0359637  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.17 
 
 
338 aa  256  6e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0727691 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2357  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.99 
 
 
336 aa  255  8e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0452163  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.61 
 
 
337 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.298379  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.16 
 
 
364 aa  255  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0066  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.09 
 
 
334 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4050  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.37 
 
 
337 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.208624  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1184  dipeptide ABC transporter, permease protein  40.61 
 
 
333 aa  252  7e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0134333  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.85 
 
 
337 aa  249  6e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.678107  normal  0.316578 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.85 
 
 
334 aa  248  1e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  39.39 
 
 
339 aa  248  2e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.3 
 
 
336 aa  246  4e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532586  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.22 
 
 
334 aa  246  4e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000955673 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.65 
 
 
333 aa  245  9e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000322853  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01444  D-ala-D-ala transporter subunit  45.34 
 
 
340 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.982069  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2161  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.34 
 
 
340 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0198405  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1081  peptide ABC transporter, permease protein  40.75 
 
 
337 aa  245  9.999999999999999e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.446829  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2171  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.34 
 
 
340 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1675  inner membrane ABC transporter permease protein yddR  45.34 
 
 
340 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.925292  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.72 
 
 
334 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.186843  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01456  hypothetical protein  45.34 
 
 
340 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2098  inner membrane ABC transporter permease protein yddR  45.34 
 
 
340 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2531  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.26 
 
 
335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.79 
 
 
336 aa  243  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1583  alkaline phosphatase  40 
 
 
335 aa  243  3e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.354079  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1530  dipeptide ABC transporter, permease protein  40.43 
 
 
335 aa  243  3e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.755182  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1585  dipeptide ABC transporter, permease protein  40.43 
 
 
335 aa  243  5e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.280526  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2419  ABC transporter D-Ala-D-Ala-binding inner membrane protein  37.91 
 
 
341 aa  242  6e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.279427  hitchhiker  0.0000166625 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1571  inner membrane ABC transporter permease protein yddR  45.03 
 
 
340 aa  242  7.999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1687  inner membrane ABC transporter permease protein yddR  45.03 
 
 
340 aa  242  7.999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.930254  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0926  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.85 
 
 
335 aa  241  1e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0268081  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  42.47 
 
 
337 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1691  alkaline phosphatase  41.19 
 
 
336 aa  241  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.48 
 
 
335 aa  241  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.851486 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>