More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3830 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_3830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
364 aa  715    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1905  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.7 
 
 
365 aa  526  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.074595  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  77.27 
 
 
347 aa  526  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0789045  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4179  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.65 
 
 
355 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.800769  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3851  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.95 
 
 
355 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3887  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  69.55 
 
 
355 aa  511  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0373  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.81 
 
 
356 aa  455  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.112359  normal  0.427552 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0806  ABC dipeptide transporter, inner membrane subunit DppB  68.92 
 
 
356 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.557497  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.92 
 
 
356 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2715  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.6 
 
 
383 aa  424  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4480  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.59 
 
 
356 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.598069 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.28 
 
 
356 aa  418  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0210654  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1252  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  60.98 
 
 
356 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1443  ABC transporter, permease protein  60.67 
 
 
330 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3776  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.84 
 
 
356 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.642947  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5713  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.67 
 
 
356 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.076951 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.84 
 
 
356 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00157663  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.97 
 
 
356 aa  412  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1049  ABC transporter, permease protein  58.84 
 
 
356 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2561  ABC transporter, permease protein  58.84 
 
 
356 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0519  ABC transporter, permease protein  58.84 
 
 
356 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.872577  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.37 
 
 
356 aa  410  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.767005 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1310  ABC transporter, permease protein  58.84 
 
 
356 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38015  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1391  ABC transporter, permease protein  58.84 
 
 
356 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0350688  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0248  ABC transporter, permease protein  58.84 
 
 
356 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1275  ABC transporter, permease protein  60.98 
 
 
336 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.572487  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.42 
 
 
352 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0522734  normal  0.204601 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3866  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.77 
 
 
346 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1249  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.94 
 
 
352 aa  405  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.83 
 
 
356 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3370  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.36 
 
 
352 aa  404  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58 
 
 
356 aa  403  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0196  peptide/opine/nickel ABC transporter inner membrane protein  58.09 
 
 
356 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0448682 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1029  dipeptide ABC transporter, permease protein  52.38 
 
 
357 aa  398  9.999999999999999e-111  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.234633  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2045  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.09 
 
 
351 aa  396  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100967  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.06 
 
 
346 aa  395  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1918  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  60.66 
 
 
333 aa  388  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.2 
 
 
358 aa  389  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3740  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.51 
 
 
337 aa  385  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1879  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.49 
 
 
345 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.716973 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.25 
 
 
336 aa  387  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3536  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.52 
 
 
355 aa  387  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.857231 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2705  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.72 
 
 
345 aa  384  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.58 
 
 
336 aa  379  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3199  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.6 
 
 
369 aa  379  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.166157  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1879  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.55 
 
 
342 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.240236  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1693  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.85 
 
 
342 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162218  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3249  dipeptide ABC transporter, permease protein DppB, putative  58.58 
 
 
345 aa  363  2e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0957202  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.37 
 
 
365 aa  358  8e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285903  normal  0.173747 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5441  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.69 
 
 
364 aa  354  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.582701  hitchhiker  0.00744073 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0800  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  59.42 
 
 
356 aa  347  2e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3384  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.71 
 
 
360 aa  323  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.245336 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3687  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.1 
 
 
349 aa  309  5e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3552  ABC dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, permease protein  48.1 
 
 
349 aa  309  5e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4039  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter permease  48.1 
 
 
349 aa  309  5e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2057  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.92 
 
 
352 aa  305  1.0000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.239018  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.55 
 
 
340 aa  300  2e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.01 
 
 
350 aa  291  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  45.02 
 
 
336 aa  283  3.0000000000000004e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.37 
 
 
334 aa  281  2e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1184  dipeptide ABC transporter, permease protein  41.44 
 
 
333 aa  280  3e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0134333  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2054  peptide ABC transporter permease  45.17 
 
 
336 aa  279  7e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0359637  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2348  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.86 
 
 
338 aa  277  2e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0066  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.38 
 
 
334 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.23 
 
 
346 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0835992  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  45.17 
 
 
336 aa  271  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0391  Nickel-transporting ATPase  42.3 
 
 
334 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.941274  normal  0.201292 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.6 
 
 
334 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0103751  normal  0.0395583 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.5 
 
 
334 aa  270  2.9999999999999997e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.34 
 
 
336 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1759  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.23 
 
 
347 aa  267  2e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.34 
 
 
336 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  45.17 
 
 
336 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4562  dipeptide ABC transporter, permease protein  44.27 
 
 
336 aa  266  5e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2357  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.99 
 
 
336 aa  266  5e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0452163  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.81 
 
 
336 aa  266  5e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532586  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0330  nickel-transporting ATPase  42.6 
 
 
334 aa  266  5.999999999999999e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0840  alkaline phosphatase  44.64 
 
 
336 aa  265  8e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0183  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  44.86 
 
 
336 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.75 
 
 
364 aa  265  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.71 
 
 
338 aa  265  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0727691 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4239  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.65 
 
 
336 aa  263  3e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0349667  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.28 
 
 
334 aa  263  3e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.186843  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2531  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.6 
 
 
335 aa  263  3e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  43.93 
 
 
336 aa  263  4e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0812  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.64 
 
 
336 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153061  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  43.93 
 
 
336 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0881  alkaline phosphatase  42.86 
 
 
336 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0920  alkaline phosphatase  42.86 
 
 
336 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745476  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1691  alkaline phosphatase  42.64 
 
 
336 aa  262  8.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4297  alkaline phosphatase  42.86 
 
 
336 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.259448  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  43.64 
 
 
337 aa  261  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  43.93 
 
 
336 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0257  dipeptide ABC transporter, permease protein DppB  46.11 
 
 
336 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0183254  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0438  dipeptide ABC transporter, permease protein  46.11 
 
 
336 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.287178  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5117  ABC transporter permease  42.56 
 
 
336 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2120  dipeptide ABC transporter, permease protein  45.51 
 
 
338 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.192679  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0244  dipeptide ABC transporter, permease protein DppB  46.11 
 
 
336 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.93 
 
 
336 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.09 
 
 
335 aa  261  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.851486 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>