More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0390 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 336 aa  662    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.721542  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2348  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.05 
 
 		 338 aa  286  5e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.75 
 
 		 336 aa  276  5e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4050  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.18 
 
 		 337 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.208624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1341  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.16 
 
 		 352 aa  268  7e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.238943  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.37 
 
 		 334 aa  267  2e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2947  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  41.96 
 
 		 338 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.728806  normal  0.808903 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0717  putative dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter, permease protein  40.41 
 
 		 337 aa  265  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.529173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  40.77 
 
 		 339 aa  263  3e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1184  dipeptide ABC transporter, permease protein  38.69 
 
 		 333 aa  262  4.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0134333  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.77 
 
 		 333 aa  262  4.999999999999999e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.25 
 
 		 338 aa  262  6.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0727691 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1687  inner membrane ABC transporter permease protein yddR  44.41 
 
 		 340 aa  260  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.930254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.3 
 
 		 337 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.298379  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01444  D-ala-D-ala transporter subunit  44.09 
 
 		 340 aa  258  8e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.982069  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2161  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.09 
 
 		 340 aa  258  8e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0198405  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2171  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.09 
 
 		 340 aa  258  8e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01456  hypothetical protein  44.09 
 
 		 340 aa  258  8e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2098  inner membrane ABC transporter permease protein yddR  44.09 
 
 		 340 aa  258  8e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1675  inner membrane ABC transporter permease protein yddR  44.09 
 
 		 340 aa  258  8e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.925292  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1571  inner membrane ABC transporter permease protein yddR  44.09 
 
 		 340 aa  257  2e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.84 
 
 		 334 aa  253  4.0000000000000004e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.43 
 
 		 335 aa  253  5.000000000000001e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.905382  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1249  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.27 
 
 		 352 aa  252  8.000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.71 
 
 		 337 aa  251  9.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.678107  normal  0.316578 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.32 
 
 		 334 aa  250  2e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000955673 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2054  peptide ABC transporter permease  38.58 
 
 		 336 aa  247  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0359637  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1918  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.18 
 
 		 333 aa  247  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2715  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.87 
 
 		 383 aa  247  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.36 
 
 		 336 aa  246  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0928  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.19 
 
 		 347 aa  246  4e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5117  ABC transporter permease  40.06 
 
 		 336 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2419  ABC transporter D-Ala-D-Ala-binding inner membrane protein  38.69 
 
 		 341 aa  242  7e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.279427  hitchhiker  0.0000166625 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  39.05 
 
 		 337 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.29 
 
 		 335 aa  241  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.948745  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3887  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  39.88 
 
 		 355 aa  241  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  37.39 
 
 		 336 aa  240  2e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.28 
 
 		 352 aa  241  2e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0522734  normal  0.204601 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3199  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.96 
 
 		 369 aa  240  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.166157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.39 
 
 		 334 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1691  alkaline phosphatase  39.17 
 
 		 336 aa  239  5e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1905  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.62 
 
 		 365 aa  239  5.999999999999999e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.074595  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.77 
 
 		 345 aa  239  6.999999999999999e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.16813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2045  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 		 351 aa  238  9e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  38.28 
 
 		 339 aa  238  1e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.76 
 
 		 335 aa  238  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4239  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.87 
 
 		 336 aa  236  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0349667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0066  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.58 
 
 		 334 aa  237  3e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.69 
 
 		 335 aa  236  3e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0375099  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0881  alkaline phosphatase  38.87 
 
 		 336 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  37.39 
 
 		 336 aa  236  6e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0920  alkaline phosphatase  38.87 
 
 		 336 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745476  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0139  dipeptide transporter permease DppB  38.58 
 
 		 351 aa  236  6e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4297  alkaline phosphatase  38.87 
 
 		 336 aa  235  6e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.259448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3851  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 		 355 aa  236  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1782  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.69 
 
 		 335 aa  235  7e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00282517  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0924  alkaline phosphatase  38.58 
 
 		 336 aa  235  8e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4562  dipeptide ABC transporter, permease protein  38.28 
 
 		 336 aa  235  9e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5375  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  37.65 
 
 		 342 aa  234  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.296899  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.84 
 
 		 332 aa  233  2.0000000000000002e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2705  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.76 
 
 		 345 aa  234  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0183  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  37.39 
 
 		 336 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.69 
 
 		 335 aa  234  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  37.09 
 
 		 336 aa  233  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4179  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.69 
 
 		 355 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.800769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0926  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.87 
 
 		 335 aa  233  4.0000000000000004e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0268081  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.61 
 
 		 364 aa  233  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  37.39 
 
 		 336 aa  233  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0163  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.72 
 
 		 361 aa  232  6e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0196  peptide/opine/nickel ABC transporter inner membrane protein  39.2 
 
 		 356 aa  232  6e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0448682 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3905  dipeptide transporter permease DppB  38.24 
 
 		 339 aa  232  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3841  dipeptide transporter permease DppB  38.24 
 
 		 339 aa  232  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4009  dipeptide transporter permease DppB  38.24 
 
 		 339 aa  232  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3949  dipeptide transporter permease DppB  38.24 
 
 		 339 aa  232  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3827  dipeptide transporter permease DppB  38.24 
 
 		 339 aa  232  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.06 
 
 		 347 aa  232  8.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0789045  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4097  dipeptide transporter permease DppB  37.69 
 
 		 339 aa  232  9e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0812  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.98 
 
 		 336 aa  232  9e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153061  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  37.09 
 
 		 336 aa  232  9e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.44 
 
 		 356 aa  232  9e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0089  dipeptide transporter permease DppB  37.98 
 
 		 339 aa  231  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297234  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0045  dipeptide transporter permease DppB  38.87 
 
 		 339 aa  231  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.69 
 
 		 329 aa  231  1e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58440  ABC transporter permease  39.17 
 
 		 336 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.514083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4074  dipeptide transporter permease DppB  37.98 
 
 		 339 aa  231  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  37.09 
 
 		 336 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03394  dipeptide transporter  38.24 
 
 		 339 aa  231  2e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0169  Alkaline phosphatase  38.24 
 
 		 339 aa  231  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4035  dipeptide transporter permease DppB  38.24 
 
 		 339 aa  231  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3742  dipeptide transporter permease DppB  38.24 
 
 		 339 aa  231  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3988  dipeptide transporter permease DppB  38.24 
 
 		 339 aa  231  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0172  dipeptide transporter permease DppB  38.24 
 
 		 339 aa  231  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03345  hypothetical protein  38.24 
 
 		 339 aa  231  2e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.09 
 
 		 336 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3862  dipeptide transporter permease DppB  38.24 
 
 		 339 aa  231  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.02 
 
 		 336 aa  230  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0050  dipeptide transporter permease DppB  38.87 
 
 		 339 aa  230  3e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.09 
 
 		 334 aa  230  3e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.186843  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.27 
 
 		 356 aa  230  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4911  dipeptide transporter permease DppB  38.24 
 
 		 381 aa  230  3e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>