112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4964 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4964  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  386  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.482582 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9083  peroxidase family protein  65.92 
 
 
186 aa  227  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8777  peroxidase family protein  62.3 
 
 
186 aa  221  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3875  peroxidase family protein  58.19 
 
 
184 aa  207  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0496445 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4562  uncharacterized peroxidase-related enzyme  64 
 
 
185 aa  206  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9085  hypothetical protein  61.24 
 
 
231 aa  204  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4078  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  56.84 
 
 
191 aa  200  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.201946  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6383  Carboxymuconolactone decarboxylase  53.59 
 
 
194 aa  191  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.417481  decreased coverage  0.00344136 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6526  uncharacterized peroxidase-related enzyme  55.06 
 
 
186 aa  181  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00474121  normal  0.101119 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0066  hypothetical protein  28.74 
 
 
321 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4745  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.94 
 
 
192 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3407  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.28 
 
 
192 aa  60.8  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4522  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.85 
 
 
217 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.61443  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5460  hypothetical protein  27.94 
 
 
192 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5402  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.94 
 
 
192 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092423 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3355  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.94 
 
 
192 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0563256 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3260  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.47 
 
 
210 aa  58.9  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737438  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5290  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.21 
 
 
192 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.523649 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3885  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.33 
 
 
369 aa  57.8  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0113459  normal  0.656811 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3669  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.85 
 
 
216 aa  57.8  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3158  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.33 
 
 
369 aa  57.8  0.00000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4868  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.21 
 
 
192 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.405716  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1714  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.92 
 
 
214 aa  56.6  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1447  hypothetical protein  31.21 
 
 
199 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218618  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  25.74 
 
 
192 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2115  hypothetical protein  28.1 
 
 
192 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433121  normal  0.170797 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4592  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.35 
 
 
192 aa  56.2  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1446  hypothetical protein  32.56 
 
 
195 aa  55.5  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.885296  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1573  hypothetical protein  24.85 
 
 
214 aa  55.1  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0640101 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0194  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.92 
 
 
202 aa  55.1  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1433  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.86 
 
 
212 aa  54.7  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5135  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.68 
 
 
189 aa  54.7  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3877  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.24 
 
 
200 aa  54.3  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.42439  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4271  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.16 
 
 
192 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0429275  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7169  hypothetical protein  31.03 
 
 
200 aa  53.9  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.360229  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  26.47 
 
 
192 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0091  alkylhydroperoxidase-related  33.83 
 
 
191 aa  53.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336937  normal  0.314057 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4506  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.5 
 
 
398 aa  53.5  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.256167 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1476  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.41 
 
 
205 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.399629  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3349  alkylhydroperoxidase  26.92 
 
 
201 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal  0.0410777 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1371  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.41 
 
 
207 aa  52.4  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2585  hypothetical protein  35.29 
 
 
208 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2630  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.29 
 
 
208 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544935  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2624  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.29 
 
 
208 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19737  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0121  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.56 
 
 
191 aa  52  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.464175  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2539  uncharacterized peroxidase  32.19 
 
 
197 aa  51.6  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8682  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.17 
 
 
192 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.74 
 
 
192 aa  51.6  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2759  hypothetical protein  27.21 
 
 
201 aa  50.4  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1888  hypothetical protein  31.97 
 
 
197 aa  50.1  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0113894  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2465  hypothetical protein  24.26 
 
 
190 aa  50.4  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2532  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.54 
 
 
228 aa  50.1  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.872008  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1633  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.21 
 
 
194 aa  50.1  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2695  peroxidase-like  31.39 
 
 
202 aa  49.3  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.500229 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3017  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.07 
 
 
209 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.271489  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.8 
 
 
179 aa  49.3  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.218919  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6841  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.66 
 
 
192 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2093  hypothetical protein  25.18 
 
 
201 aa  48.9  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.868254 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.57 
 
 
176 aa  48.5  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5106  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.58 
 
 
196 aa  48.5  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.153962 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1186  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.85 
 
 
192 aa  48.5  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0419  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.79 
 
 
204 aa  48.1  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5313  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.82 
 
 
197 aa  48.1  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.21 
 
 
180 aa  47.8  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2827  peroxidase-like  27.34 
 
 
191 aa  47.4  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00537954  normal  0.0498212 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3962  peroxidase-like  28.92 
 
 
191 aa  47.4  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.466457  normal  0.338877 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0531  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.56 
 
 
386 aa  47.4  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.482172  hitchhiker  0.0000452351 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0195  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.04 
 
 
178 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2816  alkylhydroperoxidase AhpD domain protein  29.71 
 
 
196 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0335697  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2723  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.42 
 
 
189 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.114348  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1446  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25 
 
 
235 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3152  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.9 
 
 
372 aa  47  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.93611 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3525  hypothetical protein  25 
 
 
194 aa  46.2  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4098  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.59 
 
 
211 aa  46.2  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4848  hypothetical protein  31.91 
 
 
202 aa  45.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.645989 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2396  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.57 
 
 
199 aa  45.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.692596  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2001  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.8 
 
 
198 aa  45.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.153933  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.5 
 
 
176 aa  45.4  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3071  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.32 
 
 
192 aa  45.4  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000318179  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  32.82 
 
 
172 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0026  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.62 
 
 
371 aa  45.4  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3579  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.06 
 
 
197 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.95961  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1956  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.2 
 
 
193 aa  45.1  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3197  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.26 
 
 
202 aa  45.1  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1757  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.2 
 
 
193 aa  45.1  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7158  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.85 
 
 
178 aa  45.1  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0820  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.01 
 
 
196 aa  44.7  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4461  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.86 
 
 
377 aa  44.7  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2199  hypothetical protein  27.2 
 
 
201 aa  44.3  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2532  alkylhydroperoxidase AhpD core  24.32 
 
 
196 aa  43.9  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  24.32 
 
 
202 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3941  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.06 
 
 
197 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0161606  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2089  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.78 
 
 
196 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.673257 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2199  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.18 
 
 
195 aa  44.3  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1766  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.66 
 
 
196 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.472183 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4179  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.86 
 
 
377 aa  44.3  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  31.97 
 
 
172 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2999  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.52 
 
 
196 aa  43.5  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.97 
 
 
172 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4285  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.43 
 
 
207 aa  43.5  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>