192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3234 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3234  putative two-component system sensor kinase  100 
 
 		 226 aa  441  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.499066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4685  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 		 467 aa  89.7  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 		 394 aa  86.7  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4118  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  36.41 
 
 		 376 aa  85.5  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 		 405 aa  83.2  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  39.39 
 
 		 442 aa  82.8  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  33.49 
 
 		 381 aa  82.4  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4509  Histidine kinase  33.93 
 
 		 380 aa  81.6  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  34.25 
 
 		 408 aa  80.5  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  39.71 
 
 		 393 aa  78.6  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 		 496 aa  77.8  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 		 403 aa  77  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3388  histidine kinase  48.81 
 
 		 402 aa  76.6  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000377733  hitchhiker  0.000242442 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  46.51 
 
 		 380 aa  75.9  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2538  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 		 396 aa  73.2  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3749  histidine kinase  45.1 
 
 		 393 aa  72.4  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1617  histidine kinase  53.42 
 
 		 391 aa  70.1  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  43.18 
 
 		 380 aa  70.5  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19750  signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 		 406 aa  68.2  0.00000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7159  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  42.97 
 
 		 414 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.24 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  45.21 
 
 		 421 aa  62.8  0.000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6510  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 		 513 aa  62  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.12601 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  46.67 
 
 		 428 aa  62  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6964  histidine kinase  45.57 
 
 		 399 aa  61.6  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.198128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  30.65 
 
 		 442 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1510  histidine kinase  32.12 
 
 		 378 aa  59.7  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0382398 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  36.19 
 
 		 397 aa  59.7  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0550  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.35 
 
 		 382 aa  59.7  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1615  histidine kinase  44.07 
 
 		 407 aa  59.7  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0650745  normal  0.0536208 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.5 
 
 		 433 aa  58.5  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509321 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2014  histidine kinase  52.94 
 
 		 387 aa  58.5  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0305  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  51.02 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.692518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  33.5 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03364  sensor histidine kinase, putative  30.41 
 
 		 422 aa  57.8  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  35.79 
 
 		 395 aa  57  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 444 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7116  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 388 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2600  histidine kinase  37.5 
 
 		 489 aa  57  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.536606  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5618  Signal transduction histidine kinase-like protein  60.42 
 
 		 431 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180285  normal  0.667529 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  49.33 
 
 		 428 aa  56.2  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.19 
 
 		 438 aa  56.6  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.621089  normal  0.0286843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  44.87 
 
 		 399 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 		 398 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5720  histidine kinase  32.58 
 
 		 439 aa  55.5  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  50 
 
 		 443 aa  55.1  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  29.74 
 
 		 438 aa  55.1  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  38.46 
 
 		 384 aa  54.7  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 445 aa  54.7  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0107718  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1286  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 		 392 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000249738  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  37.78 
 
 		 420 aa  54.7  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3391  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 445 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0809012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  35.38 
 
 		 430 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  31.47 
 
 		 395 aa  53.9  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6695  two component LuxR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 398 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1732  histidine kinase  29.91 
 
 		 387 aa  53.9  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.424058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6093  histidine kinase  39.08 
 
 		 443 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0999956 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  40.43 
 
 		 406 aa  53.1  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  56.41 
 
 		 393 aa  53.5  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000329191  unclonable  0.0000000414728 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  56.25 
 
 		 372 aa  53.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  35.16 
 
 		 433 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0748  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 		 393 aa  52.8  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.279755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8899  histidine kinase  35.48 
 
 		 455 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  43.75 
 
 		 441 aa  52.8  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  35.53 
 
 		 400 aa  52.4  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  45.45 
 
 		 423 aa  52.4  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1050  histidine kinase  35.8 
 
 		 421 aa  51.6  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5402  Signal transduction histidine kinase-like protein  46.15 
 
 		 408 aa  51.6  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  0.894433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0762  histidine kinase  33.14 
 
 		 437 aa  51.6  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.332583 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5264  histidine kinase  44.26 
 
 		 376 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  56.82 
 
 		 401 aa  51.2  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33000  signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 411 aa  51.2  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.250015 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  39.78 
 
 		 478 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1721  histidine kinase  38.18 
 
 		 399 aa  50.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  42.47 
 
 		 392 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1242  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.81 
 
 		 392 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000812126  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.81 
 
 		 420 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.420367  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36940  signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 441 aa  50.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  47.54 
 
 		 367 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4261  histidine kinase  37.63 
 
 		 429 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2657  histidine kinase  40 
 
 		 426 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1223  putative signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 		 386 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2803  histidine kinase  35 
 
 		 422 aa  50.1  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0103  histidine kinase  53.66 
 
 		 393 aa  50.1  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.105504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.02 
 
 		 360 aa  50.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207944  normal  0.109837 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2473  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 391 aa  49.7  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0506045  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2731  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  29.24 
 
 		 367 aa  49.7  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.810003  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0607  histidine kinase  30.21 
 
 		 434 aa  49.7  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7842  histidine kinase  36.75 
 
 		 402 aa  49.3  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.209529 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5480  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.68 
 
 		 404 aa  48.9  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.500623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2487  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  47.92 
 
 		 412 aa  48.9  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 		 394 aa  48.9  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2659  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.07 
 
 		 453 aa  48.9  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8244  Signal transduction histidine kinase-like protein  44.78 
 
 		 357 aa  48.5  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.249642 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 424 aa  48.5  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1320  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.97 
 
 		 387 aa  48.5  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0173853  decreased coverage  0.000998378 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  38.3 
 
 		 430 aa  48.5  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0310  hypothetical protein  25.27 
 
 		 361 aa  48.1  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.720618  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06330  signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 		 399 aa  47.8  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1152  putative signal transduction histidine kinase  26.99 
 
 		 386 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>