More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2600 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2600  histidine kinase  100 
 
 		 489 aa  920    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.536606  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  47.55 
 
 		 420 aa  384  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.12 
 
 		 445 aa  328  9e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0107718  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 		 420 aa  215  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.420367  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  44.8 
 
 		 422 aa  194  4e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1747  Histidine kinase  38 
 
 		 384 aa  186  9e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  36.92 
 
 		 407 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  57.8 
 
 		 423 aa  182  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5720  histidine kinase  33.75 
 
 		 439 aa  179  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21890  histidine kinase  37.05 
 
 		 473 aa  175  9.999999999999999e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000762776  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.61 
 
 		 394 aa  160  5e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  47.2 
 
 		 397 aa  155  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  32.75 
 
 		 405 aa  154  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  34.96 
 
 		 428 aa  150  5e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  43.18 
 
 		 441 aa  144  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.53 
 
 		 424 aa  134  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  53.85 
 
 		 410 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0396  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 		 424 aa  127  6e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0856  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  56.15 
 
 		 500 aa  125  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972142  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  50.35 
 
 		 408 aa  125  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  42.61 
 
 		 417 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  29.37 
 
 		 378 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0200  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.63 
 
 		 424 aa  121  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  33.73 
 
 		 372 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  27.97 
 
 		 433 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  31.44 
 
 		 395 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6695  two component LuxR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 398 aa  118  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 		 416 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 		 403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7842  histidine kinase  32.06 
 
 		 402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.209529 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4008  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 		 524 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00577691  normal  0.384071 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  46.67 
 
 		 395 aa  113  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1050  histidine kinase  37.76 
 
 		 421 aa  113  6e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5877  histidine kinase  33.22 
 
 		 419 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36940  signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 		 441 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8413  histidine kinase  44.62 
 
 		 447 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2680  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.95 
 
 		 271 aa  110  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.913052 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.63 
 
 		 394 aa  108  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3027  histidine kinase  52.34 
 
 		 449 aa  107  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.256047  decreased coverage  0.0000413704 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0670  signal transduction histidine kinase  28.29 
 
 		 869 aa  107  4e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.965003  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6510  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 513 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.12601 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  40.27 
 
 		 402 aa  103  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  30.5 
 
 		 428 aa  103  9e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.71 
 
 		 430 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  44.53 
 
 		 408 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6093  histidine kinase  49.19 
 
 		 443 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0999956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  50.39 
 
 		 367 aa  101  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  41.5 
 
 		 443 aa  100  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  41.22 
 
 		 399 aa  100  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.33 
 
 		 406 aa  100  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3252  putative two-component system sensor kinase  44.67 
 
 		 372 aa  99.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1602  histidine kinase  28.46 
 
 		 425 aa  99.8  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0369038 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4576  histidine kinase  39.13 
 
 		 394 aa  99  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312812  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1884  histidine kinase  31.72 
 
 		 383 aa  99  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0784201 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  45.38 
 
 		 392 aa  98.6  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  42.86 
 
 		 400 aa  97.4  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4114  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.24 
 
 		 386 aa  96.7  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2513  histidine kinase  26.08 
 
 		 424 aa  96.7  9e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0276657  normal  0.73288 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  31.71 
 
 		 457 aa  96.3  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  43.08 
 
 		 441 aa  95.9  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  42.86 
 
 		 399 aa  95.5  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0645  histidine kinase  46.32 
 
 		 849 aa  95.9  2e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.386333 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6964  histidine kinase  43.75 
 
 		 399 aa  94.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.198128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4052  histidine kinase  44.62 
 
 		 385 aa  94.7  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0454325  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  34.2 
 
 		 462 aa  94  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2014  histidine kinase  27.89 
 
 		 387 aa  92.8  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.41 
 
 		 379 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  44.29 
 
 		 388 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3039  histidine kinase  48.06 
 
 		 376 aa  92.4  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0758324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4901  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  42.34 
 
 		 383 aa  91.7  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.316421  normal  0.344545 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.9 
 
 		 398 aa  90.5  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  40 
 
 		 442 aa  90.1  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  40.85 
 
 		 369 aa  89.4  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1301  histidine kinase  50.98 
 
 		 389 aa  89.7  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.370703  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.88 
 
 		 439 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  38.81 
 
 		 430 aa  89.7  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04490  signal transduction histidine kinase  46.85 
 
 		 469 aa  89  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  36.3 
 
 		 406 aa  87.8  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2450  histidine kinase  55.36 
 
 		 432 aa  87  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.516192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  41.61 
 
 		 442 aa  87  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0550  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 382 aa  87  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2473  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.07 
 
 		 391 aa  85.5  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0506045  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3288  histidine kinase  40.48 
 
 		 375 aa  85.5  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.345987  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1667  ATPase domain-containing protein  42.62 
 
 		 384 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.436527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1984  histidine kinase  42.62 
 
 		 373 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3749  histidine kinase  41.04 
 
 		 393 aa  85.1  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3715  histidine kinase  41.61 
 
 		 374 aa  84.7  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.124427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6530  histidine kinase  40.6 
 
 		 372 aa  85.1  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.475839  normal  0.13084 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  41.09 
 
 		 430 aa  84.7  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7014  histidine kinase  44.34 
 
 		 388 aa  83.6  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.149042  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0607  histidine kinase  40.88 
 
 		 434 aa  83.2  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  38.57 
 
 		 401 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3677  histidine kinase  44.33 
 
 		 408 aa  83.2  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.10393  normal  0.0950882 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  33.53 
 
 		 438 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2009  histidine kinase  43.7 
 
 		 395 aa  82  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 470 aa  82.4  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  36.48 
 
 		 478 aa  82  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  40.85 
 
 		 392 aa  81.6  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  36.99 
 
 		 381 aa  81.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3360  histidine kinase  33.33 
 
 		 384 aa  81.6  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0262665  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>