More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6510 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6510  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 513 aa  988    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.12601 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0305  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  59.34 
 
 		 310 aa  243  6e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.692518  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 		 393 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000329191  unclonable  0.0000000414728 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7842  histidine kinase  29.32 
 
 		 402 aa  127  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.209529 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36940  signal transduction histidine kinase  32.15 
 
 		 441 aa  124  6e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1732  histidine kinase  39.71 
 
 		 387 aa  120  7e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.424058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 441 aa  113  9e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  30.61 
 
 		 442 aa  113  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  39.48 
 
 		 399 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0304  putative signal transduction histidine kinase  47.65 
 
 		 127 aa  111  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.750895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  35.41 
 
 		 443 aa  109  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2014  histidine kinase  31.72 
 
 		 387 aa  106  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  31.4 
 
 		 430 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4901  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  48.25 
 
 		 383 aa  105  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.316421  normal  0.344545 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 382 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.935263  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  43.75 
 
 		 433 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  44.53 
 
 		 441 aa  100  6e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1510  histidine kinase  35.78 
 
 		 378 aa  99.8  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0382398 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  42.34 
 
 		 392 aa  99  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2232  histidine kinase  32.25 
 
 		 399 aa  98.6  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000209414  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  43.07 
 
 		 400 aa  98.2  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  44.03 
 
 		 380 aa  98.2  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 		 421 aa  98.2  4e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  46.62 
 
 		 399 aa  97.8  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 		 394 aa  97.4  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  27.84 
 
 		 422 aa  97.1  7e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.79 
 
 		 406 aa  97.1  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  44.83 
 
 		 423 aa  96.3  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4576  histidine kinase  50 
 
 		 394 aa  96.3  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312812  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  43.79 
 
 		 402 aa  95.5  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  47.41 
 
 		 367 aa  95.5  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  44.44 
 
 		 395 aa  94.7  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  44.37 
 
 		 420 aa  95.1  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  42.28 
 
 		 408 aa  95.1  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  46.09 
 
 		 369 aa  95.1  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.71 
 
 		 405 aa  93.6  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4835  histidine kinase  39.08 
 
 		 414 aa  93.6  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.951684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4509  Histidine kinase  48.15 
 
 		 380 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5264  histidine kinase  46.97 
 
 		 376 aa  92.8  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  32.64 
 
 		 417 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  40.97 
 
 		 478 aa  92  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5720  histidine kinase  36.25 
 
 		 439 aa  92.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  41.67 
 
 		 408 aa  92  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  45.11 
 
 		 372 aa  92.4  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  39.71 
 
 		 381 aa  92  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.37 
 
 		 394 aa  91.7  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21890  histidine kinase  34.57 
 
 		 473 aa  91.3  4e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000762776  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8413  histidine kinase  42.96 
 
 		 447 aa  90.9  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2680  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.72 
 
 		 271 aa  90.1  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.913052 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  43.48 
 
 		 405 aa  89.7  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  40.99 
 
 		 392 aa  89.7  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  31.13 
 
 		 438 aa  89.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0856  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 		 500 aa  89.4  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  44.09 
 
 		 430 aa  88.2  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  38.52 
 
 		 378 aa  87.8  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 		 496 aa  87.8  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.01 
 
 		 439 aa  87.4  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2086  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.99 
 
 		 389 aa  87.4  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  38.52 
 
 		 401 aa  87  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  40.71 
 
 		 430 aa  87.4  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3252  putative two-component system sensor kinase  42.42 
 
 		 372 aa  86.7  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  51.81 
 
 		 442 aa  86.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0277  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.5 
 
 		 426 aa  86.3  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110389 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.09 
 
 		 370 aa  86.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2233  histidine kinase  42.96 
 
 		 357 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370495  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  42.11 
 
 		 407 aa  85.5  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 470 aa  85.5  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  44.59 
 
 		 428 aa  85.9  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  43.61 
 
 		 388 aa  85.1  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5877  histidine kinase  40.94 
 
 		 419 aa  84.7  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3749  histidine kinase  42.86 
 
 		 393 aa  84.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  39.19 
 
 		 462 aa  84.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  41.48 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2532  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.56 
 
 		 400 aa  84.3  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.76647 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.18 
 
 		 379 aa  84  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  41.79 
 
 		 410 aa  84  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6162  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.73 
 
 		 415 aa  83.6  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  decreased coverage  0.000124452 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  39.75 
 
 		 395 aa  83.6  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 403 aa  83.2  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6093  histidine kinase  44.78 
 
 		 443 aa  83.2  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0999956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6530  histidine kinase  35.25 
 
 		 372 aa  82.8  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.475839  normal  0.13084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3288  histidine kinase  41.18 
 
 		 375 aa  83.2  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.345987  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.8 
 
 		 360 aa  82  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207944  normal  0.109837 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23670  signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 		 404 aa  82  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 		 413 aa  82.4  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1559  normal  0.393424 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  47.67 
 
 		 380 aa  82.4  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  40 
 
 		 384 aa  82  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1533  histidine kinase  47.01 
 
 		 451 aa  81.3  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0540  histidine kinase  40 
 
 		 453 aa  81.6  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231728  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.52 
 
 		 536 aa  81.3  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1615  histidine kinase  38.06 
 
 		 407 aa  81.3  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0650745  normal  0.0536208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4114  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.06 
 
 		 386 aa  80.9  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3670  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.86 
 
 		 371 aa  80.5  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2473  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.56 
 
 		 391 aa  80.9  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0506045  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  38.13 
 
 		 406 aa  80.5  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1653  histidine kinase  45.52 
 
 		 470 aa  80.9  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8801  putative two-component system sensor kinase  48.08 
 
 		 359 aa  80.5  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1618  histidine kinase  42.75 
 
 		 369 aa  80.5  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.790794  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7014  histidine kinase  42.59 
 
 		 388 aa  80.1  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.149042  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0550  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.13 
 
 		 382 aa  79.7  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>