More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6428 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 413 aa  776    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1559  normal  0.393424 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2473  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.6 
 
 		 391 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0506045  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 386 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3474  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  35.02 
 
 		 385 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  38.94 
 
 		 400 aa  126  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0608  histidine kinase  40.83 
 
 		 351 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  39.15 
 
 		 441 aa  119  7e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.26 
 
 		 439 aa  119  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  31.78 
 
 		 405 aa  117  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  38.63 
 
 		 422 aa  116  6.9999999999999995e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  35.16 
 
 		 399 aa  116  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4434  histidine kinase  37.01 
 
 		 369 aa  114  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.584475  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  38.12 
 
 		 401 aa  113  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  37.44 
 
 		 369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.27 
 
 		 394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  32.28 
 
 		 402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 		 403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  38.7 
 
 		 408 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  38.12 
 
 		 420 aa  110  6e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  37.12 
 
 		 428 aa  110  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00220  signal transduction histidine kinase  38.93 
 
 		 391 aa  109  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5720  histidine kinase  37.08 
 
 		 439 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  39.56 
 
 		 407 aa  106  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  32.83 
 
 		 430 aa  106  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4576  histidine kinase  37.61 
 
 		 394 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312812  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  32.52 
 
 		 399 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  37.39 
 
 		 442 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1050  histidine kinase  36.18 
 
 		 421 aa  104  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  35.96 
 
 		 433 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  33.59 
 
 		 478 aa  103  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23670  signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 404 aa  103  6e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 		 441 aa  103  7e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2233  histidine kinase  35.65 
 
 		 357 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370495  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 		 398 aa  101  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 496 aa  101  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 		 440 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3913  histidine kinase  32.32 
 
 		 458 aa  100  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  33.81 
 
 		 438 aa  99.8  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  32.95 
 
 		 406 aa  99.8  7e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  31.62 
 
 		 381 aa  99.8  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 		 407 aa  99.8  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 		 394 aa  99.4  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 		 445 aa  99  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.697723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 		 372 aa  99.4  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  36.76 
 
 		 428 aa  98.6  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  32.18 
 
 		 430 aa  98.2  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4114  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.05 
 
 		 386 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  36.05 
 
 		 397 aa  98.6  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.76 
 
 		 379 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  33.33 
 
 		 417 aa  97.8  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  37.45 
 
 		 423 aa  96.7  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5877  histidine kinase  35.22 
 
 		 419 aa  96.7  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3360  histidine kinase  33.85 
 
 		 384 aa  95.9  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0262665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3239  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  33.88 
 
 		 422 aa  95.9  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.771417  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2680  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.61 
 
 		 271 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.913052 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  35.48 
 
 		 443 aa  95.5  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7842  histidine kinase  34.88 
 
 		 402 aa  95.5  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.209529 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 		 387 aa  95.5  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.224813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 		 536 aa  94.7  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 		 406 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 405 aa  94  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3670  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.27 
 
 		 371 aa  94.4  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6162  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.29 
 
 		 415 aa  93.6  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  decreased coverage  0.000124452 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1411  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 		 386 aa  93.6  6e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4135  putative signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 		 444 aa  93.6  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3039  histidine kinase  35.78 
 
 		 376 aa  93.6  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0758324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2803  histidine kinase  33.47 
 
 		 422 aa  93.6  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0532  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.86 
 
 		 437 aa  93.2  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.14079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  33.77 
 
 		 384 aa  93.2  8e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  34.45 
 
 		 408 aa  92.8  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.05 
 
 		 430 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 		 416 aa  90.9  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  26.52 
 
 		 421 aa  91.3  3e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3252  putative two-component system sensor kinase  36.25 
 
 		 372 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5551  histidine kinase  33.77 
 
 		 376 aa  90.1  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.476755  normal  0.129441 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  31.49 
 
 		 380 aa  90.1  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 424 aa  89.7  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0200  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.44 
 
 		 424 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1615  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.54 
 
 		 392 aa  89.4  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0748  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.79 
 
 		 393 aa  89.4  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.279755 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0309  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.54 
 
 		 400 aa  89  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.13648 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0762  histidine kinase  27.66 
 
 		 437 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.332583 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  31.58 
 
 		 378 aa  88.6  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36940  signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 		 441 aa  88.2  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2709  histidine kinase  33.6 
 
 		 397 aa  88.6  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607523  normal  0.683898 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6093  histidine kinase  32.79 
 
 		 443 aa  88.2  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0999956 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4008  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 524 aa  88.2  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00577691  normal  0.384071 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  34.47 
 
 		 395 aa  87.4  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1301  histidine kinase  34.8 
 
 		 389 aa  87.4  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.370703  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1615  histidine kinase  33.33 
 
 		 407 aa  87  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0650745  normal  0.0536208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  31.22 
 
 		 392 aa  86.7  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  33.07 
 
 		 388 aa  86.7  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  35.89 
 
 		 410 aa  86.3  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  30.33 
 
 		 442 aa  85.5  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0623  histidine kinase  31.94 
 
 		 403 aa  85.9  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8413  histidine kinase  32.44 
 
 		 447 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2232  histidine kinase  34.84 
 
 		 399 aa  85.5  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000209414  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1733  histidine kinase  34.63 
 
 		 385 aa  85.5  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 		 438 aa  85.5  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.621089  normal  0.0286843 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7811  histidine kinase  33.2 
 
 		 291 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>