More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4434 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4434  histidine kinase  100 
 
 		 369 aa  712    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.584475  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2473  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 		 391 aa  136  6.0000000000000005e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0506045  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 386 aa  125  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3474  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  30.4 
 
 		 385 aa  122  8e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  35.42 
 
 		 402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4576  histidine kinase  36.32 
 
 		 394 aa  110  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312812  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 413 aa  109  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1559  normal  0.393424 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  31.34 
 
 		 405 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1050  histidine kinase  34.56 
 
 		 421 aa  107  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0607  histidine kinase  33.33 
 
 		 434 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3360  histidine kinase  32.37 
 
 		 384 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0262665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 439 aa  103  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  34.8 
 
 		 399 aa  102  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  34.05 
 
 		 395 aa  102  8e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  29.52 
 
 		 381 aa  102  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  34.55 
 
 		 433 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0608  histidine kinase  35.68 
 
 		 351 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04490  signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 		 469 aa  101  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  33.63 
 
 		 417 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6093  histidine kinase  33.59 
 
 		 443 aa  99.4  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0999956 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  33.62 
 
 		 430 aa  97.4  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  26.33 
 
 		 392 aa  97.4  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 441 aa  97.1  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6530  histidine kinase  35.05 
 
 		 372 aa  96.7  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.475839  normal  0.13084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.3 
 
 		 430 aa  96.3  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1615  histidine kinase  35.65 
 
 		 407 aa  95.5  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0650745  normal  0.0536208 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  31.47 
 
 		 406 aa  95.5  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5720  histidine kinase  33.19 
 
 		 439 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00220  signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 		 391 aa  95.1  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3005  histidine kinase  34.51 
 
 		 386 aa  95.1  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00188406  hitchhiker  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2232  histidine kinase  35.62 
 
 		 399 aa  95.1  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000209414  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4052  histidine kinase  32.72 
 
 		 385 aa  94  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0454325  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 424 aa  94  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1411  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 386 aa  94  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02990  signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 		 419 aa  93.6  5e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 420 aa  93.2  6e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3054  histidine kinase  35.55 
 
 		 388 aa  92.8  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131437  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.94 
 
 		 387 aa  92.4  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.224813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 		 416 aa  92.4  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3989  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 		 398 aa  91.3  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  32.73 
 
 		 442 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0200  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.23 
 
 		 424 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  31.71 
 
 		 397 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0233  putative two-component system sensor kinase  34.5 
 
 		 379 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  30.54 
 
 		 478 aa  90.9  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2009  histidine kinase  34.6 
 
 		 395 aa  90.9  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4835  histidine kinase  33.18 
 
 		 414 aa  90.5  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.951684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 		 394 aa  90.1  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  32.64 
 
 		 428 aa  90.1  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3388  histidine kinase  32.24 
 
 		 402 aa  90.1  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000377733  hitchhiker  0.000242442 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  34.58 
 
 		 372 aa  89.7  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  30.6 
 
 		 400 aa  89.4  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2467  histidine kinase  31.33 
 
 		 409 aa  89.4  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2657  histidine kinase  31.22 
 
 		 426 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  35.27 
 
 		 392 aa  89  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  29.44 
 
 		 422 aa  89  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  29.76 
 
 		 428 aa  89.4  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  29.45 
 
 		 407 aa  88.2  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3749  histidine kinase  29.62 
 
 		 393 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  29.71 
 
 		 380 aa  88.6  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1733  histidine kinase  36.2 
 
 		 385 aa  87.4  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 		 441 aa  87.4  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  27.27 
 
 		 408 aa  87.8  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  33.49 
 
 		 423 aa  87.8  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1620  histidine kinase  31.34 
 
 		 380 aa  87  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3239  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  32.14 
 
 		 422 aa  87  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.771417  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  30.6 
 
 		 380 aa  86.7  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8244  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.7 
 
 		 357 aa  86.7  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.249642 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 469 aa  86.7  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  35.15 
 
 		 443 aa  86.7  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1615  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 392 aa  86.7  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8801  putative two-component system sensor kinase  31.73 
 
 		 359 aa  86.7  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 420 aa  86.3  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.420367  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1721  histidine kinase  32.1 
 
 		 399 aa  86.3  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 		 398 aa  86.3  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 442 aa  86.3  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  35.45 
 
 		 408 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  28.97 
 
 		 438 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3474  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  28.5 
 
 		 354 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 		 407 aa  85.1  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  31.28 
 
 		 399 aa  84.3  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4469  putative two-component system sensor kinase  30.15 
 
 		 384 aa  84.3  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.400588  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  35.33 
 
 		 388 aa  84  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 		 438 aa  84  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.621089  normal  0.0286843 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  32.13 
 
 		 430 aa  84  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0856  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 500 aa  83.6  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0504  histidine kinase  33.02 
 
 		 407 aa  83.6  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.991268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4509  Histidine kinase  30.19 
 
 		 380 aa  83.6  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  30.42 
 
 		 410 aa  83.6  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 		 425 aa  83.2  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3356  histidine kinase  32 
 
 		 426 aa  83.2  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10189  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 		 403 aa  83.2  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3642  ATPase domain-containing protein  32.98 
 
 		 630 aa  82.8  0.000000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 394 aa  82.8  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1617  histidine kinase  31.67 
 
 		 391 aa  82.4  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1653  histidine kinase  36.08 
 
 		 470 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7811  histidine kinase  30.31 
 
 		 291 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4114  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.34 
 
 		 386 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5598  sensor histidine kinase  21.86 
 
 		 376 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2226  histidine kinase  36.53 
 
 		 370 aa  81.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>