259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0304 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0304  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 127 aa  249  9.000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.750895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6510  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.65 
 
 		 513 aa  110  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.12601 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  41.22 
 
 		 372 aa  77.4  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  38.64 
 
 		 433 aa  77  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1653  histidine kinase  41.86 
 
 		 470 aa  75.5  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.35 
 
 		 406 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  39.13 
 
 		 399 aa  70.5  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  37.04 
 
 		 417 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4835  histidine kinase  40.62 
 
 		 414 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.951684  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  39.06 
 
 		 408 aa  68.6  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4509  Histidine kinase  39.53 
 
 		 380 aa  68.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5264  histidine kinase  42.74 
 
 		 376 aa  67.4  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5720  histidine kinase  35.97 
 
 		 439 aa  67  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  35.38 
 
 		 478 aa  66.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4901  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  37.3 
 
 		 383 aa  66.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.316421  normal  0.344545 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 405 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6530  histidine kinase  40 
 
 		 372 aa  65.1  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.475839  normal  0.13084 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  38.64 
 
 		 392 aa  63.9  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6093  histidine kinase  36.36 
 
 		 443 aa  62.8  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0999956 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  41.22 
 
 		 402 aa  62.8  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3252  putative two-component system sensor kinase  37.69 
 
 		 372 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0261  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.72 
 
 		 429 aa  62.4  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.653023 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8413  histidine kinase  36.72 
 
 		 447 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0233  putative two-component system sensor kinase  38.1 
 
 		 379 aa  61.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  32.56 
 
 		 401 aa  61.6  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  35.94 
 
 		 410 aa  61.6  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  41.13 
 
 		 423 aa  62  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2450  histidine kinase  35.38 
 
 		 432 aa  61.2  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.516192  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  34.07 
 
 		 428 aa  60.8  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1747  Histidine kinase  36.76 
 
 		 384 aa  60.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.71 
 
 		 394 aa  60.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1510  histidine kinase  39.8 
 
 		 378 aa  60.5  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0382398 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3280  histidine kinase  43.14 
 
 		 664 aa  60.5  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00155771  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 394 aa  60.5  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  34.88 
 
 		 381 aa  60.5  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  36.72 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  39.37 
 
 		 395 aa  58.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  35.66 
 
 		 388 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  34.53 
 
 		 407 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2232  histidine kinase  43.01 
 
 		 399 aa  58.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000209414  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  39.37 
 
 		 367 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0550  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 		 382 aa  58.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.89 
 
 		 393 aa  58.2  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000329191  unclonable  0.0000000414728 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 		 403 aa  58.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 		 387 aa  58.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.224813  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1050  histidine kinase  39.2 
 
 		 421 aa  57.4  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  35.94 
 
 		 392 aa  57.4  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  31.91 
 
 		 438 aa  57  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4576  histidine kinase  34.38 
 
 		 394 aa  57  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312812  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  34.33 
 
 		 400 aa  57  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 382 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.935263  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6162  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.21 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  decreased coverage  0.000124452 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4945  histidine kinase  45.59 
 
 		 351 aa  56.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228101  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4008  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.36 
 
 		 524 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00577691  normal  0.384071 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  36.92 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  35.71 
 
 		 393 aa  56.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  39.56 
 
 		 384 aa  56.2  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1999  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.85 
 
 		 503 aa  55.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 441 aa  56.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0677  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.88 
 
 		 379 aa  56.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 		 441 aa  55.5  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2467  histidine kinase  41 
 
 		 409 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1732  histidine kinase  43.28 
 
 		 387 aa  55.1  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.424058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  32.85 
 
 		 443 aa  55.1  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2641  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 468 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7116  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 		 388 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  33.33 
 
 		 405 aa  54.7  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  34.96 
 
 		 422 aa  54.3  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  35.16 
 
 		 442 aa  54.3  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3288  histidine kinase  33.33 
 
 		 375 aa  54.3  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.345987  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  37.86 
 
 		 462 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  46.97 
 
 		 430 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0607  histidine kinase  33.33 
 
 		 434 aa  53.5  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 		 407 aa  53.9  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4685  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.17 
 
 		 467 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3027  histidine kinase  34.06 
 
 		 449 aa  53.9  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.256047  decreased coverage  0.0000413704 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2226  histidine kinase  36.72 
 
 		 370 aa  53.9  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  33.08 
 
 		 430 aa  53.5  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4052  histidine kinase  31.62 
 
 		 385 aa  53.5  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0454325  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0856  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 		 500 aa  53.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 		 420 aa  53.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0405  histidine kinase  37.21 
 
 		 379 aa  53.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1618  histidine kinase  32.61 
 
 		 369 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.790794  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2086  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 		 389 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 		 496 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8792  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.72 
 
 		 380 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.524564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2473  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 391 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0506045  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 		 416 aa  51.6  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2532  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.5 
 
 		 400 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.76647 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  30.77 
 
 		 378 aa  52  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4218  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 382 aa  52  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0292279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 398 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6695  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 398 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  33.59 
 
 		 399 aa  51.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4469  putative two-component system sensor kinase  31.01 
 
 		 384 aa  51.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.400588  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2605  Histidine kinase  42 
 
 		 650 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209527  normal  0.327771 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1615  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 		 392 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2603  Histidine kinase  36.43 
 
 		 720 aa  51.2  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00739798  normal  0.140215 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0540  histidine kinase  31.25 
 
 		 453 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  33.33 
 
 		 397 aa  51.6  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>