More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5618 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5618  Signal transduction histidine kinase-like protein  100 
 
 		 431 aa  810    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180285  normal  0.667529 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  54.48 
 
 		 392 aa  238  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2086  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.35 
 
 		 389 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2233  histidine kinase  44.15 
 
 		 357 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370495  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  36.4 
 
 		 405 aa  111  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  36.21 
 
 		 442 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6964  histidine kinase  35.93 
 
 		 399 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.198128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4685  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 467 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  30.94 
 
 		 433 aa  103  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 		 496 aa  100  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3388  histidine kinase  34.1 
 
 		 402 aa  99  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000377733  hitchhiker  0.000242442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  36.3 
 
 		 399 aa  97.8  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  37.99 
 
 		 367 aa  97.1  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  37.45 
 
 		 384 aa  97.1  6e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  44.22 
 
 		 428 aa  96.3  9e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 		 421 aa  96.3  9e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  46.77 
 
 		 462 aa  95.5  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  32.3 
 
 		 380 aa  96.3  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  46.03 
 
 		 441 aa  95.1  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 441 aa  94.7  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.8 
 
 		 370 aa  94.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 444 aa  94.4  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3391  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 445 aa  94  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0809012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7842  histidine kinase  34.58 
 
 		 402 aa  93.6  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.209529 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  40.67 
 
 		 388 aa  94  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  34.84 
 
 		 438 aa  93.6  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  33.93 
 
 		 443 aa  93.6  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  48.39 
 
 		 442 aa  93.2  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 		 405 aa  93.2  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 		 403 aa  92.8  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.03 
 
 		 406 aa  91.3  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4114  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.94 
 
 		 386 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  34.55 
 
 		 402 aa  90.9  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0309  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.8 
 
 		 400 aa  90.1  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.13648 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2413  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 373 aa  89.4  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  31.2 
 
 		 430 aa  89  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3054  histidine kinase  34.19 
 
 		 388 aa  88.6  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131437  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  40.97 
 
 		 408 aa  87.8  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2014  histidine kinase  42.48 
 
 		 387 aa  87  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  32.22 
 
 		 422 aa  87  6e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.06 
 
 		 430 aa  86.7  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 439 aa  86.7  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6093  histidine kinase  31.59 
 
 		 443 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0999956 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1653  histidine kinase  41.79 
 
 		 470 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  40.96 
 
 		 408 aa  84.7  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  37.25 
 
 		 372 aa  84.7  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8413  histidine kinase  31.68 
 
 		 447 aa  84.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0396  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 		 424 aa  84.3  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2532  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.57 
 
 		 400 aa  84.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.76647 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4945  histidine kinase  46.6 
 
 		 351 aa  84  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228101  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.04 
 
 		 423 aa  84  0.000000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4578  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.15 
 
 		 370 aa  83.2  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  36.82 
 
 		 457 aa  82.4  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2556  histidine kinase  44.27 
 
 		 416 aa  82.8  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.121674  normal  0.0692801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1615  histidine kinase  42.64 
 
 		 407 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0650745  normal  0.0536208 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 		 394 aa  82  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  36.07 
 
 		 407 aa  81.6  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6510  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.48 
 
 		 513 aa  81.6  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.12601 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  29.64 
 
 		 420 aa  80.9  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  32.71 
 
 		 410 aa  80.1  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11590  signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 		 612 aa  80.5  0.00000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338093  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.17 
 
 		 393 aa  80.5  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000329191  unclonable  0.0000000414728 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0103  histidine kinase  42.11 
 
 		 393 aa  80.5  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.105504  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2107  histidine kinase  30.8 
 
 		 401 aa  80.1  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.51786 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1319  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  30.45 
 
 		 384 aa  80.1  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2009  histidine kinase  39.88 
 
 		 395 aa  80.1  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2823  histidine kinase  30.56 
 
 		 413 aa  79.7  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.302112  normal  0.674587 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.23 
 
 		 438 aa  79.7  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.621089  normal  0.0286843 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7811  histidine kinase  38.16 
 
 		 291 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2513  histidine kinase  33.08 
 
 		 424 aa  79.7  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0276657  normal  0.73288 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  30.77 
 
 		 400 aa  79  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  37.4 
 
 		 478 aa  79  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0305  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  37.78 
 
 		 310 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.692518  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 		 424 aa  79  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7116  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 388 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1747  Histidine kinase  32.32 
 
 		 384 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1050  histidine kinase  31.29 
 
 		 421 aa  78.6  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  30.9 
 
 		 395 aa  78.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 420 aa  77.8  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.420367  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6162  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.64 
 
 		 415 aa  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  decreased coverage  0.000124452 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  37.18 
 
 		 406 aa  77.8  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  40.46 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3315  histidine kinase  40.15 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0173887  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2468  histidine kinase  29.39 
 
 		 393 aa  77  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000420477  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0610  putative two-component system sensor kinase  34.18 
 
 		 372 aa  77.4  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4008  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.91 
 
 		 524 aa  77  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00577691  normal  0.384071 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36940  signal transduction histidine kinase  39.16 
 
 		 441 aa  77  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3360  histidine kinase  31.17 
 
 		 384 aa  77.4  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0262665  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4416  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 386 aa  77.4  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.495846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  47.66 
 
 		 392 aa  76.6  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.99 
 
 		 394 aa  76.6  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1985  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  31.2 
 
 		 389 aa  76.3  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2410  histidine kinase  38.31 
 
 		 343 aa  76.6  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000188304  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  46 
 
 		 395 aa  76.3  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1732  histidine kinase  34.21 
 
 		 387 aa  76.3  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.424058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  42.11 
 
 		 428 aa  75.9  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.88 
 
 		 401 aa  75.1  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274941  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1602  histidine kinase  33.33 
 
 		 425 aa  75.5  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0369038 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  35.03 
 
 		 430 aa  75.5  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3239  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  34.03 
 
 		 422 aa  75.5  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.771417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>