263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1369 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1369  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  100 
 
 
664 aa  1345    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.183834  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0491  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  97.14 
 
 
664 aa  1314    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.190343  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1248  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  98.34 
 
 
664 aa  1326    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.295288  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0043  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  57.89 
 
 
672 aa  772    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.778368  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0991  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  49.48 
 
 
673 aa  649    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1374  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  56.78 
 
 
673 aa  746    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0601  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  68.17 
 
 
664 aa  916    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1504  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  50.52 
 
 
683 aa  653    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.878777  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0826  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  53.12 
 
 
671 aa  665    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0218666  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1246  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  51.93 
 
 
674 aa  653    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0485  glycine--tRNA ligase  35.08 
 
 
688 aa  397  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0604  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.1 
 
 
694 aa  385  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3672  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.93 
 
 
688 aa  372  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0142363  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0599  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.97 
 
 
688 aa  370  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487119  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1686  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.62 
 
 
696 aa  371  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.78284  normal  0.0276337 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0579  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.67 
 
 
687 aa  367  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1733  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.23 
 
 
690 aa  367  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0741  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.63 
 
 
691 aa  366  1e-100  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.143146  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3059  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.25 
 
 
687 aa  368  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1115  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.92 
 
 
690 aa  363  8e-99  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.217479  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3047  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.26 
 
 
698 aa  362  9e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.228214  normal  0.0284837 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0656  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.35 
 
 
687 aa  362  1e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70031e-23 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3372  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.68 
 
 
705 aa  361  3e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.173732  normal  0.25449 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1515  glycine--tRNA ligase  34.44 
 
 
688 aa  355  1e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1022  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.06 
 
 
687 aa  355  2e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.208045  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.24 
 
 
692 aa  355  2e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0540  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.29 
 
 
678 aa  355  2e-96  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.792152  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0270  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.49 
 
 
679 aa  354  2.9999999999999997e-96  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12440  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.76 
 
 
686 aa  354  4e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1053  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.74 
 
 
678 aa  353  7e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0993  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.46 
 
 
693 aa  352  1e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1091  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.79 
 
 
668 aa  352  1e-95  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3726  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.53 
 
 
688 aa  352  1e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2941  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.67 
 
 
686 aa  351  2e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.125162  hitchhiker  0.000287233 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3255  Glycine--tRNA ligase  32.7 
 
 
696 aa  350  4e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0642  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.44 
 
 
687 aa  348  3e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.91532  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0930  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.37 
 
 
697 aa  345  1e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0076  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.58 
 
 
683 aa  346  1e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.589695  hitchhiker  0.000000000290731 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2472  glycine--tRNA ligase  32.8 
 
 
695 aa  343  5e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0180526  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2033  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.71 
 
 
696 aa  341  2.9999999999999998e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00144588  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0079  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.72 
 
 
683 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248487  decreased coverage  0.0000000000235888 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00100  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.42 
 
 
685 aa  340  5e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.48 
 
 
688 aa  340  7e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08211  glycyl-tRNA synthetase beta subunit  33.47 
 
 
720 aa  339  8e-92  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.938458  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4816  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.58 
 
 
717 aa  339  8e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.642859 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0355  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.38 
 
 
690 aa  339  9e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.48 
 
 
689 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00736647 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4481  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.95 
 
 
719 aa  338  1.9999999999999998e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.731924  normal  0.0858499 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2445  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.97 
 
 
694 aa  338  1.9999999999999998e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2554  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.26 
 
 
701 aa  337  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100286  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.09 
 
 
685 aa  337  5e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2650  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.97 
 
 
701 aa  336  7.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0076  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.24 
 
 
684 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000133889  normal  0.112381 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1306  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.97 
 
 
701 aa  335  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0012  glycine--tRNA ligase  32.85 
 
 
690 aa  335  2e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.948293  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1197  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.89 
 
 
673 aa  335  2e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.28917  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3935  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.44 
 
 
680 aa  334  3e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000397713  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2965  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.55 
 
 
688 aa  334  3e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.425514  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0060  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.09 
 
 
684 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000538802 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33 
 
 
684 aa  332  1e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000238485  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1208  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.8 
 
 
693 aa  331  2e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0414092  normal  0.146925 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0011  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.24 
 
 
684 aa  331  3e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2050  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.11 
 
 
693 aa  330  4e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00090  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.52 
 
 
684 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0335  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.29 
 
 
687 aa  330  5.0000000000000004e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2210  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.99 
 
 
697 aa  330  7e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.51 
 
 
684 aa  330  8e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1195  glycine--tRNA ligase, beta subunit  31.46 
 
 
729 aa  329  1.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1193  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.88 
 
 
685 aa  328  2.0000000000000001e-88  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.33 
 
 
688 aa  327  4.0000000000000003e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0916  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.12 
 
 
694 aa  327  4.0000000000000003e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2388  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.85 
 
 
711 aa  327  5e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2337  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.85 
 
 
711 aa  327  5e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0185  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.95 
 
 
684 aa  327  6e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.19 
 
 
689 aa  327  6e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000111985 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08191  glycyl-tRNA synthetase beta subunit  32.83 
 
 
720 aa  327  6e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.38 
 
 
689 aa  327  6e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0707  glycine--tRNA ligase  32.46 
 
 
672 aa  326  8.000000000000001e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0731  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.06 
 
 
672 aa  325  1e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0479  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.74 
 
 
688 aa  323  7e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.34 
 
 
692 aa  323  7e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0555063  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0018  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.46 
 
 
728 aa  323  8e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.606807 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4254  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.66 
 
 
690 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1712  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.56 
 
 
702 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00327927  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2499  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.93 
 
 
688 aa  320  5e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.67 
 
 
694 aa  319  7.999999999999999e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.829353  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0373  glycine--tRNA ligase  32.12 
 
 
691 aa  318  1e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.87078  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0794  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.14 
 
 
716 aa  318  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.934108  normal  0.0595481 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0014  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33 
 
 
689 aa  317  5e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000639104 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0011  glycine--tRNA ligase  32.61 
 
 
693 aa  317  5e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.466423 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2175  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  29.59 
 
 
728 aa  317  6e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.754598  normal  0.117585 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.53 
 
 
694 aa  317  6e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1266  glycine--tRNA ligase  30.03 
 
 
696 aa  316  8e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.61 
 
 
689 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3849  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.98 
 
 
689 aa  315  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1441  glycine--tRNA ligase  30.94 
 
 
700 aa  315  1.9999999999999998e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.764176  normal  0.147312 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4167  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.13 
 
 
689 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1054  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.94 
 
 
672 aa  314  2.9999999999999996e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000126783  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.32 
 
 
689 aa  314  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0151663 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3977  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.98 
 
 
689 aa  313  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>