263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2965 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03410  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  70.55 
 
 		 689 aa  976    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0152  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  70.55 
 
 		 689 aa  976    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0043  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  69.75 
 
 		 694 aa  952    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  56.56 
 
 		 688 aa  788    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  66.33 
 
 		 689 aa  922    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4130  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  69.1 
 
 		 689 aa  957    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0014  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  66.76 
 
 		 688 aa  877    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0061  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  69.97 
 
 		 689 aa  959    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2965  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  100 
 
 		 688 aa  1384    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.425514  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0023  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  69.1 
 
 		 689 aa  957    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002000  glycyl-tRNA synthetase beta chain  85.47 
 
 		 688 aa  1116    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0373  glycine--tRNA ligase  48.4 
 
 		 691 aa  658    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.87078  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03361  hypothetical protein  70.55 
 
 		 689 aa  976    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3868  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  69.68 
 
 		 689 aa  956    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3782  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  69.1 
 
 		 689 aa  957    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  66.62 
 
 		 689 aa  901    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  66.62 
 
 		 689 aa  887    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000499537 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3977  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  69.68 
 
 		 689 aa  955    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0355  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  47.88 
 
 		 690 aa  651    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4037  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  69.68 
 
 		 689 aa  956    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.414013 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4054  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  70.7 
 
 		 689 aa  975    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3931  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  69.68 
 
 		 689 aa  955    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  66.62 
 
 		 689 aa  887    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0151663 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0014  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  66.03 
 
 		 689 aa  899    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000639104 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  67.49 
 
 		 689 aa  912    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736647 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  66.62 
 
 		 689 aa  928    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000111985 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0012  glycine--tRNA ligase  48.47 
 
 		 690 aa  646    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.948293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4934  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  70.55 
 
 		 689 aa  976    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.711684 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3966  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  70.41 
 
 		 689 aa  973    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  65.27 
 
 		 694 aa  888    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.829353  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  49.85 
 
 		 684 aa  643    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2499  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  81.69 
 
 		 688 aa  1119    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0160  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  51.16 
 
 		 699 aa  707    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0163  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  69.24 
 
 		 689 aa  952    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  66.62 
 
 		 689 aa  889    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  66.33 
 
 		 689 aa  884    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  58.28 
 
 		 692 aa  807    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00449  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  85.14 
 
 		 693 aa  1113    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0479  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  67.49 
 
 		 688 aa  949    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  66.62 
 
 		 688 aa  864    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000120926 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  66.62 
 
 		 688 aa  865    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  65.99 
 
 		 694 aa  914    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  59.36 
 
 		 692 aa  773    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0555063  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0070  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  69.53 
 
 		 689 aa  964    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.118047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3849  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  69.83 
 
 		 689 aa  958    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0156  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  70.55 
 
 		 689 aa  976    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3255  Glycine--tRNA ligase  51.82 
 
 		 696 aa  714    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0016  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  66.76 
 
 		 688 aa  865    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000327788 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4167  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  70.26 
 
 		 689 aa  969    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3761  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  70.55 
 
 		 689 aa  976    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.677293  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0025  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  66.47 
 
 		 689 aa  902    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0144037 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3726  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  62.04 
 
 		 688 aa  862    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0038  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  52.26 
 
 		 693 aa  669    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.903555  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3881  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  70.85 
 
 		 689 aa  979    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4449  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  69.53 
 
 		 689 aa  963    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  49.42 
 
 		 684 aa  629  1e-179  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000238485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  51.95 
 
 		 685 aa  631  1e-179  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00090  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  51.37 
 
 		 684 aa  625  1e-178  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0060  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  48.25 
 
 		 684 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000538802 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0076  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  48.25 
 
 		 684 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000133889  normal  0.112381 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0011  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  48.54 
 
 		 684 aa  619  1e-176  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0079  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  48.25 
 
 		 683 aa  619  1e-176  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248487  decreased coverage  0.0000000000235888 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2210  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  46.62 
 
 		 697 aa  619  1e-176  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  48.32 
 
 		 688 aa  621  1e-176  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0011  glycine--tRNA ligase  48.32 
 
 		 693 aa  619  1e-176  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.466423 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0185  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  48.4 
 
 		 684 aa  618  1e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0076  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  48.1 
 
 		 683 aa  616  1e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.589695  hitchhiker  0.000000000290731 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00100  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  46.79 
 
 		 685 aa  599  1e-170  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1773  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  46.91 
 
 		 697 aa  595  1e-168  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0663369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0207  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  46.14 
 
 		 692 aa  593  1e-168  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2050  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  47.38 
 
 		 693 aa  589  1e-167  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2116  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  46 
 
 		 689 aa  590  1e-167  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2051  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  47.45 
 
 		 692 aa  589  1e-167  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2055  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  45.76 
 
 		 697 aa  579  1e-164  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.35855  normal  0.503298 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1803  glycyl-tRNA synthetase beta chain  44.64 
 
 		 688 aa  569  1e-161  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1804  glycyl-tRNA synthetase beta chain  44.49 
 
 		 688 aa  564  1.0000000000000001e-159  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1221  glycine--tRNA ligase  43.79 
 
 		 696 aa  547  1e-154  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2574  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  45.41 
 
 		 693 aa  543  1e-153  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568144 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0400  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.73 
 
 		 697 aa  512  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.543468 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0524  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  44.31 
 
 		 697 aa  514  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0189981 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0415  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.59 
 
 		 697 aa  511  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474954  normal  0.979484 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0599  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  41.04 
 
 		 688 aa  496  1e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487119  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1289  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  44.52 
 
 		 704 aa  494  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.708462 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0686  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.42 
 
 		 699 aa  490  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0405  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  44.09 
 
 		 699 aa  485  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.721596  normal  0.352354 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3535  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  42.02 
 
 		 712 aa  483  1e-135  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.028288 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0446  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  41.19 
 
 		 707 aa  481  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1441  glycine--tRNA ligase  39.83 
 
 		 700 aa  479  1e-134  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.764176  normal  0.147312 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0544  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  42.2 
 
 		 720 aa  476  1e-133  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1022  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.43 
 
 		 687 aa  477  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.208045  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2702  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.61 
 
 		 699 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0207133  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0507  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  41.73 
 
 		 710 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.524717  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4013  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  42.84 
 
 		 699 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.454838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2090  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.61 
 
 		 699 aa  472  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339656  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03829  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.68 
 
 		 745 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3059  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  38.72 
 
 		 687 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0444  glycine--tRNA ligase  41.38 
 
 		 711 aa  471  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0906989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0716  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.26 
 
 		 699 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4177  glycine--tRNA ligase  42.7 
 
 		 708 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.787875  normal  0.54331 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0597  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.7 
 
 		 699 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>