263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1289 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0686  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  56.73 
 
 		 699 aa  690    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3380  glycine--tRNA ligase  71.57 
 
 		 705 aa  922    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0350484  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0524  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  55.03 
 
 		 697 aa  668    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0189981 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2430  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  55.86 
 
 		 699 aa  659    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.726931  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0218  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  55.86 
 
 		 699 aa  659    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4743  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  74.19 
 
 		 712 aa  960    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0544  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  78.22 
 
 		 720 aa  1080    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3535  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  70.03 
 
 		 712 aa  959    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.028288 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0701  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  55.72 
 
 		 699 aa  657    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0507  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  54.29 
 
 		 710 aa  659    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.524717  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2347  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  68.37 
 
 		 701 aa  893    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.501634 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0881  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  55.86 
 
 		 699 aa  659    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.59966  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6029  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  55.43 
 
 		 699 aa  635    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0400  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  55.46 
 
 		 697 aa  684    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.543468 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0550  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  60.25 
 
 		 739 aa  811    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1289  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  100 
 
 		 704 aa  1398    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.708462 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0584  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  55.14 
 
 		 699 aa  646    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0716  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  55.86 
 
 		 699 aa  659    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2163  glycine--tRNA ligase  70.04 
 
 		 718 aa  903    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.669407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3695  glycine--tRNA ligase  66.76 
 
 		 744 aa  879    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.641842  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0644  glycine--tRNA ligase  67.32 
 
 		 708 aa  894    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4202  glycine--tRNA ligase  75.21 
 
 		 731 aa  1003    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4013  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  56.01 
 
 		 699 aa  668    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.454838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0415  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  55.32 
 
 		 697 aa  684    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474954  normal  0.979484 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0446  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  53.88 
 
 		 707 aa  674    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2090  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  55.64 
 
 		 699 aa  651    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339656  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2729  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  55.92 
 
 		 699 aa  642    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2350  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  55.86 
 
 		 699 aa  659    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2702  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  55.78 
 
 		 699 aa  654    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0207133  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0215  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  70.43 
 
 		 713 aa  897    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.101783 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0405  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  56.21 
 
 		 699 aa  681    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.721596  normal  0.352354 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4177  glycine--tRNA ligase  80.08 
 
 		 708 aa  1081    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.787875  normal  0.54331 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0444  glycine--tRNA ligase  74.61 
 
 		 711 aa  984    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0906989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0528  glycine--tRNA ligase  78.64 
 
 		 720 aa  1065    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0942391 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2728  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  55.86 
 
 		 699 aa  659    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0597  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  54.89 
 
 		 699 aa  633  1e-180  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2619  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  55.28 
 
 		 699 aa  630  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0871  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  55.64 
 
 		 695 aa  630  1e-179  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.306102  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1864  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  48.81 
 
 		 712 aa  631  1e-179  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2754  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  55.43 
 
 		 699 aa  631  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.200754  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1568  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  48.53 
 
 		 712 aa  624  1e-177  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.269615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0355  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  44.03 
 
 		 690 aa  535  1e-150  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  46.53 
 
 		 692 aa  533  1e-150  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0555063  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  42.47 
 
 		 688 aa  526  1e-148  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3726  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  44.93 
 
 		 688 aa  528  1e-148  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0373  glycine--tRNA ligase  43.18 
 
 		 691 aa  519  1e-146  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.87078  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  45.88 
 
 		 684 aa  513  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000238485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0079  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  45.67 
 
 		 683 aa  512  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248487  decreased coverage  0.0000000000235888 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0479  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  44.01 
 
 		 688 aa  513  1e-144  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0076  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  45.4 
 
 		 684 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000133889  normal  0.112381 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.8 
 
 		 689 aa  510  1e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000111985 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.64 
 
 		 689 aa  509  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0060  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  45.11 
 
 		 684 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000538802 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0076  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  45.39 
 
 		 683 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.589695  hitchhiker  0.000000000290731 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  44.87 
 
 		 689 aa  503  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  42.66 
 
 		 692 aa  503  1e-141  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.7 
 
 		 694 aa  502  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  45.15 
 
 		 684 aa  504  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3931  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.69 
 
 		 689 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3977  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.69 
 
 		 689 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4037  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.69 
 
 		 689 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.414013 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2965  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  44.52 
 
 		 688 aa  499  1e-140  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.425514  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3849  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.55 
 
 		 689 aa  497  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3255  Glycine--tRNA ligase  44.16 
 
 		 696 aa  497  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3868  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.4 
 
 		 689 aa  498  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0185  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  43.97 
 
 		 684 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.64 
 
 		 689 aa  495  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736647 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0011  glycine--tRNA ligase  43.84 
 
 		 693 aa  493  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.466423 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0038  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  42.7 
 
 		 693 aa  493  9.999999999999999e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.903555  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0011  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.83 
 
 		 684 aa  489  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4934  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  41.84 
 
 		 689 aa  490  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.711684 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0070  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  42.7 
 
 		 689 aa  491  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.118047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  47.03 
 
 		 685 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3881  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  41.84 
 
 		 689 aa  491  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0163  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  42.41 
 
 		 689 aa  492  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4054  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  41.84 
 
 		 689 aa  489  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03410  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  41.7 
 
 		 689 aa  488  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0152  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  41.7 
 
 		 689 aa  488  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00100  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  44.37 
 
 		 685 aa  488  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3966  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  41.7 
 
 		 689 aa  487  1e-136  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03361  hypothetical protein  41.7 
 
 		 689 aa  488  1e-136  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  44.73 
 
 		 689 aa  487  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  44.73 
 
 		 689 aa  488  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0151663 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0014  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  42.94 
 
 		 689 aa  488  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000639104 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00090  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  46.47 
 
 		 684 aa  486  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3761  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  41.7 
 
 		 689 aa  488  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.677293  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0156  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  41.7 
 
 		 689 aa  488  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2210  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  42.6 
 
 		 697 aa  483  1e-135  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3782  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  42.62 
 
 		 689 aa  485  1e-135  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4130  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  42.62 
 
 		 689 aa  485  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0012  glycine--tRNA ligase  42.57 
 
 		 690 aa  484  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.948293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  44.12 
 
 		 694 aa  484  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.829353  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  44.59 
 
 		 689 aa  485  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000499537 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2574  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  45.39 
 
 		 693 aa  483  1e-135  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568144 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0023  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  42.62 
 
 		 689 aa  485  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  44.46 
 
 		 689 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4167  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  41.73 
 
 		 689 aa  479  1e-134  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4449  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  41.87 
 
 		 689 aa  481  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0025  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.93 
 
 		 689 aa  481  1e-134  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0144037 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0014  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  44.92 
 
 		 688 aa  478  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>