264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03829 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1013  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  65.1 
 
 		 722 aa  937    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.40504  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3982  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  75.97 
 
 		 691 aa  1016    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.295232 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0889  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  65.29 
 
 		 722 aa  939    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03829  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  100 
 
 		 745 aa  1484    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3255  Glycine--tRNA ligase  45.1 
 
 		 696 aa  566  1e-160  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0011  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.74 
 
 		 684 aa  558  1e-157  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0185  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  43.47 
 
 		 684 aa  551  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0355  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  42.14 
 
 		 690 aa  546  1e-154  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00100  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.07 
 
 		 685 aa  545  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0373  glycine--tRNA ligase  43.97 
 
 		 691 aa  541  9.999999999999999e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.87078  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  42.26 
 
 		 684 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000238485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0076  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  42.13 
 
 		 684 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000133889  normal  0.112381 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  42.74 
 
 		 684 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2051  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  43.43 
 
 		 692 aa  536  1e-151  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0060  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  42.13 
 
 		 684 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000538802 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0079  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  41.86 
 
 		 683 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248487  decreased coverage  0.0000000000235888 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0076  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  42.13 
 
 		 683 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.589695  hitchhiker  0.000000000290731 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0011  glycine--tRNA ligase  45.12 
 
 		 693 aa  525  1e-147  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.466423 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.44 
 
 		 685 aa  519  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3726  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  42.61 
 
 		 688 aa  520  1e-146  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.38 
 
 		 689 aa  509  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0012  glycine--tRNA ligase  40.32 
 
 		 690 aa  510  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.948293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  39.84 
 
 		 692 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0479  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  41.87 
 
 		 688 aa  506  9.999999999999999e-143  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00090  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  42.88 
 
 		 684 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  38.67 
 
 		 688 aa  505  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3881  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.94 
 
 		 689 aa  503  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03410  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.94 
 
 		 689 aa  501  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0152  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  40.94 
 
 		 689 aa  501  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4934  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.94 
 
 		 689 aa  501  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.711684 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  41.38 
 
 		 689 aa  500  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736647 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0156  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.94 
 
 		 689 aa  501  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4054  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.94 
 
 		 689 aa  501  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03361  hypothetical protein  40.94 
 
 		 689 aa  501  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3761  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.94 
 
 		 689 aa  501  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.677293  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.24 
 
 		 689 aa  502  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000111985 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0038  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  41.8 
 
 		 693 aa  501  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.903555  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3966  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.81 
 
 		 689 aa  498  1e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0163  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.67 
 
 		 689 aa  494  9.999999999999999e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  42.9 
 
 		 688 aa  495  9.999999999999999e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0061  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.87 
 
 		 689 aa  493  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4037  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.67 
 
 		 689 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.414013 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3931  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.81 
 
 		 689 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3977  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.81 
 
 		 689 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.51 
 
 		 694 aa  491  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3849  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.67 
 
 		 689 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3868  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.67 
 
 		 689 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0025  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  41.87 
 
 		 689 aa  487  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0144037 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2050  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  42.74 
 
 		 693 aa  485  1e-135  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.28 
 
 		 689 aa  483  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0014  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  39.57 
 
 		 689 aa  482  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000639104 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0023  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.46 
 
 		 689 aa  481  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4130  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.46 
 
 		 689 aa  481  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0043  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.51 
 
 		 694 aa  482  1e-134  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2574  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  43.31 
 
 		 693 aa  479  1e-134  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568144 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2210  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  38.74 
 
 		 697 aa  479  1e-134  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2965  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.68 
 
 		 688 aa  480  1e-134  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.425514  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4449  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  39.57 
 
 		 689 aa  479  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3782  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.46 
 
 		 689 aa  481  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0207  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  39.68 
 
 		 692 aa  478  1e-133  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2116  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  39.68 
 
 		 689 aa  477  1e-133  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.14 
 
 		 694 aa  476  1e-133  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.829353  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4167  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  39.84 
 
 		 689 aa  479  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.42 
 
 		 689 aa  475  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.28 
 
 		 689 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.84 
 
 		 689 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000499537 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.7 
 
 		 689 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0151663 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0014  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  41.07 
 
 		 688 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2055  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  38.54 
 
 		 697 aa  468  9.999999999999999e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.35855  normal  0.503298 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  39.81 
 
 		 692 aa  467  9.999999999999999e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0555063  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2499  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  41.08 
 
 		 688 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0070  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  39.78 
 
 		 689 aa  460  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.118047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1221  glycine--tRNA ligase  40.5 
 
 		 696 aa  457  1e-127  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1773  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.74 
 
 		 697 aa  456  1e-127  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0663369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0686  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  41.06 
 
 		 699 aa  456  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0016  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  41.4 
 
 		 688 aa  457  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000327788 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1803  glycyl-tRNA synthetase beta chain  38.25 
 
 		 688 aa  454  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  41.12 
 
 		 688 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000120926 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  41.12 
 
 		 688 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0446  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  41.16 
 
 		 707 aa  451  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002000  glycyl-tRNA synthetase beta chain  40.28 
 
 		 688 aa  452  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1804  glycyl-tRNA synthetase beta chain  37.97 
 
 		 688 aa  447  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00449  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  39.86 
 
 		 693 aa  447  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3535  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  40.6 
 
 		 712 aa  442  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.028288 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0507  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  41.45 
 
 		 710 aa  443  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.524717  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0415  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  39.7 
 
 		 697 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474954  normal  0.979484 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0400  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  39.7 
 
 		 697 aa  442  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.543468 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0544  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  40.08 
 
 		 720 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4013  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.79 
 
 		 699 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.454838  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0524  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.24 
 
 		 697 aa  438  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0189981 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0405  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.3 
 
 		 699 aa  436  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.721596  normal  0.352354 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0550  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  38.96 
 
 		 739 aa  429  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0716  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.24 
 
 		 699 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0218  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.24 
 
 		 699 aa  428  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0881  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.24 
 
 		 699 aa  428  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.59966  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2350  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.24 
 
 		 699 aa  428  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0701  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.24 
 
 		 699 aa  428  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2430  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.24 
 
 		 699 aa  428  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.726931  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2728  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.24 
 
 		 699 aa  428  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0644  glycine--tRNA ligase  39 
 
 		 708 aa  425  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>