263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCI_0160 on replicon NC_007984
Organism: Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03410  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  55.27 
 
 
689 aa  783    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0152  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  55.27 
 
 
689 aa  783    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4167  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  53.97 
 
 
689 aa  785    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  49.35 
 
 
689 aa  682    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00736647 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4037  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  54.4 
 
 
689 aa  768    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.414013 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  50.15 
 
 
689 aa  659    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0014  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  50.58 
 
 
688 aa  656    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  50.15 
 
 
689 aa  656    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000499537 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03361  hypothetical protein  55.27 
 
 
689 aa  783    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3782  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  54.69 
 
 
689 aa  792    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2965  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  51.16 
 
 
688 aa  693    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.425514  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4449  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  54.69 
 
 
689 aa  794    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3868  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  54.26 
 
 
689 aa  764    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0156  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  55.27 
 
 
689 aa  783    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3966  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  54.98 
 
 
689 aa  780    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  50.44 
 
 
689 aa  662    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0151663 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3881  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  55.27 
 
 
689 aa  785    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0023  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  54.69 
 
 
689 aa  792    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3931  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  54.4 
 
 
689 aa  768    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  50 
 
 
689 aa  659    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  50 
 
 
689 aa  654    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  48.69 
 
 
689 aa  667    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000111985 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  49.93 
 
 
694 aa  649    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.829353  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4130  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  54.69 
 
 
689 aa  792    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0160  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  100 
 
 
699 aa  1431    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00449  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  48.63 
 
 
693 aa  644    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002000  glycyl-tRNA synthetase beta chain  48.55 
 
 
688 aa  645    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  47.76 
 
 
692 aa  644    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3761  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  55.27 
 
 
689 aa  783    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.677293  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0479  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  50.22 
 
 
688 aa  694    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4934  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  55.12 
 
 
689 aa  782    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.711684 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  50.58 
 
 
688 aa  646    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000120926 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  50.58 
 
 
688 aa  647    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  49.64 
 
 
694 aa  670    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4054  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  55.12 
 
 
689 aa  783    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0043  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  54.87 
 
 
694 aa  783    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0070  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  54.11 
 
 
689 aa  788    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.118047  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0014  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  48.84 
 
 
689 aa  649    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000639104 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  49.71 
 
 
689 aa  677    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0016  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  50.58 
 
 
688 aa  647    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000327788 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2499  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  49.56 
 
 
688 aa  666    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0025  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  50.07 
 
 
689 aa  677    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0144037 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3726  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  49.13 
 
 
688 aa  669    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3977  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  54.4 
 
 
689 aa  768    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3849  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  54.26 
 
 
689 aa  766    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0061  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  55.27 
 
 
689 aa  791    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0163  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  55.84 
 
 
689 aa  790    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  44.16 
 
 
688 aa  590  1e-167  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.76 
 
 
692 aa  562  1.0000000000000001e-159  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0555063  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3255  Glycine--tRNA ligase  40.89 
 
 
696 aa  551  1e-155  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0373  glycine--tRNA ligase  40.93 
 
 
691 aa  547  1e-154  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.87078  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2210  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.92 
 
 
697 aa  535  1e-150  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  41.27 
 
 
684 aa  526  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0038  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  41.61 
 
 
693 aa  525  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.903555  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0011  glycine--tRNA ligase  40.61 
 
 
693 aa  517  1.0000000000000001e-145  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.466423 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1773  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.94 
 
 
697 aa  513  1e-144  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0663369  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0355  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  39.74 
 
 
690 aa  513  1e-144  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2051  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  39.66 
 
 
692 aa  508  9.999999999999999e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0076  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  39.97 
 
 
684 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000133889  normal  0.112381 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0060  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.12 
 
 
684 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000538802 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0012  glycine--tRNA ligase  39.24 
 
 
690 aa  503  1e-141  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.948293  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0185  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  40.55 
 
 
684 aa  501  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.61 
 
 
684 aa  502  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000238485  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2055  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.8 
 
 
697 aa  502  1e-140  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.35855  normal  0.503298 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0011  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  39.97 
 
 
684 aa  498  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.29 
 
 
685 aa  496  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00100  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  39.14 
 
 
685 aa  496  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0079  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  39.83 
 
 
683 aa  498  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248487  decreased coverage  0.0000000000235888 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0076  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  39.39 
 
 
683 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.589695  hitchhiker  0.000000000290731 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2116  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.69 
 
 
689 aa  491  1e-137  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0207  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.55 
 
 
692 aa  491  1e-137  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00090  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40 
 
 
684 aa  489  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  38.96 
 
 
688 aa  484  1e-135  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2574  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  38.81 
 
 
693 aa  466  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00568144 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2050  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  39.36 
 
 
693 aa  464  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1803  glycyl-tRNA synthetase beta chain  37.68 
 
 
688 aa  462  9.999999999999999e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1804  glycyl-tRNA synthetase beta chain  37.83 
 
 
688 aa  459  9.999999999999999e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1221  glycine--tRNA ligase  36.57 
 
 
696 aa  444  1e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0686  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  38.35 
 
 
699 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509477  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0405  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  38.22 
 
 
699 aa  431  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.721596  normal  0.352354 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0415  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.07 
 
 
697 aa  420  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474954  normal  0.979484 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0400  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.94 
 
 
697 aa  421  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.543468 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4013  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.54 
 
 
699 aa  419  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.454838  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3059  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.84 
 
 
687 aa  419  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2702  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.63 
 
 
699 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0207133  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2090  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.48 
 
 
699 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339656  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0524  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.22 
 
 
697 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0189981 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0871  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  37.23 
 
 
695 aa  405  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.306102  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0881  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.32 
 
 
699 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.59966  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2941  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.75 
 
 
686 aa  404  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.125162  hitchhiker  0.000287233 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1022  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.52 
 
 
687 aa  405  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.208045  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0584  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.67 
 
 
699 aa  405  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0716  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.32 
 
 
699 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2729  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.63 
 
 
699 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0597  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.63 
 
 
699 aa  404  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03829  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.84 
 
 
745 aa  402  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0218  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.32 
 
 
699 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2350  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.32 
 
 
699 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0599  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.54 
 
 
688 aa  402  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487119  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2728  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.32 
 
 
699 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>