263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0524 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009074  BURPS668_0701  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  64.38 
 
 		 699 aa  837    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0686  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  65.11 
 
 		 699 aa  862    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2350  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  64.38 
 
 		 699 aa  836    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0524  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  100 
 
 		 697 aa  1397    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0189981 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2430  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  64.38 
 
 		 699 aa  836    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.726931  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1864  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  56.8 
 
 		 712 aa  756    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0218  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  64.38 
 
 		 699 aa  836    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3535  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  55.08 
 
 		 712 aa  713    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.028288 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0507  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  73.54 
 
 		 710 aa  957    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.524717  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2347  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  55.37 
 
 		 701 aa  652    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.501634 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0405  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  65.55 
 
 		 699 aa  863    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.721596  normal  0.352354 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0881  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  64.38 
 
 		 699 aa  836    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.59966  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2729  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  65.11 
 
 		 699 aa  841    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6029  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  65.26 
 
 		 699 aa  840    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3380  glycine--tRNA ligase  56.42 
 
 		 705 aa  682    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0350484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0215  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  54.13 
 
 		 713 aa  641    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.101783 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1289  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  55.23 
 
 		 704 aa  682    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.708462 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0716  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  64.23 
 
 		 699 aa  833    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0550  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  51.05 
 
 		 739 aa  646    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0584  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  65.31 
 
 		 699 aa  844    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0597  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  65.84 
 
 		 699 aa  847    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2163  glycine--tRNA ligase  52.2 
 
 		 718 aa  647    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.669407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3695  glycine--tRNA ligase  52.02 
 
 		 744 aa  654    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.641842  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0644  glycine--tRNA ligase  54.35 
 
 		 708 aa  689    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4202  glycine--tRNA ligase  54.81 
 
 		 731 aa  681    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4013  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  64.82 
 
 		 699 aa  843    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.454838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0415  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  89.47 
 
 		 697 aa  1247    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474954  normal  0.979484 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0446  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  73.86 
 
 		 707 aa  1005    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2090  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  65.26 
 
 		 699 aa  853    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339656  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0544  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  54.16 
 
 		 720 aa  691    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2619  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  65.26 
 
 		 699 aa  830    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2754  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  65.55 
 
 		 699 aa  832    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.200754  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1568  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  56.66 
 
 		 712 aa  766    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.269615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2702  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  65.26 
 
 		 699 aa  855    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0207133  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0400  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  89.47 
 
 		 697 aa  1244    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.543468 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4743  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  55.92 
 
 		 712 aa  690    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4177  glycine--tRNA ligase  54.94 
 
 		 708 aa  681    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.787875  normal  0.54331 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0444  glycine--tRNA ligase  53.8 
 
 		 711 aa  673    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0906989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0528  glycine--tRNA ligase  53.74 
 
 		 720 aa  672    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0942391 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2728  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  64.38 
 
 		 699 aa  836    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0871  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  54.44 
 
 		 695 aa  622  1e-177  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.306102  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3881  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  46 
 
 		 689 aa  569  1e-161  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03410  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  45.86 
 
 		 689 aa  565  1e-160  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0152  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  45.86 
 
 		 689 aa  565  1e-160  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4934  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  46 
 
 		 689 aa  567  1e-160  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.711684 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03361  hypothetical protein  45.86 
 
 		 689 aa  565  1e-160  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3761  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  45.86 
 
 		 689 aa  565  1e-160  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.677293  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0479  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  45.11 
 
 		 688 aa  565  1e-160  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0156  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  45.86 
 
 		 689 aa  565  1e-160  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4054  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  46 
 
 		 689 aa  566  1e-160  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3966  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  45.86 
 
 		 689 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0043  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  46.68 
 
 		 694 aa  556  1e-157  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4449  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  45.35 
 
 		 689 aa  555  1e-157  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4167  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  45.64 
 
 		 689 aa  555  1e-157  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0070  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  45.69 
 
 		 689 aa  556  1e-157  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.118047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3255  Glycine--tRNA ligase  45.62 
 
 		 696 aa  549  1e-155  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0373  glycine--tRNA ligase  44.19 
 
 		 691 aa  550  1e-155  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.87078  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0023  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  44.97 
 
 		 689 aa  548  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4130  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  44.97 
 
 		 689 aa  548  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3782  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  44.97 
 
 		 689 aa  548  1e-154  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0061  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  45.58 
 
 		 689 aa  547  1e-154  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0163  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  44.71 
 
 		 689 aa  546  1e-154  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3868  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  45 
 
 		 689 aa  542  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3931  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  45 
 
 		 689 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0012  glycine--tRNA ligase  44.76 
 
 		 690 aa  542  1e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.948293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3849  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  45 
 
 		 689 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3977  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  45 
 
 		 689 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4037  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  44.86 
 
 		 689 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.414013 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  42.18 
 
 		 692 aa  535  1e-151  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2965  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  44.7 
 
 		 688 aa  536  1e-151  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.425514  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3726  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  43.82 
 
 		 688 aa  536  1e-151  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0355  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  42.88 
 
 		 690 aa  534  1e-150  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  45.19 
 
 		 684 aa  527  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0076  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  44.11 
 
 		 684 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000133889  normal  0.112381 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.73 
 
 		 689 aa  520  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000111985 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0038  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  44.84 
 
 		 693 aa  521  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.903555  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.53 
 
 		 689 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0060  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.97 
 
 		 684 aa  515  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000538802 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  44.03 
 
 		 684 aa  513  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000238485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  44.56 
 
 		 689 aa  512  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736647 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0025  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  45.29 
 
 		 689 aa  514  1e-144  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0144037 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0076  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.31 
 
 		 683 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.589695  hitchhiker  0.000000000290731 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0185  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  43.47 
 
 		 684 aa  510  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0079  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.45 
 
 		 683 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248487  decreased coverage  0.0000000000235888 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2210  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  41.83 
 
 		 697 aa  512  1e-143  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  45.9 
 
 		 685 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.52 
 
 		 694 aa  510  1e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2499  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  44.6 
 
 		 688 aa  511  1e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0011  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.04 
 
 		 684 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0014  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.51 
 
 		 689 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000639104 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00090  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  45.32 
 
 		 684 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  44.14 
 
 		 689 aa  499  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  44.67 
 
 		 694 aa  502  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.829353  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.57 
 
 		 692 aa  501  1e-140  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0555063  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00100  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.63 
 
 		 685 aa  501  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0011  glycine--tRNA ligase  44.19 
 
 		 693 aa  500  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.466423 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.75 
 
 		 688 aa  491  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.92 
 
 		 689 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  44.43 
 
 		 689 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0151663 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  44.43 
 
 		 689 aa  490  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000499537 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>