263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0707 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0632  glycine--tRNA ligase  50 
 
 
661 aa  673    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.563385  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0731  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  96.58 
 
 
672 aa  1324    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1054  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  50.9 
 
 
672 aa  676    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000126783  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0707  glycine--tRNA ligase  100 
 
 
672 aa  1360    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1092  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  41.45 
 
 
689 aa  521  1e-146  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2472  glycine--tRNA ligase  35.56 
 
 
695 aa  426  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0180526  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3047  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34 
 
 
698 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.228214  normal  0.0284837 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1733  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  37.3 
 
 
690 aa  404  1e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0485  glycine--tRNA ligase  34.69 
 
 
688 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4254  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.69 
 
 
690 aa  399  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12440  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.53 
 
 
686 aa  397  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3372  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.42 
 
 
705 aa  397  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.173732  normal  0.25449 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0604  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.53 
 
 
694 aa  395  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2445  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.61 
 
 
694 aa  394  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3059  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.77 
 
 
687 aa  395  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0579  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.74 
 
 
687 aa  391  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1712  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.38 
 
 
702 aa  391  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00327927  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2941  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.91 
 
 
686 aa  389  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.125162  hitchhiker  0.000287233 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0355  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.43 
 
 
690 aa  376  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3672  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.58 
 
 
688 aa  379  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0142363  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1208  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.43 
 
 
693 aa  378  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0414092  normal  0.146925 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1022  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.05 
 
 
687 aa  375  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.208045  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0270  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.2 
 
 
679 aa  375  1e-102  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0656  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.63 
 
 
687 aa  373  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70031e-23 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0599  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.84 
 
 
688 aa  372  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487119  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1515  glycine--tRNA ligase  33.14 
 
 
688 aa  367  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1053  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.67 
 
 
678 aa  367  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3255  Glycine--tRNA ligase  31.74 
 
 
696 aa  364  2e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0642  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.97 
 
 
687 aa  363  7.0000000000000005e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.91532  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3935  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.87 
 
 
680 aa  360  3e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000397713  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2388  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.78 
 
 
711 aa  360  4e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0794  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.38 
 
 
716 aa  360  4e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.934108  normal  0.0595481 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2337  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.78 
 
 
711 aa  360  4e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4816  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.28 
 
 
717 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.642859 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0741  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.62 
 
 
691 aa  358  1.9999999999999998e-97  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.143146  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0335  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33 
 
 
687 aa  355  2e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1115  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.87 
 
 
690 aa  354  2e-96  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.217479  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00370  glycyl-tRNA synthetase, tetrameric type, beta subunit  31.5 
 
 
694 aa  352  1e-95  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.740961  hitchhiker  0.00000247045 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.71 
 
 
688 aa  350  6e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1306  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.09 
 
 
701 aa  349  8e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0012  glycine--tRNA ligase  31.99 
 
 
690 aa  348  2e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.948293  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0011  glycine--tRNA ligase  32.9 
 
 
693 aa  347  3e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.466423 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2033  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  29.87 
 
 
696 aa  347  6e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00144588  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1686  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.75 
 
 
696 aa  346  8e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.78284  normal  0.0276337 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2554  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.81 
 
 
701 aa  346  8.999999999999999e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100286  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2650  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.81 
 
 
701 aa  346  8.999999999999999e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1193  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.99 
 
 
685 aa  345  2e-93  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1385  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.04 
 
 
696 aa  344  2.9999999999999997e-93  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.036221  normal  0.597652 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0018  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.94 
 
 
728 aa  343  5e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.606807 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11030  glycyl-tRNA synthetase, tetrameric type, beta subunit  31.75 
 
 
694 aa  342  1e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000604533 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4481  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.66 
 
 
719 aa  341  2e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.731924  normal  0.0858499 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0994  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.57 
 
 
689 aa  341  2.9999999999999998e-92  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.18697  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1061  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.24 
 
 
691 aa  340  4e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00100  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.36 
 
 
685 aa  340  5e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0373  glycine--tRNA ligase  30.91 
 
 
691 aa  340  7e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.87078  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0038  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.07 
 
 
693 aa  338  9.999999999999999e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.903555  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2459  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.57 
 
 
697 aa  337  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4587  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.9 
 
 
731 aa  337  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2210  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.94 
 
 
697 aa  335  1e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1804  glycyl-tRNA synthetase beta chain  32.18 
 
 
688 aa  335  1e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0540  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.31 
 
 
678 aa  335  2e-90  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.792152  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3726  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  29.9 
 
 
688 aa  334  3e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1803  glycyl-tRNA synthetase beta chain  32.03 
 
 
688 aa  333  4e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2984  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.19 
 
 
733 aa  334  4e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  29.28 
 
 
684 aa  333  6e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000238485  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0601  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.69 
 
 
664 aa  333  7.000000000000001e-90  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1319  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.95 
 
 
689 aa  332  1e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  28.18 
 
 
684 aa  332  1e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1248  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.7 
 
 
664 aa  332  2e-89  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.295288  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.54 
 
 
692 aa  331  2e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1773  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.65 
 
 
697 aa  331  3e-89  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0663369  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0076  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  29.65 
 
 
684 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000133889  normal  0.112381 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0043  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.02 
 
 
672 aa  329  8e-89  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.778368  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2051  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.86 
 
 
692 aa  329  1.0000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.71 
 
 
692 aa  329  1.0000000000000001e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0555063  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0060  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  29.8 
 
 
684 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000538802 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1374  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.41 
 
 
673 aa  328  2.0000000000000001e-88  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.84 
 
 
685 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0491  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.45 
 
 
664 aa  328  3e-88  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.190343  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0079  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  29.51 
 
 
683 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248487  decreased coverage  0.0000000000235888 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0826  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.31 
 
 
671 aa  327  4.0000000000000003e-88  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0218666  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0076  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  29.65 
 
 
683 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.589695  hitchhiker  0.000000000290731 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0991  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.18 
 
 
673 aa  327  5e-88  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2055  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.5 
 
 
697 aa  327  5e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.35855  normal  0.503298 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1369  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.46 
 
 
664 aa  326  8.000000000000001e-88  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.183834  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2050  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.37 
 
 
693 aa  323  8e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3881  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.4 
 
 
689 aa  323  9.000000000000001e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4934  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.26 
 
 
689 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.711684 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0694  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.56 
 
 
695 aa  322  1.9999999999999998e-86  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.7209  hitchhiker  0.0000422359 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03410  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.26 
 
 
689 aa  321  3e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0152  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.26 
 
 
689 aa  321  3e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03361  hypothetical protein  30.26 
 
 
689 aa  321  3e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1013  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.27 
 
 
722 aa  321  3e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.40504  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0156  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.26 
 
 
689 aa  321  3e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3761  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.26 
 
 
689 aa  321  3e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.677293  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4054  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.26 
 
 
689 aa  320  5e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00090  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.1 
 
 
684 aa  320  6e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2574  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.12 
 
 
693 aa  319  1e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00568144 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3966  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.26 
 
 
689 aa  319  1e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0011  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  28.4 
 
 
684 aa  318  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>