263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0270 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0270  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  100 
 
 
679 aa  1379    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0741  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  49.78 
 
 
691 aa  672    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.143146  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1197  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  51.54 
 
 
673 aa  686    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.28917  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1115  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  49.03 
 
 
690 aa  643    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.217479  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0540  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  75.55 
 
 
678 aa  1013    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.792152  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1193  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  48.28 
 
 
685 aa  615  1e-175  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0994  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  45.35 
 
 
689 aa  557  1e-157  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.18697  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4254  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  39.71 
 
 
690 aa  509  1e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3047  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  39.94 
 
 
698 aa  488  1e-136  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.228214  normal  0.0284837 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1733  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  38.71 
 
 
690 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3059  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  38.48 
 
 
687 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3372  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  38.9 
 
 
705 aa  466  9.999999999999999e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.173732  normal  0.25449 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1022  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  38.67 
 
 
687 aa  465  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.208045  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0485  glycine--tRNA ligase  38.39 
 
 
688 aa  460  9.999999999999999e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2472  glycine--tRNA ligase  38.17 
 
 
695 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0180526  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0656  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.9 
 
 
687 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70031e-23 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3672  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.81 
 
 
688 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0142363  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0579  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.77 
 
 
687 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0599  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.43 
 
 
688 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487119  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2941  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.88 
 
 
686 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.125162  hitchhiker  0.000287233 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0642  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.48 
 
 
687 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.91532  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0604  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.29 
 
 
694 aa  445  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12440  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  37.28 
 
 
686 aa  440  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1208  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  38.18 
 
 
693 aa  441  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0414092  normal  0.146925 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0335  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  37.66 
 
 
687 aa  438  1e-121  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2445  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.9 
 
 
694 aa  435  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1515  glycine--tRNA ligase  37.45 
 
 
688 aa  422  1e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1061  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  37.16 
 
 
691 aa  413  1e-114  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1091  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.74 
 
 
668 aa  412  1e-113  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1712  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.78 
 
 
702 aa  410  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00327927  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3935  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  37.54 
 
 
680 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000397713  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2388  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.41 
 
 
711 aa  402  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.51 
 
 
684 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000238485  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2337  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.41 
 
 
711 aa  402  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0018  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.5 
 
 
728 aa  397  1e-109  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.606807 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1385  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.35 
 
 
696 aa  393  1e-108  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.036221  normal  0.597652 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3255  Glycine--tRNA ligase  35.79 
 
 
696 aa  394  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11030  glycyl-tRNA synthetase, tetrameric type, beta subunit  35.72 
 
 
694 aa  394  1e-108  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000604533 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00370  glycyl-tRNA synthetase, tetrameric type, beta subunit  35.3 
 
 
694 aa  394  1e-108  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.740961  hitchhiker  0.00000247045 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.12 
 
 
692 aa  395  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0555063  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.12 
 
 
684 aa  389  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0794  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.97 
 
 
716 aa  390  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.934108  normal  0.0595481 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0355  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.97 
 
 
690 aa  392  1e-107  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4816  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.39 
 
 
717 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.642859 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1441  glycine--tRNA ligase  34.43 
 
 
700 aa  392  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.764176  normal  0.147312 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3726  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.23 
 
 
688 aa  390  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1319  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.48 
 
 
689 aa  386  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0731  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.93 
 
 
672 aa  386  1e-106  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0076  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.48 
 
 
684 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000133889  normal  0.112381 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0707  glycine--tRNA ligase  34.78 
 
 
672 aa  388  1e-106  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1374  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.58 
 
 
673 aa  384  1e-105  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0060  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.05 
 
 
684 aa  382  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000538802 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0185  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.76 
 
 
684 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0043  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.47 
 
 
672 aa  382  1e-104  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.778368  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4481  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.1 
 
 
719 aa  381  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.731924  normal  0.0858499 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00090  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.97 
 
 
684 aa  382  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0993  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.91 
 
 
693 aa  377  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0011  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.58 
 
 
684 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1053  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.25 
 
 
678 aa  376  1e-103  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0012  glycine--tRNA ligase  36.14 
 
 
690 aa  379  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.948293  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0079  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.91 
 
 
683 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248487  decreased coverage  0.0000000000235888 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00100  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.63 
 
 
685 aa  377  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.47 
 
 
692 aa  376  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0011  glycine--tRNA ligase  35.28 
 
 
693 aa  377  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.466423 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.73 
 
 
685 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1803  glycyl-tRNA synthetase beta chain  34.38 
 
 
688 aa  375  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0076  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.76 
 
 
683 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.589695  hitchhiker  0.000000000290731 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2499  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.4 
 
 
688 aa  369  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1248  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.96 
 
 
664 aa  370  1e-101  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.295288  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2210  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.72 
 
 
697 aa  367  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1369  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.96 
 
 
664 aa  368  1e-100  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.183834  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1804  glycyl-tRNA synthetase beta chain  33.93 
 
 
688 aa  366  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0916  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34 
 
 
694 aa  368  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1686  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.33 
 
 
696 aa  367  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.78284  normal  0.0276337 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0038  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.63 
 
 
693 aa  368  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.903555  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1266  glycine--tRNA ligase  34.28 
 
 
696 aa  366  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0491  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.94 
 
 
664 aa  366  1e-99  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.190343  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2984  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.92 
 
 
733 aa  365  1e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.76 
 
 
689 aa  365  2e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1246  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.01 
 
 
674 aa  364  3e-99  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.78 
 
 
689 aa  364  3e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00736647 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0291  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.33 
 
 
701 aa  364  3e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265784 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0601  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.49 
 
 
664 aa  363  5.0000000000000005e-99  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8726  Glycine--tRNA ligase  33.83 
 
 
991 aa  363  6e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2033  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.72 
 
 
696 aa  362  9e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00144588  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.59 
 
 
689 aa  362  2e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000111985 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.99 
 
 
689 aa  362  2e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1773  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.38 
 
 
697 aa  361  3e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0663369  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.64 
 
 
688 aa  360  3e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0479  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.58 
 
 
688 aa  361  3e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.43 
 
 
694 aa  360  3e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2055  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.19 
 
 
697 aa  360  4e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.35855  normal  0.503298 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2050  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.95 
 
 
693 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3881  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.51 
 
 
689 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2965  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.54 
 
 
688 aa  358  9.999999999999999e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.425514  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002000  glycyl-tRNA synthetase beta chain  35.07 
 
 
688 aa  358  1.9999999999999998e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03410  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.65 
 
 
689 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0152  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.65 
 
 
689 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3761  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.65 
 
 
689 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.677293  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0156  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.65 
 
 
689 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>