263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1091 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3935  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  56.78 
 
 
680 aa  749    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000397713  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1091  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  100 
 
 
668 aa  1321    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3047  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  38.92 
 
 
698 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.228214  normal  0.0284837 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0604  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.5 
 
 
694 aa  445  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2472  glycine--tRNA ligase  35.62 
 
 
695 aa  445  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0180526  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1022  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.6 
 
 
687 aa  445  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.208045  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1733  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.42 
 
 
690 aa  436  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3059  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.83 
 
 
687 aa  436  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1515  glycine--tRNA ligase  35.66 
 
 
688 aa  429  1e-119  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0579  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.88 
 
 
687 aa  426  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4254  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.78 
 
 
690 aa  426  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0656  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.88 
 
 
687 aa  422  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70031e-23 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12440  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.13 
 
 
686 aa  421  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2941  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.85 
 
 
686 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.125162  hitchhiker  0.000287233 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3672  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.17 
 
 
688 aa  411  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0142363  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0642  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.03 
 
 
687 aa  411  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.91532  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0599  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.12 
 
 
688 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487119  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2445  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.89 
 
 
694 aa  406  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0270  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.39 
 
 
679 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3255  Glycine--tRNA ligase  33.04 
 
 
696 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0485  glycine--tRNA ligase  32.3 
 
 
688 aa  402  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0335  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.23 
 
 
687 aa  402  9.999999999999999e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3372  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.42 
 
 
705 aa  398  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.173732  normal  0.25449 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4816  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  39.17 
 
 
717 aa  395  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.642859 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2337  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.76 
 
 
711 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2388  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.76 
 
 
711 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2210  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.03 
 
 
697 aa  388  1e-106  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0993  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.41 
 
 
693 aa  386  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2033  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.02 
 
 
696 aa  385  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00144588  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1061  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.69 
 
 
691 aa  382  1e-105  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4481  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.47 
 
 
719 aa  383  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.731924  normal  0.0858499 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0373  glycine--tRNA ligase  31.37 
 
 
691 aa  381  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.87078  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1712  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.57 
 
 
702 aa  380  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00327927  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0794  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.94 
 
 
716 aa  373  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.934108  normal  0.0595481 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1208  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.86 
 
 
693 aa  375  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0414092  normal  0.146925 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0540  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.19 
 
 
678 aa  375  1e-102  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.792152  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1266  glycine--tRNA ligase  30.82 
 
 
696 aa  374  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0207  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.53 
 
 
692 aa  370  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1195  glycine--tRNA ligase, beta subunit  35.44 
 
 
729 aa  371  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1115  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.14 
 
 
690 aa  370  1e-101  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.217479  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0079  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.09 
 
 
683 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248487  decreased coverage  0.0000000000235888 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0012  glycine--tRNA ligase  31.11 
 
 
690 aa  367  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.948293  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2116  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.53 
 
 
689 aa  368  1e-100  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1319  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.98 
 
 
689 aa  368  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0076  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.64 
 
 
683 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.589695  hitchhiker  0.000000000290731 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1773  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.33 
 
 
697 aa  365  2e-99  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0663369  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0741  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.31 
 
 
691 aa  364  2e-99  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.143146  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0916  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.38 
 
 
694 aa  365  2e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1686  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.33 
 
 
696 aa  364  3e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.78284  normal  0.0276337 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0060  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.89 
 
 
684 aa  363  8e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000538802 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0018  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.13 
 
 
728 aa  362  1e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.606807 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0694  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.14 
 
 
695 aa  362  1e-98  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.7209  hitchhiker  0.0000422359 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1197  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.41 
 
 
673 aa  360  4e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.28917  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1221  glycine--tRNA ligase  30.26 
 
 
696 aa  360  5e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00370  glycyl-tRNA synthetase, tetrameric type, beta subunit  32.15 
 
 
694 aa  360  6e-98  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.740961  hitchhiker  0.00000247045 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.66 
 
 
684 aa  360  6e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3726  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.44 
 
 
688 aa  359  9e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00090  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.01 
 
 
684 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1193  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.36 
 
 
685 aa  357  3.9999999999999996e-97  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0076  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.15 
 
 
684 aa  356  8.999999999999999e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000133889  normal  0.112381 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.26 
 
 
692 aa  355  1e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.96 
 
 
685 aa  355  2e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0601  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.79 
 
 
664 aa  354  2.9999999999999997e-96  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1248  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.89 
 
 
664 aa  354  2.9999999999999997e-96  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.295288  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0011  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.81 
 
 
684 aa  353  4e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0491  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.9 
 
 
664 aa  353  7e-96  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.190343  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1374  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.67 
 
 
673 aa  352  8.999999999999999e-96  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1369  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.79 
 
 
664 aa  352  1e-95  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.183834  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0479  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.72 
 
 
688 aa  352  2e-95  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0291  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.59 
 
 
701 aa  350  5e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265784 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0043  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.49 
 
 
672 aa  349  9e-95  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.778368  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.37 
 
 
689 aa  348  1e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0355  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.06 
 
 
690 aa  349  1e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1246  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.35 
 
 
674 aa  348  2e-94  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1385  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.21 
 
 
696 aa  348  2e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.036221  normal  0.597652 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.3 
 
 
688 aa  347  4e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2055  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.97 
 
 
697 aa  347  4e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.35855  normal  0.503298 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.24 
 
 
689 aa  347  5e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000111985 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.05 
 
 
684 aa  346  7e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000238485  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.75 
 
 
692 aa  345  1e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0555063  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11030  glycyl-tRNA synthetase, tetrameric type, beta subunit  31.95 
 
 
694 aa  345  1e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000604533 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0185  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.97 
 
 
684 aa  344  2e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1441  glycine--tRNA ligase  29.88 
 
 
700 aa  345  2e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.764176  normal  0.147312 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2965  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.25 
 
 
688 aa  344  4e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.425514  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0011  glycine--tRNA ligase  29.93 
 
 
693 aa  343  4e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.466423 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1053  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.28 
 
 
678 aa  343  5e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1241  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  29.39 
 
 
720 aa  343  8e-93  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.232901  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2050  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.14 
 
 
693 aa  342  1e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2984  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.55 
 
 
733 aa  339  9e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0070  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.63 
 
 
689 aa  339  9.999999999999999e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.118047  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0991  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.9 
 
 
673 aa  339  9.999999999999999e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0994  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.28 
 
 
689 aa  339  9.999999999999999e-92  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.18697  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0038  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.25 
 
 
693 aa  338  1.9999999999999998e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.903555  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4934  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.08 
 
 
689 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.711684 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.79 
 
 
688 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00100  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.33 
 
 
685 aa  337  3.9999999999999995e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3849  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.08 
 
 
689 aa  337  5e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4587  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.33 
 
 
731 aa  336  7e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4054  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.93 
 
 
689 aa  336  7.999999999999999e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3881  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.93 
 
 
689 aa  336  7.999999999999999e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>