263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0991 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1374  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  50.07 
 
 
673 aa  644    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1369  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  49.48 
 
 
664 aa  649    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.183834  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1248  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  50.37 
 
 
664 aa  658    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.295288  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0991  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  100 
 
 
673 aa  1360    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0491  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  49.93 
 
 
664 aa  652    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.190343  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1504  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  57.25 
 
 
683 aa  787    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.878777  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0043  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  50.59 
 
 
672 aa  659    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.778368  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0601  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  48.58 
 
 
664 aa  632  1e-180  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1246  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  48.9 
 
 
674 aa  614  9.999999999999999e-175  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0826  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  47.7 
 
 
671 aa  599  1e-170  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0218666  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3255  Glycine--tRNA ligase  34.58 
 
 
696 aa  394  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0604  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.56 
 
 
694 aa  386  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1686  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.34 
 
 
696 aa  387  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.78284  normal  0.0276337 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0373  glycine--tRNA ligase  34.4 
 
 
691 aa  384  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.87078  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0011  glycine--tRNA ligase  35.27 
 
 
693 aa  383  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.466423 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0355  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.69 
 
 
690 aa  382  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.64 
 
 
689 aa  379  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00736647 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0185  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.49 
 
 
684 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.16 
 
 
689 aa  377  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000111985 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0012  glycine--tRNA ligase  34.78 
 
 
690 aa  376  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.948293  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2033  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.47 
 
 
696 aa  373  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00144588  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.5 
 
 
689 aa  375  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2581  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.59 
 
 
694 aa  374  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.595681  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2210  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.59 
 
 
694 aa  374  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.237877 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3047  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.82 
 
 
698 aa  375  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.228214  normal  0.0284837 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.86 
 
 
688 aa  370  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0011  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.77 
 
 
684 aa  371  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00100  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.62 
 
 
685 aa  370  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0025  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.5 
 
 
689 aa  371  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0144037 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2050  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  37.43 
 
 
693 aa  366  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2051  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.5 
 
 
692 aa  367  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2472  glycine--tRNA ligase  33.24 
 
 
695 aa  368  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0180526  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.44 
 
 
684 aa  368  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000238485  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0076  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.09 
 
 
683 aa  369  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.589695  hitchhiker  0.000000000290731 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.36 
 
 
688 aa  367  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3372  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.08 
 
 
705 aa  367  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.173732  normal  0.25449 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0079  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.24 
 
 
683 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248487  decreased coverage  0.0000000000235888 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0794  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.71 
 
 
716 aa  364  2e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.934108  normal  0.0595481 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4816  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.67 
 
 
717 aa  365  2e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.642859 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0579  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.02 
 
 
687 aa  363  4e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1803  glycyl-tRNA synthetase beta chain  34.15 
 
 
688 aa  362  1e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0076  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.76 
 
 
684 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000133889  normal  0.112381 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1733  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.58 
 
 
690 aa  362  1e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0993  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.2 
 
 
693 aa  361  2e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0485  glycine--tRNA ligase  33.24 
 
 
688 aa  362  2e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.24 
 
 
684 aa  361  2e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0599  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.2 
 
 
688 aa  360  5e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487119  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4481  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.81 
 
 
719 aa  359  8e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.731924  normal  0.0858499 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.99 
 
 
685 aa  359  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.67 
 
 
692 aa  359  9.999999999999999e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3726  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.62 
 
 
688 aa  358  9.999999999999999e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0060  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.61 
 
 
684 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000538802 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1195  glycine--tRNA ligase, beta subunit  33.15 
 
 
729 aa  358  1.9999999999999998e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3059  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.86 
 
 
687 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0014  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.04 
 
 
689 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000639104 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1804  glycyl-tRNA synthetase beta chain  34.01 
 
 
688 aa  357  3.9999999999999996e-97  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0207  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.6 
 
 
692 aa  357  5e-97  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00090  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.7 
 
 
684 aa  356  8.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.16 
 
 
694 aa  355  1e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2116  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.46 
 
 
689 aa  355  2e-96  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1385  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.53 
 
 
696 aa  353  4e-96  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.036221  normal  0.597652 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2210  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.29 
 
 
697 aa  354  4e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2337  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.91 
 
 
711 aa  353  5e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2388  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.91 
 
 
711 aa  353  5e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12440  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.76 
 
 
686 aa  352  1e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11030  glycyl-tRNA synthetase, tetrameric type, beta subunit  34.2 
 
 
694 aa  352  2e-95  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000604533 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1515  glycine--tRNA ligase  34.87 
 
 
688 aa  352  2e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0741  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.63 
 
 
691 aa  352  2e-95  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.143146  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0018  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.72 
 
 
728 aa  350  5e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.606807 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.48 
 
 
689 aa  349  9e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0151663 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0479  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.19 
 
 
688 aa  349  1e-94  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.43 
 
 
689 aa  349  1e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000499537 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1266  glycine--tRNA ligase  34.75 
 
 
696 aa  349  1e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.43 
 
 
689 aa  348  2e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2941  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.21 
 
 
686 aa  347  3e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.125162  hitchhiker  0.000287233 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.43 
 
 
689 aa  347  4e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2055  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.34 
 
 
697 aa  347  4e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.35855  normal  0.503298 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.94 
 
 
689 aa  347  4e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0038  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.33 
 
 
693 aa  346  7e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.903555  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1022  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.35 
 
 
687 aa  346  8e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.208045  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1773  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.81 
 
 
697 aa  345  1e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0663369  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.67 
 
 
694 aa  345  1e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.829353  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002000  glycyl-tRNA synthetase beta chain  33.24 
 
 
688 aa  344  2.9999999999999997e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2499  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.76 
 
 
688 aa  343  5e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0014  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.67 
 
 
688 aa  343  7e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00449  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.04 
 
 
693 aa  342  1e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0656  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.15 
 
 
687 aa  342  2e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70031e-23 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4449  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.31 
 
 
689 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4167  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.31 
 
 
689 aa  340  4e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00370  glycyl-tRNA synthetase, tetrameric type, beta subunit  32.76 
 
 
694 aa  338  9.999999999999999e-92  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.740961  hitchhiker  0.00000247045 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1091  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.9 
 
 
668 aa  339  9.999999999999999e-92  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1053  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.76 
 
 
678 aa  338  9.999999999999999e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2965  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.62 
 
 
688 aa  338  1.9999999999999998e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.425514  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2445  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.72 
 
 
694 aa  338  1.9999999999999998e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0163  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.8 
 
 
689 aa  337  5e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4037  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.07 
 
 
689 aa  336  7.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.414013 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0916  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.76 
 
 
694 aa  336  7.999999999999999e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3977  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.07 
 
 
689 aa  336  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3849  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.07 
 
 
689 aa  336  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3931  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.07 
 
 
689 aa  336  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>