263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1504 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1374  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  54.9 
 
 		 673 aa  723    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1369  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  50.52 
 
 		 664 aa  653    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.183834  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0991  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  57.25 
 
 		 673 aa  787    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1246  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  51.4 
 
 		 674 aa  655    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1248  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  50.81 
 
 		 664 aa  654    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.295288  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0491  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  50.52 
 
 		 664 aa  649    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.190343  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0043  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  55.65 
 
 		 672 aa  735    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.778368  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1504  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  100 
 
 		 683 aa  1387    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.878777  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0826  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  50.96 
 
 		 671 aa  645    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0218666  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0601  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  48.75 
 
 		 664 aa  625  1e-177  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1733  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.8 
 
 		 690 aa  393  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3047  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.81 
 
 		 698 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.228214  normal  0.0284837 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0485  glycine--tRNA ligase  35.5 
 
 		 688 aa  379  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1686  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.13 
 
 		 696 aa  377  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.78284  normal  0.0276337 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2472  glycine--tRNA ligase  33.99 
 
 		 695 aa  376  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0180526  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0604  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.89 
 
 		 694 aa  375  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3372  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.41 
 
 		 705 aa  371  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.173732  normal  0.25449 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0599  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.42 
 
 		 688 aa  371  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487119  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0993  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.57 
 
 		 693 aa  372  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12440  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.84 
 
 		 686 aa  363  6e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0794  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.87 
 
 		 716 aa  360  5e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.934108  normal  0.0595481 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.76 
 
 		 684 aa  360  6e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000238485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0656  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.32 
 
 		 687 aa  360  6e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70031e-23 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0185  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.06 
 
 		 684 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2033  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.13 
 
 		 696 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00144588  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0079  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.67 
 
 		 683 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248487  decreased coverage  0.0000000000235888 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0011  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.62 
 
 		 684 aa  357  5e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1022  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.96 
 
 		 687 aa  357  5e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.208045  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.42 
 
 		 685 aa  356  7.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0579  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.51 
 
 		 687 aa  355  2e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0018  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.91 
 
 		 728 aa  354  2e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.606807 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3059  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.43 
 
 		 687 aa  353  4e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0076  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.24 
 
 		 683 aa  352  2e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.589695  hitchhiker  0.000000000290731 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00090  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.99 
 
 		 684 aa  351  3e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0373  glycine--tRNA ligase  32.95 
 
 		 691 aa  350  6e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.87078  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00100  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.96 
 
 		 685 aa  350  7e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0642  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.18 
 
 		 687 aa  348  3e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.91532  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0479  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.24 
 
 		 688 aa  347  4e-94  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0076  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.19 
 
 		 684 aa  347  6e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000133889  normal  0.112381 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2337  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.34 
 
 		 711 aa  346  7e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2388  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.34 
 
 		 711 aa  346  7e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11030  glycyl-tRNA synthetase, tetrameric type, beta subunit  34.38 
 
 		 694 aa  344  2e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000604533 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0741  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.31 
 
 		 691 aa  345  2e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.143146  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.71 
 
 		 684 aa  345  2e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1515  glycine--tRNA ligase  33.38 
 
 		 688 aa  345  2e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0060  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.19 
 
 		 684 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000538802 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1441  glycine--tRNA ligase  32.71 
 
 		 700 aa  344  2.9999999999999997e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.764176  normal  0.147312 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0207  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.24 
 
 		 692 aa  343  5e-93  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2941  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.04 
 
 		 686 aa  343  8e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.125162  hitchhiker  0.000287233 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3255  Glycine--tRNA ligase  32.95 
 
 		 696 aa  342  1e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.24 
 
 		 692 aa  341  2e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2445  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.81 
 
 		 694 aa  342  2e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2116  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.09 
 
 		 689 aa  342  2e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1115  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.33 
 
 		 690 aa  341  2.9999999999999998e-92  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.217479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1195  glycine--tRNA ligase, beta subunit  33.93 
 
 		 729 aa  340  7e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4481  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.7 
 
 		 719 aa  338  9.999999999999999e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.731924  normal  0.0858499 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0012  glycine--tRNA ligase  33.76 
 
 		 690 aa  337  2.9999999999999997e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.948293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3672  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.95 
 
 		 688 aa  336  7e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0142363  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0335  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.42 
 
 		 687 aa  336  9e-91  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2581  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.87 
 
 		 694 aa  335  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.595681  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2210  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.87 
 
 		 694 aa  335  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.237877 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0011  glycine--tRNA ligase  32.95 
 
 		 693 aa  335  1e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.466423 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34 
 
 		 688 aa  335  2e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0355  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.48 
 
 		 690 aa  334  3e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2984  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.31 
 
 		 733 aa  333  5e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2965  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.75 
 
 		 688 aa  333  7.000000000000001e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.425514  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1266  glycine--tRNA ligase  32.82 
 
 		 696 aa  332  1e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.38 
 
 		 689 aa  330  6e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000111985 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2050  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.76 
 
 		 693 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4254  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.41 
 
 		 690 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1803  glycyl-tRNA synthetase beta chain  33.43 
 
 		 688 aa  327  3e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1053  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.85 
 
 		 678 aa  327  4.0000000000000003e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4816  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.47 
 
 		 717 aa  326  7e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.642859 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0270  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.85 
 
 		 679 aa  325  1e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2554  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.53 
 
 		 701 aa  325  1e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100286  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.05 
 
 		 689 aa  325  2e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736647 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1804  glycyl-tRNA synthetase beta chain  33.43 
 
 		 688 aa  325  2e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1241  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.87 
 
 		 720 aa  324  3e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.232901  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1306  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.24 
 
 		 701 aa  324  4e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1061  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.14 
 
 		 691 aa  324  4e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2650  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.72 
 
 		 701 aa  324  4e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2210  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.96 
 
 		 697 aa  323  5e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0025  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.05 
 
 		 689 aa  323  6e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0144037 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3726  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.56 
 
 		 688 aa  322  9.999999999999999e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4449  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.23 
 
 		 689 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.43 
 
 		 689 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0291  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.52 
 
 		 701 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265784 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1228  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34 
 
 		 723 aa  320  5e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.315931 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0694  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.38 
 
 		 695 aa  320  5e-86  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.7209  hitchhiker  0.0000422359 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.14 
 
 		 694 aa  319  7.999999999999999e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03410  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.75 
 
 		 689 aa  318  2e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0152  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.75 
 
 		 689 aa  318  2e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03361  hypothetical protein  31.75 
 
 		 689 aa  318  2e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0707  glycine--tRNA ligase  32.71 
 
 		 672 aa  318  2e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0156  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.75 
 
 		 689 aa  318  2e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4054  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.09 
 
 		 689 aa  318  2e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3761  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.75 
 
 		 689 aa  318  2e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.677293  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3881  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.09 
 
 		 689 aa  318  2e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3931  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.61 
 
 		 689 aa  318  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3977  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.61 
 
 		 689 aa  318  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>