263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0826 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_0491  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  53.19 
 
 
664 aa  667    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.190343  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1369  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  53.12 
 
 
664 aa  665    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.183834  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0043  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  60.89 
 
 
672 aa  796    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.778368  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0601  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  53.05 
 
 
664 aa  667    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1248  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  53.72 
 
 
664 aa  674    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.295288  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1246  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  60.83 
 
 
674 aa  827    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1504  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  50.96 
 
 
683 aa  645    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.878777  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1374  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  59.91 
 
 
673 aa  790    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0826  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  100 
 
 
671 aa  1348    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0218666  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0991  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  47.7 
 
 
673 aa  599  1e-170  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3255  Glycine--tRNA ligase  33.43 
 
 
696 aa  381  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1515  glycine--tRNA ligase  35.6 
 
 
688 aa  377  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1733  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.83 
 
 
690 aa  374  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2033  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.24 
 
 
696 aa  367  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00144588  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1115  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.66 
 
 
690 aa  363  4e-99  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.217479  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3372  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.44 
 
 
705 aa  363  5.0000000000000005e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.173732  normal  0.25449 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0479  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.99 
 
 
688 aa  360  3e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2472  glycine--tRNA ligase  32.71 
 
 
695 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0180526  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0741  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.12 
 
 
691 aa  355  1e-96  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.143146  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.37 
 
 
692 aa  355  2e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3059  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.89 
 
 
687 aa  355  2e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0373  glycine--tRNA ligase  32.72 
 
 
691 aa  353  4e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.87078  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0355  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.81 
 
 
690 aa  353  5.9999999999999994e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3047  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.48 
 
 
698 aa  352  1e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.228214  normal  0.0284837 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2051  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.28 
 
 
692 aa  348  1e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0993  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.33 
 
 
693 aa  348  1e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0604  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.05 
 
 
694 aa  348  2e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1686  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.66 
 
 
696 aa  347  5e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.78284  normal  0.0276337 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0656  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.33 
 
 
687 aa  347  6e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70031e-23 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0076  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.62 
 
 
683 aa  346  8.999999999999999e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.589695  hitchhiker  0.000000000290731 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1266  glycine--tRNA ligase  33.38 
 
 
696 aa  346  8.999999999999999e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0270  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.43 
 
 
679 aa  345  1e-93  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.1 
 
 
684 aa  345  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000238485  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0599  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.86 
 
 
688 aa  345  1e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487119  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0079  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.33 
 
 
683 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248487  decreased coverage  0.0000000000235888 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3726  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.9 
 
 
688 aa  344  4e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1022  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.99 
 
 
687 aa  343  5.999999999999999e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.208045  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0076  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.57 
 
 
684 aa  343  7e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000133889  normal  0.112381 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0579  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.42 
 
 
687 aa  342  2e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0485  glycine--tRNA ligase  30.65 
 
 
688 aa  340  2.9999999999999998e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12440  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.14 
 
 
686 aa  339  9e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0060  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.43 
 
 
684 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000538802 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0207  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.91 
 
 
692 aa  337  5e-91  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.09 
 
 
685 aa  335  1e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2116  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.91 
 
 
689 aa  335  1e-90  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0185  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.43 
 
 
684 aa  335  2e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3881  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.37 
 
 
689 aa  335  2e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1091  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.43 
 
 
668 aa  335  2e-90  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4934  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.37 
 
 
689 aa  335  2e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.711684 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2445  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.85 
 
 
694 aa  334  3e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0011  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33 
 
 
684 aa  334  4e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2941  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.13 
 
 
686 aa  333  5e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.125162  hitchhiker  0.000287233 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0540  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.42 
 
 
678 aa  333  5e-90  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.792152  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03410  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.37 
 
 
689 aa  333  6e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0152  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.37 
 
 
689 aa  333  6e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0156  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.37 
 
 
689 aa  333  6e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3761  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.37 
 
 
689 aa  333  6e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.677293  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03361  hypothetical protein  31.37 
 
 
689 aa  333  6e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4054  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.22 
 
 
689 aa  333  7.000000000000001e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0642  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.19 
 
 
687 aa  333  8e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.91532  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3966  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.22 
 
 
689 aa  332  1e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2050  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.53 
 
 
693 aa  331  2e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0731  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.6 
 
 
672 aa  331  2e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.51 
 
 
684 aa  330  3e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00100  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.71 
 
 
685 aa  330  4e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0335  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33 
 
 
687 aa  330  4e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0916  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.62 
 
 
694 aa  330  5.0000000000000004e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.47 
 
 
688 aa  330  6e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0011  glycine--tRNA ligase  30.79 
 
 
693 aa  330  6e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.466423 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3849  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.8 
 
 
689 aa  329  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1193  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.36 
 
 
685 aa  329  1.0000000000000001e-88  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3868  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.8 
 
 
689 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0707  glycine--tRNA ligase  32.31 
 
 
672 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1197  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.01 
 
 
673 aa  327  6e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.28917  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0012  glycine--tRNA ligase  31.47 
 
 
690 aa  326  7e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.948293  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00090  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.1 
 
 
684 aa  326  7e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4037  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.8 
 
 
689 aa  326  8.000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.414013 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3977  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.8 
 
 
689 aa  326  9e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3931  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.8 
 
 
689 aa  326  9e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0038  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.32 
 
 
693 aa  326  1e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.903555  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0043  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.8 
 
 
694 aa  324  3e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2210  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.89 
 
 
697 aa  323  7e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.08 
 
 
692 aa  323  8e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0555063  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.57 
 
 
688 aa  323  9.000000000000001e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.49 
 
 
689 aa  323  9.000000000000001e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000111985 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0291  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33 
 
 
701 aa  322  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265784 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0070  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.54 
 
 
689 aa  320  3.9999999999999996e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.118047  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3935  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.67 
 
 
680 aa  321  3.9999999999999996e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000397713  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1053  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.33 
 
 
678 aa  320  6e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0061  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.88 
 
 
689 aa  320  7e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1195  glycine--tRNA ligase, beta subunit  30.72 
 
 
729 aa  320  7e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2581  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.61 
 
 
694 aa  320  7.999999999999999e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.595681  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2210  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.61 
 
 
694 aa  320  7.999999999999999e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.237877 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1441  glycine--tRNA ligase  30.06 
 
 
700 aa  319  9e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.764176  normal  0.147312 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.16 
 
 
689 aa  319  1e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00736647 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1208  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.04 
 
 
693 aa  319  1e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0414092  normal  0.146925 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1712  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.24 
 
 
702 aa  318  2e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00327927  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4449  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.16 
 
 
689 aa  318  3e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0163  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31 
 
 
689 aa  318  3e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2965  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.64 
 
 
688 aa  317  5e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.425514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>