263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1193 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0741  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  47.5 
 
 
691 aa  654    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.143146  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1197  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  49.71 
 
 
673 aa  679    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.28917  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0994  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  53.09 
 
 
689 aa  747    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.18697  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1193  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  100 
 
 
685 aa  1405    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0270  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  47.95 
 
 
679 aa  601  1e-170  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1115  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  45.35 
 
 
690 aa  601  1e-170  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.217479  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0540  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  46.29 
 
 
678 aa  570  1e-161  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.792152  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2472  glycine--tRNA ligase  39.55 
 
 
695 aa  479  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0180526  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0485  glycine--tRNA ligase  37.39 
 
 
688 aa  452  1.0000000000000001e-126  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1733  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  37.34 
 
 
690 aa  449  1e-125  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4254  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  37.88 
 
 
690 aa  450  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3059  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.61 
 
 
687 aa  452  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3047  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  37.41 
 
 
698 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.228214  normal  0.0284837 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1022  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.61 
 
 
687 aa  443  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.208045  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0599  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.16 
 
 
688 aa  436  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487119  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12440  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.37 
 
 
686 aa  437  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0604  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.21 
 
 
694 aa  429  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1208  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  37.21 
 
 
693 aa  428  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0414092  normal  0.146925 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0335  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.39 
 
 
687 aa  425  1e-117  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0656  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.18 
 
 
687 aa  419  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70031e-23 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2445  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.42 
 
 
694 aa  416  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0579  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.96 
 
 
687 aa  415  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2941  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.93 
 
 
686 aa  414  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.125162  hitchhiker  0.000287233 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3672  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.94 
 
 
688 aa  410  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0142363  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3372  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.88 
 
 
705 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.173732  normal  0.25449 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0642  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.18 
 
 
687 aa  409  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.91532  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1515  glycine--tRNA ligase  36.89 
 
 
688 aa  405  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11030  glycyl-tRNA synthetase, tetrameric type, beta subunit  36.06 
 
 
694 aa  396  1e-109  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000604533 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2210  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.19 
 
 
697 aa  394  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1319  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.49 
 
 
689 aa  394  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3255  Glycine--tRNA ligase  34.47 
 
 
696 aa  390  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0185  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.23 
 
 
684 aa  389  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.65 
 
 
684 aa  387  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0011  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.19 
 
 
684 aa  385  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0794  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.89 
 
 
716 aa  380  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.934108  normal  0.0595481 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0355  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.86 
 
 
690 aa  379  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2055  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.85 
 
 
697 aa  380  1e-104  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.35855  normal  0.503298 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4816  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.57 
 
 
717 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.642859 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0011  glycine--tRNA ligase  34.92 
 
 
693 aa  382  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.466423 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1061  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.95 
 
 
691 aa  381  1e-104  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0079  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.54 
 
 
683 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248487  decreased coverage  0.0000000000235888 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0076  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.45 
 
 
684 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000133889  normal  0.112381 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2033  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.29 
 
 
696 aa  374  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00144588  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0018  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.89 
 
 
728 aa  375  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.606807 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0060  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.01 
 
 
684 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000538802 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2554  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.05 
 
 
701 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100286  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1773  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.1 
 
 
697 aa  371  1e-101  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0663369  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1053  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.52 
 
 
678 aa  370  1e-101  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1686  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33 
 
 
696 aa  370  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.78284  normal  0.0276337 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0076  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.4 
 
 
683 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.589695  hitchhiker  0.000000000290731 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0012  glycine--tRNA ligase  34.7 
 
 
690 aa  369  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.948293  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4481  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.72 
 
 
719 aa  369  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.731924  normal  0.0858499 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2388  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.33 
 
 
711 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00100  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.62 
 
 
685 aa  368  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2337  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.33 
 
 
711 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.87 
 
 
685 aa  369  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00090  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.42 
 
 
684 aa  369  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2650  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.91 
 
 
701 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1441  glycine--tRNA ligase  33.14 
 
 
700 aa  365  1e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.764176  normal  0.147312 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1712  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.53 
 
 
702 aa  365  2e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00327927  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00370  glycyl-tRNA synthetase, tetrameric type, beta subunit  34.29 
 
 
694 aa  365  2e-99  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.740961  hitchhiker  0.00000247045 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0540  glycine--tRNA ligase  32.67 
 
 
685 aa  364  2e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228601  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.43 
 
 
684 aa  363  4e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000238485  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3726  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.38 
 
 
688 aa  363  4e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1306  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.62 
 
 
701 aa  363  6e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.99 
 
 
692 aa  361  2e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1266  glycine--tRNA ligase  34.99 
 
 
696 aa  360  5e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.13 
 
 
692 aa  360  6e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0555063  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0373  glycine--tRNA ligase  31.84 
 
 
691 aa  358  1.9999999999999998e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.87078  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2051  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.95 
 
 
692 aa  358  1.9999999999999998e-97  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1091  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.36 
 
 
668 aa  357  3.9999999999999996e-97  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2984  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.29 
 
 
733 aa  356  7.999999999999999e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1385  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.71 
 
 
696 aa  356  8.999999999999999e-97  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.036221  normal  0.597652 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2459  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.67 
 
 
697 aa  355  2e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0479  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.76 
 
 
688 aa  355  2e-96  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0038  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.59 
 
 
693 aa  354  4e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.903555  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1803  glycyl-tRNA synthetase beta chain  32.01 
 
 
688 aa  353  7e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3935  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.71 
 
 
680 aa  352  2e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000397713  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.72 
 
 
688 aa  352  2e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0023  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.09 
 
 
689 aa  350  4e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.94 
 
 
689 aa  350  4e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000111985 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4130  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.09 
 
 
689 aa  350  4e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3782  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.09 
 
 
689 aa  350  4e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4587  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.63 
 
 
731 aa  350  4e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8726  Glycine--tRNA ligase  32.95 
 
 
991 aa  350  6e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.65 
 
 
689 aa  350  7e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0731  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.13 
 
 
672 aa  348  2e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3849  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.37 
 
 
689 aa  348  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0694  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.48 
 
 
695 aa  348  2e-94  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.7209  hitchhiker  0.0000422359 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1804  glycyl-tRNA synthetase beta chain  32.45 
 
 
688 aa  347  3e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3868  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.37 
 
 
689 aa  347  4e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2310  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.82 
 
 
687 aa  347  4e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.75706 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2965  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33 
 
 
688 aa  347  5e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.425514  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0993  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.18 
 
 
693 aa  345  1e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4037  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.23 
 
 
689 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.414013 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3977  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.23 
 
 
689 aa  345  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0707  glycine--tRNA ligase  31.99 
 
 
672 aa  345  2e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3931  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.23 
 
 
689 aa  345  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0916  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.1 
 
 
694 aa  342  1e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4167  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.94 
 
 
689 aa  342  1e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>