263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0994 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0741  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  49.14 
 
 
691 aa  657    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.143146  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0994  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  100 
 
 
689 aa  1411    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.18697  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1193  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  53.09 
 
 
685 aa  747    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1197  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  46.73 
 
 
673 aa  623  1e-177  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.28917  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1115  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  45.79 
 
 
690 aa  611  1e-173  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.217479  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0270  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  44.9 
 
 
679 aa  541  9.999999999999999e-153  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0540  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.98 
 
 
678 aa  519  1e-146  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.792152  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4254  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.32 
 
 
690 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1733  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.54 
 
 
690 aa  459  9.999999999999999e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12440  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  37.77 
 
 
686 aa  449  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2472  glycine--tRNA ligase  36.06 
 
 
695 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0180526  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3047  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  38.07 
 
 
698 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.228214  normal  0.0284837 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0604  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.77 
 
 
694 aa  433  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0485  glycine--tRNA ligase  35.06 
 
 
688 aa  434  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3059  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.05 
 
 
687 aa  426  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1022  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35 
 
 
687 aa  419  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.208045  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1208  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.02 
 
 
693 aa  422  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0414092  normal  0.146925 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4816  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.2 
 
 
717 aa  419  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.642859 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2337  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.43 
 
 
711 aa  415  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2388  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.43 
 
 
711 aa  415  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0579  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.46 
 
 
687 aa  409  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3255  Glycine--tRNA ligase  34.2 
 
 
696 aa  409  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0335  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.19 
 
 
687 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0656  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.68 
 
 
687 aa  402  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70031e-23 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1686  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.91 
 
 
696 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.78284  normal  0.0276337 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1515  glycine--tRNA ligase  36.21 
 
 
688 aa  400  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0642  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.82 
 
 
687 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.91532  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0794  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.56 
 
 
716 aa  399  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.934108  normal  0.0595481 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2941  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.57 
 
 
686 aa  398  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.125162  hitchhiker  0.000287233 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2445  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.19 
 
 
694 aa  398  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0993  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.19 
 
 
693 aa  395  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1319  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.66 
 
 
689 aa  394  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4481  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.24 
 
 
719 aa  395  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.731924  normal  0.0858499 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3672  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.72 
 
 
688 aa  390  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0142363  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3372  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.62 
 
 
705 aa  387  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.173732  normal  0.25449 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0060  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.41 
 
 
684 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000538802 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.53 
 
 
684 aa  380  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0599  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.28 
 
 
688 aa  382  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487119  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0076  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.95 
 
 
683 aa  382  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.589695  hitchhiker  0.000000000290731 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0076  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.37 
 
 
684 aa  382  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000133889  normal  0.112381 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1712  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.37 
 
 
702 aa  377  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00327927  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2984  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.66 
 
 
733 aa  378  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0373  glycine--tRNA ligase  33.19 
 
 
691 aa  377  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.87078  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0018  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.41 
 
 
728 aa  378  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.606807 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0079  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.51 
 
 
683 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248487  decreased coverage  0.0000000000235888 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3726  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.76 
 
 
688 aa  378  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0185  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.81 
 
 
684 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0011  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.76 
 
 
684 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00090  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.91 
 
 
684 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00100  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.42 
 
 
685 aa  370  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.05 
 
 
684 aa  372  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000238485  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2051  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.42 
 
 
692 aa  372  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.48 
 
 
685 aa  372  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0694  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.33 
 
 
695 aa  367  1e-100  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.7209  hitchhiker  0.0000422359 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00370  glycyl-tRNA synthetase, tetrameric type, beta subunit  33 
 
 
694 aa  368  1e-100  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.740961  hitchhiker  0.00000247045 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0012  glycine--tRNA ligase  31.53 
 
 
690 aa  367  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.948293  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1266  glycine--tRNA ligase  32.34 
 
 
696 aa  365  2e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11030  glycyl-tRNA synthetase, tetrameric type, beta subunit  31.53 
 
 
694 aa  362  1e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000604533 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1053  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.67 
 
 
678 aa  362  1e-98  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1061  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.43 
 
 
691 aa  361  2e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2055  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.9 
 
 
697 aa  361  3e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.35855  normal  0.503298 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2210  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.14 
 
 
697 aa  359  9e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.28 
 
 
688 aa  359  9.999999999999999e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2033  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.53 
 
 
696 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00144588  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0355  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.86 
 
 
690 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3935  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.41 
 
 
680 aa  358  1.9999999999999998e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000397713  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4587  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.77 
 
 
731 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1773  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.33 
 
 
697 aa  357  5e-97  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0663369  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1803  glycyl-tRNA synthetase beta chain  32.89 
 
 
688 aa  356  6.999999999999999e-97  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.19 
 
 
688 aa  353  5e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1385  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.13 
 
 
696 aa  352  2e-95  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.036221  normal  0.597652 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0916  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.23 
 
 
694 aa  349  8e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1804  glycyl-tRNA synthetase beta chain  33.04 
 
 
688 aa  349  1e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8726  Glycine--tRNA ligase  31.17 
 
 
991 aa  348  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1441  glycine--tRNA ligase  29.97 
 
 
700 aa  348  2e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.764176  normal  0.147312 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2050  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.9 
 
 
693 aa  348  3e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0291  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.68 
 
 
701 aa  347  6e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265784 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.49 
 
 
692 aa  345  2e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0731  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.43 
 
 
672 aa  343  7e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0207  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.58 
 
 
692 aa  342  1e-92  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0479  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.52 
 
 
688 aa  342  2e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0038  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.22 
 
 
693 aa  342  2e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.903555  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0707  glycine--tRNA ligase  31.57 
 
 
672 aa  341  2.9999999999999998e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1195  glycine--tRNA ligase, beta subunit  33.14 
 
 
729 aa  340  4e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0011  glycine--tRNA ligase  31 
 
 
693 aa  340  5.9999999999999996e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.466423 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.15 
 
 
689 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000111985 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2554  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.29 
 
 
701 aa  339  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100286  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1611  glycine--tRNA ligase  30.19 
 
 
723 aa  338  9.999999999999999e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1091  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.28 
 
 
668 aa  339  9.999999999999999e-92  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1306  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  31 
 
 
701 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4496  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.91 
 
 
993 aa  338  2.9999999999999997e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.957039 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2650  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.14 
 
 
701 aa  337  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2116  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.3 
 
 
689 aa  337  5e-91  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.26 
 
 
692 aa  337  5e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0555063  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4348  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.66 
 
 
728 aa  336  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.314297  hitchhiker  0.00562302 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0632  glycine--tRNA ligase  31.3 
 
 
661 aa  335  1e-90  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.563385  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2574  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.25 
 
 
693 aa  332  2e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00568144 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4858  glycine--tRNA ligase  31.39 
 
 
677 aa  332  2e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2459  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.66 
 
 
697 aa  331  3e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2121  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.52 
 
 
1019 aa  330  4e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>