263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0930 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0930  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  100 
 
 
697 aa  1387    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3047  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.69 
 
 
698 aa  421  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.228214  normal  0.0284837 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2472  glycine--tRNA ligase  34 
 
 
695 aa  410  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0180526  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1515  glycine--tRNA ligase  34.9 
 
 
688 aa  399  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12440  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.71 
 
 
686 aa  395  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3059  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.52 
 
 
687 aa  394  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0694  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.38 
 
 
695 aa  390  1e-107  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.7209  hitchhiker  0.0000422359 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3372  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.73 
 
 
705 aa  389  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.173732  normal  0.25449 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11030  glycyl-tRNA synthetase, tetrameric type, beta subunit  32.68 
 
 
694 aa  388  1e-106  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000604533 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1022  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.05 
 
 
687 aa  385  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.208045  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0604  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.91 
 
 
694 aa  382  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0656  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.33 
 
 
687 aa  379  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70031e-23 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1208  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.85 
 
 
693 aa  379  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0414092  normal  0.146925 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4254  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.27 
 
 
690 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2445  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.47 
 
 
694 aa  378  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0579  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.57 
 
 
687 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3672  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.81 
 
 
688 aa  372  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0142363  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1733  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.62 
 
 
690 aa  370  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0076  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.34 
 
 
683 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.589695  hitchhiker  0.000000000290731 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0642  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.33 
 
 
687 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.91532  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0485  glycine--tRNA ligase  32.52 
 
 
688 aa  372  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0079  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.91 
 
 
683 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248487  decreased coverage  0.0000000000235888 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0012  glycine--tRNA ligase  33.1 
 
 
690 aa  369  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.948293  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.11 
 
 
688 aa  369  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0355  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.53 
 
 
690 aa  365  1e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3255  Glycine--tRNA ligase  30.87 
 
 
696 aa  365  1e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0011  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.62 
 
 
684 aa  365  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1385  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.91 
 
 
696 aa  363  4e-99  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.036221  normal  0.597652 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0185  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.34 
 
 
684 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0373  glycine--tRNA ligase  30.54 
 
 
691 aa  362  2e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.87078  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4449  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.77 
 
 
689 aa  361  3e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.19 
 
 
685 aa  360  3e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0076  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.77 
 
 
684 aa  361  3e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000133889  normal  0.112381 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4167  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.34 
 
 
689 aa  359  7e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0060  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.62 
 
 
684 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000538802 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0599  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.26 
 
 
688 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487119  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0061  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.62 
 
 
689 aa  357  5e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.91 
 
 
684 aa  356  7.999999999999999e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000238485  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4037  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.48 
 
 
689 aa  356  8.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.414013 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3977  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.48 
 
 
689 aa  355  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3931  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.48 
 
 
689 aa  355  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2055  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.79 
 
 
697 aa  355  2e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.35855  normal  0.503298 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00090  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.91 
 
 
684 aa  354  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3849  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.48 
 
 
689 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0043  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.25 
 
 
694 aa  355  2e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1061  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.15 
 
 
691 aa  354  2.9999999999999997e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2210  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.89 
 
 
697 aa  354  4e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2033  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.98 
 
 
696 aa  353  5.9999999999999994e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00144588  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3868  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.48 
 
 
689 aa  353  7e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00370  glycyl-tRNA synthetase, tetrameric type, beta subunit  32.05 
 
 
694 aa  353  8.999999999999999e-96  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.740961  hitchhiker  0.00000247045 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.15 
 
 
692 aa  352  8.999999999999999e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1248  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.22 
 
 
664 aa  352  1e-95  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.295288  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.11 
 
 
684 aa  352  2e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1712  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  29.82 
 
 
702 aa  352  2e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00327927  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3935  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.97 
 
 
680 aa  351  3e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000397713  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1773  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.37 
 
 
697 aa  350  6e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0663369  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03410  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.63 
 
 
689 aa  348  1e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0152  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.63 
 
 
689 aa  348  1e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0163  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.06 
 
 
689 aa  349  1e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.24 
 
 
689 aa  348  1e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00736647 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.22 
 
 
692 aa  349  1e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0555063  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4130  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.91 
 
 
689 aa  348  1e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03361  hypothetical protein  31.63 
 
 
689 aa  348  1e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0023  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.91 
 
 
689 aa  348  1e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0491  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.52 
 
 
664 aa  348  1e-94  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.190343  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3761  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.63 
 
 
689 aa  348  1e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.677293  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3782  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.91 
 
 
689 aa  348  1e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0156  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.63 
 
 
689 aa  348  1e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4934  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.63 
 
 
689 aa  348  2e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.711684 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2941  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.1 
 
 
686 aa  348  2e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.125162  hitchhiker  0.000287233 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3966  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.63 
 
 
689 aa  348  2e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4054  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.63 
 
 
689 aa  348  2e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1306  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.1 
 
 
701 aa  346  7e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00100  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.34 
 
 
685 aa  346  8.999999999999999e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1369  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.37 
 
 
664 aa  345  1e-93  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.183834  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3881  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.49 
 
 
689 aa  345  2e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1441  glycine--tRNA ligase  29.03 
 
 
700 aa  343  5e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.764176  normal  0.147312 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0993  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.11 
 
 
693 aa  342  1e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.39 
 
 
688 aa  341  2e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0038  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.31 
 
 
693 aa  341  2.9999999999999998e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.903555  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0601  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.24 
 
 
664 aa  338  9.999999999999999e-92  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0043  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.33 
 
 
672 aa  338  1.9999999999999998e-91  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.778368  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2459  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.86 
 
 
697 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2581  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  29.67 
 
 
694 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.595681  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2650  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.05 
 
 
701 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2210  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  29.67 
 
 
694 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.237877 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0479  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.5 
 
 
688 aa  337  2.9999999999999997e-91  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2554  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.05 
 
 
701 aa  337  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100286  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2116  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.2 
 
 
689 aa  337  3.9999999999999995e-91  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0070  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.49 
 
 
689 aa  337  3.9999999999999995e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.118047  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1221  glycine--tRNA ligase  30.72 
 
 
696 aa  337  5.999999999999999e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.59 
 
 
689 aa  335  1e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000111985 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.82 
 
 
689 aa  335  2e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1803  glycyl-tRNA synthetase beta chain  32.18 
 
 
688 aa  334  3e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0014  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.81 
 
 
689 aa  334  3e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000639104 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1091  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.8 
 
 
668 aa  334  3e-90  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0011  glycine--tRNA ligase  31.41 
 
 
693 aa  334  4e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.466423 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0207  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.39 
 
 
692 aa  333  5e-90  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3726  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.91 
 
 
688 aa  332  1e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2965  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.88 
 
 
688 aa  332  1e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.425514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>