More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1576 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1576  methyltransferase GidB  100 
 
 		 182 aa  368  1e-101  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.390365  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0882  methyltransferase GidB (glucose-inhibited divisionprotein B)  56.57 
 
 		 188 aa  193  9e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1345  methyltransferase GidB  51.98 
 
 		 186 aa  183  1.0000000000000001e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000386189  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1700  methyltransferase GidB  49.43 
 
 		 183 aa  175  3e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.916441  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1127  glucose inhibited division protein B  46.29 
 
 		 197 aa  147  6e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1077  methyltransferase GidB  42.86 
 
 		 188 aa  131  5e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.471113  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1015  methyltransferase GidB  42.29 
 
 		 188 aa  129  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0089498  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0376  methyltransferase GidB  40.76 
 
 		 189 aa  129  3e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.326616  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0792  methyltransferase GidB  41.71 
 
 		 188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00321601  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0383  16S rRNA methyltransferase GidB  35 
 
 		 193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2817  methyltransferase GidB  33.12 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3213  methyltransferase GidB  33.12 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4104  16S rRNA methyltransferase GidB  30 
 
 		 205 aa  77.8  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0344821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2754  methyltransferase GidB  27.51 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal  0.648083 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3904  16S rRNA methyltransferase GidB  26.7 
 
 		 227 aa  72  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04093  glucose-inhibited division protein B  25 
 
 		 211 aa  72  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0001  methyltransferase GidB  28.21 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0073145  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2989  16S rRNA methyltransferase GidB  29.47 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3427  16S rRNA methyltransferase GidB  29.49 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2807  16S rRNA methyltransferase GidB  29.01 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.202155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  30.06 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0029  16S rRNA methyltransferase GidB  27.27 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2667  16S rRNA methyltransferase GidB  29.47 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0111  16S rRNA methyltransferase GidB  27.91 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3885  methyltransferase GidB  30.32 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.124211  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf113  glucose-inhibited division protein B  33.08 
 
 		 173 aa  68.6  0.00000000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3654  16S rRNA methyltransferase GidB  31.58 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.611058  hitchhiker  0.00060095 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0003  16S rRNA methyltransferase GidB  29.55 
 
 		 216 aa  67.8  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113806  hitchhiker  0.000164452 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4011  glucose inhibited division protein B  25.13 
 
 		 223 aa  67.8  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.256555 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5305  16S rRNA methyltransferase GidB  29.55 
 
 		 216 aa  67.8  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376618 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3276  16S rRNA methyltransferase GidB  28.24 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606838  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5441  16S rRNA methyltransferase GidB  29.55 
 
 		 216 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2961  16S rRNA methyltransferase GidB  27.91 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0094  16S rRNA methyltransferase GidB  27.91 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3740  16S rRNA methyltransferase GidB  26.9 
 
 		 207 aa  67  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258045  normal  0.158212 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0095  16S rRNA methyltransferase GidB  28.57 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.706349 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0085  16S rRNA methyltransferase GidB  28.57 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446759  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4472  methyltransferase GidB  27.49 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.374397  hitchhiker  0.00000000163094 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5210  16S rRNA methyltransferase GidB  28.98 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0047  16S rRNA methyltransferase GidB  25.45 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3038  16S rRNA methyltransferase GidB  27.44 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.631468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6482  methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0936076 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4197  16S rRNA methyltransferase GidB  25 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000264563 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  25.47 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0197  16S rRNA methyltransferase GidB  27.78 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2147  methyltransferase GidB  30.36 
 
 		 241 aa  65.1  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3365  16S rRNA methyltransferase GidB  28.57 
 
 		 234 aa  65.1  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3555  16S rRNA methyltransferase GidB  30.15 
 
 		 238 aa  64.7  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4100  16S rRNA methyltransferase GidB  28.26 
 
 		 207 aa  64.3  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205274  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2216  16S rRNA methyltransferase GidB  25.88 
 
 		 234 aa  64.7  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3590  methyltransferase GidB  30.58 
 
 		 226 aa  64.3  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52260  16S rRNA methyltransferase GidB  30.46 
 
 		 215 aa  64.3  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4265  16S rRNA methyltransferase GidB  29.76 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.286943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4085  16S rRNA methyltransferase GidB  29.76 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0040729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1194  16S rRNA methyltransferase GidB  30.49 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4206  16S rRNA methyltransferase GidB  29.76 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0819041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0016  methyltransferase GidB  28.4 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.525658  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4156  16S rRNA methyltransferase GidB  29.76 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00135676  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0005  16S rRNA methyltransferase GidB  27.15 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.194064  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3855  16S rRNA methyltransferase GidB  28.03 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382464  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2363  methyltransferase GidB  28.82 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.720797  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2732  16S rRNA methyltransferase GidB  26.88 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4305  methyltransferase GidB  27.27 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.412707  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2570  methyltransferase GidB  31.65 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000427006  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002020  ribosomal RNA small subunit methyltransferase G  30.32 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000210084  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2789  16S rRNA methyltransferase GidB  26.88 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl662  16S rRNA methyltransferase GidB  30.63 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0094  16S rRNA methyltransferase GidB  25.88 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.978547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3626  glucose inhibited division protein  28.12 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1704  16S rRNA methyltransferase GidB  27.55 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4055  16S rRNA methyltransferase GidB  28.48 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6920  methyltransferase GidB  32.17 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.884506 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2126  16S rRNA methyltransferase GidB  29.53 
 
 		 204 aa  62  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1432  methyltransferase GidB  27.65 
 
 		 210 aa  62  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416586  normal  0.596678 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4617  16S rRNA methyltransferase GidB  28.41 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5179  16S rRNA methyltransferase GidB  30.23 
 
 		 239 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3722  methyltransferase GidB  25 
 
 		 228 aa  62  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000000027143  hitchhiker  0.00000187347 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4022  16S rRNA methyltransferase GidB  30.23 
 
 		 239 aa  61.6  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4124  16S rRNA methyltransferase GidB  26.88 
 
 		 207 aa  62  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000172745  normal  0.0365925 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4496  16S rRNA methyltransferase GidB  28.19 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.227983  hitchhiker  0.00000107328 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00432  16S rRNA methyltransferase GidB  31.08 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4220  methyltransferase GidB  29.91 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23430  16S rRNA methyltransferase GidB  31.82 
 
 		 241 aa  61.6  0.000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3319  16S rRNA methyltransferase GidB  26.63 
 
 		 231 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0013  methyltransferase GidB  28.48 
 
 		 222 aa  61.2  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000119734  hitchhiker  0.00444257 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4108  16S rRNA methyltransferase GidB  27.72 
 
 		 207 aa  61.2  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000252823  normal  0.110996 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03624  glucose-inhibited division protein  27.72 
 
 		 207 aa  60.8  0.000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0012473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4227  methyltransferase GidB  27.72 
 
 		 207 aa  60.8  0.000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000380789  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4181  16S rRNA methyltransferase GidB  27.72 
 
 		 207 aa  60.8  0.000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5176  16S rRNA methyltransferase GidB  27.72 
 
 		 207 aa  60.8  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000263973  normal  0.0413042 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03568  hypothetical protein  27.72 
 
 		 207 aa  60.8  0.000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00122769  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0251  methyltransferase GidB  32.35 
 
 		 231 aa  60.8  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1228  putative GidB, glucose inhibited division protein  29.19 
 
 		 206 aa  60.8  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3956  16S rRNA methyltransferase GidB  27.72 
 
 		 207 aa  60.8  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792968  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2889  methyltransferase GidB  29.19 
 
 		 206 aa  60.8  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4254  16S rRNA methyltransferase GidB  27.72 
 
 		 207 aa  60.8  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0110141  normal  0.0720919 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5046  16S rRNA methyltransferase GidB  29.38 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2803  16S rRNA methyltransferase GidB  32.35 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39750  glucose-inhibited division protein B  34.55 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.201257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2156  methyltransferase GidB  32.2 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>