More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0882 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0882  methyltransferase GidB (glucose-inhibited divisionprotein B)  100 
 
 		 188 aa  384  1e-106  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1345  methyltransferase GidB  60.23 
 
 		 186 aa  221  4.9999999999999996e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000386189  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1576  methyltransferase GidB  56.57 
 
 		 182 aa  193  1e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.390365  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1700  methyltransferase GidB  50.89 
 
 		 183 aa  185  3e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.916441  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1015  methyltransferase GidB  47.34 
 
 		 188 aa  156  2e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0089498  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0792  methyltransferase GidB  47.34 
 
 		 188 aa  154  6e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00321601  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1077  methyltransferase GidB  47.34 
 
 		 188 aa  154  8e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.471113  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1127  glucose inhibited division protein B  46.59 
 
 		 197 aa  153  1e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0376  methyltransferase GidB  43.18 
 
 		 189 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.326616  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0383  16S rRNA methyltransferase GidB  34.29 
 
 		 193 aa  118  4.9999999999999996e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2807  16S rRNA methyltransferase GidB  35.8 
 
 		 208 aa  97.8  9e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.202155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4104  16S rRNA methyltransferase GidB  31.95 
 
 		 205 aa  84.3  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0344821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2817  methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 221 aa  84.3  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3213  methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 221 aa  84.3  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2754  methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal  0.648083 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04093  glucose-inhibited division protein B  27.22 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0001  methyltransferase GidB  30.12 
 
 		 209 aa  81.3  0.000000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0073145  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52260  16S rRNA methyltransferase GidB  31.45 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3885  methyltransferase GidB  32 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.124211  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3327  16S rRNA methyltransferase GidB  30 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0247343  normal  0.297372 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4472  methyltransferase GidB  29.76 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.374397  hitchhiker  0.00000000163094 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3084  glucose inhibited division protein  34.19 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167506  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1704  16S rRNA methyltransferase GidB  32.22 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3197  16S rRNA methyltransferase GidB  29.52 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4617  16S rRNA methyltransferase GidB  31.45 
 
 		 214 aa  77.8  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3522  16S rRNA methyltransferase GidB  29.81 
 
 		 222 aa  77.8  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003474 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5441  16S rRNA methyltransferase GidB  31.14 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0197  16S rRNA methyltransferase GidB  30.54 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5210  16S rRNA methyltransferase GidB  30.43 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0003  16S rRNA methyltransferase GidB  31.06 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113806  hitchhiker  0.000164452 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5131  16S rRNA methyltransferase GidB  30.86 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2769  16S rRNA methyltransferase GidB  32.48 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.142379  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5305  16S rRNA methyltransferase GidB  31.06 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376618 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73360  16S rRNA methyltransferase GidB  31.37 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0205  16S rRNA methyltransferase GidB  29.24 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03624  glucose-inhibited division protein  30.46 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0012473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4227  methyltransferase GidB  30.46 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000380789  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4181  16S rRNA methyltransferase GidB  30.46 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4254  16S rRNA methyltransferase GidB  30.46 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0110141  normal  0.0720919 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4108  16S rRNA methyltransferase GidB  30.46 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000252823  normal  0.110996 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6482  methyltransferase GidB  36.54 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0936076 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3956  16S rRNA methyltransferase GidB  30.46 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792968  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03568  hypothetical protein  30.46 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00122769  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5176  16S rRNA methyltransferase GidB  30.46 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000263973  normal  0.0413042 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5410  methyltransferase GidB  30.32 
 
 		 262 aa  75.1  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2126  16S rRNA methyltransferase GidB  31.61 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6366  16S rRNA methyltransferase GidB  30.72 
 
 		 214 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3319  16S rRNA methyltransferase GidB  32.91 
 
 		 231 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5609  glucose-inhibited division protein B  29.63 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3038  16S rRNA methyltransferase GidB  30.77 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.631468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4011  glucose inhibited division protein B  30.26 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.256555 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4197  16S rRNA methyltransferase GidB  26.25 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000264563 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6890  methyltransferase GidB  30.56 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4124  16S rRNA methyltransferase GidB  28.48 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000172745  normal  0.0365925 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  28.85 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4305  methyltransferase GidB  26.58 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.412707  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4909  16S rRNA methyltransferase GidB  28.82 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346301  hitchhiker  0.00404661 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0029  16S rRNA methyltransferase GidB  28.14 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4695  methyltransferase GidB  33.1 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0675107  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4265  16S rRNA methyltransferase GidB  28.76 
 
 		 207 aa  72  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.286943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3786  16S rRNA methyltransferase GidB  26.8 
 
 		 221 aa  72  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.393771  decreased coverage  0.000261644 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4206  16S rRNA methyltransferase GidB  28.76 
 
 		 207 aa  72  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0819041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4100  16S rRNA methyltransferase GidB  28.76 
 
 		 207 aa  72  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205274  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26990  glucose-inhibited division protein B  28.57 
 
 		 241 aa  72  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4980  methyltransferase GidB  33.64 
 
 		 210 aa  72  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4156  16S rRNA methyltransferase GidB  28.76 
 
 		 207 aa  72  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00135676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4085  16S rRNA methyltransferase GidB  28.76 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0040729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4588  16S rRNA methyltransferase GidB  27.85 
 
 		 242 aa  71.2  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.188204  hitchhiker  0.000465387 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5091  methyltransferase GidB  28.87 
 
 		 223 aa  71.6  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0095  16S rRNA methyltransferase GidB  29.3 
 
 		 228 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.706349 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23430  16S rRNA methyltransferase GidB  34.62 
 
 		 241 aa  71.2  0.000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0085  16S rRNA methyltransferase GidB  29.3 
 
 		 228 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446759  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2147  methyltransferase GidB  29.94 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3555  16S rRNA methyltransferase GidB  26.92 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2945  16S rRNA methyltransferase GidB  31.65 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.373809  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0189  16S rRNA methyltransferase GidB  31.65 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3981  16S rRNA methyltransferase GidB  31.65 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1598  16S rRNA methyltransferase GidB  31.65 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.140153  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  28.03 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3315  glucose-inhibited division protein B  27.27 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.395697  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0047  16S rRNA methyltransferase GidB  26.82 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3004  16S rRNA methyltransferase GidB  31.65 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3366  16S rRNA methyltransferase GidB  31.65 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4055  16S rRNA methyltransferase GidB  31.65 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38010  glucose-inhibited division protein B  33.96 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3654  16S rRNA methyltransferase GidB  28.57 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.611058  hitchhiker  0.00060095 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3740  16S rRNA methyltransferase GidB  29.03 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258045  normal  0.158212 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0005  16S rRNA methyltransferase GidB  27.85 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.194064  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3904  16S rRNA methyltransferase GidB  28.57 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4859  methyltransferase GidB  28.76 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4218  16S rRNA methyltransferase GidB  27.53 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00057334  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3427  16S rRNA methyltransferase GidB  28.21 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1432  methyltransferase GidB  33.87 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416586  normal  0.596678 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2156  methyltransferase GidB  33.05 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5046  16S rRNA methyltransferase GidB  29.94 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7334  16S rRNA methyltransferase GidB  34.35 
 
 		 306 aa  68.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2231  methyltransferase GidB  31.52 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2866  methyltransferase GidB  28.93 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0426802  normal  0.092936 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0052  16S rRNA methyltransferase GidB  26.35 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4210  16S rRNA methyltransferase GidB  27.53 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00534269  normal  0.148659 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>