More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1700 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1700  methyltransferase GidB  100 
 
 
183 aa  372  1e-102  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.916441  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1345  methyltransferase GidB  50.57 
 
 
186 aa  189  2e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000386189  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0882  methyltransferase GidB (glucose-inhibited divisionprotein B)  50.89 
 
 
188 aa  185  3e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1576  methyltransferase GidB  49.43 
 
 
182 aa  175  3e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.390365  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1127  glucose inhibited division protein B  46.86 
 
 
197 aa  144  5e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1015  methyltransferase GidB  45.71 
 
 
188 aa  137  7.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0089498  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1077  methyltransferase GidB  46.29 
 
 
188 aa  137  8.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.471113  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0792  methyltransferase GidB  44.57 
 
 
188 aa  134  6.0000000000000005e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00321601  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0376  methyltransferase GidB  40.44 
 
 
189 aa  121  7e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.326616  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0383  16S rRNA methyltransferase GidB  37.71 
 
 
193 aa  115  5e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2817  methyltransferase GidB  35.66 
 
 
221 aa  83.2  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3213  methyltransferase GidB  35.66 
 
 
221 aa  83.2  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4617  16S rRNA methyltransferase GidB  32.94 
 
 
214 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52260  16S rRNA methyltransferase GidB  31.14 
 
 
215 aa  79.3  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0001  methyltransferase GidB  28.75 
 
 
209 aa  77  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0073145  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0052  16S rRNA methyltransferase GidB  28.65 
 
 
243 aa  77  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5441  16S rRNA methyltransferase GidB  32.3 
 
 
216 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0003  16S rRNA methyltransferase GidB  32.3 
 
 
216 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113806  hitchhiker  0.000164452 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5305  16S rRNA methyltransferase GidB  32.3 
 
 
216 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0376618 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2889  methyltransferase GidB  29.8 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4104  16S rRNA methyltransferase GidB  29.17 
 
 
205 aa  75.1  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0344821  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0197  16S rRNA methyltransferase GidB  30.54 
 
 
204 aa  74.3  0.0000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2216  16S rRNA methyltransferase GidB  29.59 
 
 
234 aa  73.2  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5131  16S rRNA methyltransferase GidB  32.52 
 
 
214 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1228  putative GidB, glucose inhibited division protein  29.14 
 
 
206 aa  73.2  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  29.56 
 
 
216 aa  73.2  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5210  16S rRNA methyltransferase GidB  31.68 
 
 
216 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5609  glucose-inhibited division protein B  31.1 
 
 
211 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2126  16S rRNA methyltransferase GidB  30.25 
 
 
204 aa  72.8  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73360  16S rRNA methyltransferase GidB  30.63 
 
 
214 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1938  methyltransferase GidB  29.88 
 
 
209 aa  70.9  0.000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.599081  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6366  16S rRNA methyltransferase GidB  30.57 
 
 
214 aa  70.9  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3626  glucose inhibited division protein  28.3 
 
 
201 aa  70.5  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4197  16S rRNA methyltransferase GidB  24.52 
 
 
218 aa  70.9  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000264563 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2754  methyltransferase GidB  29.01 
 
 
205 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal  0.648083 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2665  methyltransferase GidB  28.81 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.102332  normal  0.865597 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2807  16S rRNA methyltransferase GidB  26.54 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.202155  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0047  16S rRNA methyltransferase GidB  27.88 
 
 
219 aa  69.7  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4472  methyltransferase GidB  31.58 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.374397  hitchhiker  0.00000000163094 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3885  methyltransferase GidB  31.33 
 
 
214 aa  68.9  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.124211  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2156  methyltransferase GidB  33.98 
 
 
222 aa  67.8  0.00000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5740  16S rRNA methyltransferase GidB  30.87 
 
 
214 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0209353  normal  0.435335 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3276  16S rRNA methyltransferase GidB  27.95 
 
 
228 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606838  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4100  16S rRNA methyltransferase GidB  30.77 
 
 
207 aa  67  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205274  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2961  16S rRNA methyltransferase GidB  27.33 
 
 
228 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0094  16S rRNA methyltransferase GidB  27.33 
 
 
228 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4265  16S rRNA methyltransferase GidB  30.77 
 
 
207 aa  67  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.286943  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4206  16S rRNA methyltransferase GidB  30.77 
 
 
207 aa  67  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0819041  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4156  16S rRNA methyltransferase GidB  30.77 
 
 
207 aa  67  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00135676  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4980  methyltransferase GidB  28.29 
 
 
210 aa  66.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04093  glucose-inhibited division protein B  25.95 
 
 
211 aa  66.2  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1835  16S rRNA methyltransferase GidB  31.5 
 
 
245 aa  66.6  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0884797  normal  0.317572 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3365  16S rRNA methyltransferase GidB  30.86 
 
 
234 aa  66.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0205  16S rRNA methyltransferase GidB  29.76 
 
 
240 aa  66.6  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4539  16S rRNA methyltransferase GidB  28.41 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0125661  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4085  16S rRNA methyltransferase GidB  30.77 
 
 
207 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0040729  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1064  16S rRNA methyltransferase GidB  24.59 
 
 
239 aa  66.2  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.482961  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3084  glucose inhibited division protein  32.28 
 
 
214 aa  66.2  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167506  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2769  16S rRNA methyltransferase GidB  28.68 
 
 
216 aa  65.9  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.142379  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5410  methyltransferase GidB  30.65 
 
 
262 aa  65.5  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002020  ribosomal RNA small subunit methyltransferase G  29.38 
 
 
211 aa  65.5  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000210084  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0095  16S rRNA methyltransferase GidB  27.95 
 
 
228 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.706349 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0046  16S rRNA methyltransferase GidB  26.99 
 
 
213 aa  65.5  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4218  16S rRNA methyltransferase GidB  28.65 
 
 
206 aa  65.5  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00057334  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0085  16S rRNA methyltransferase GidB  27.95 
 
 
228 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446759  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3319  16S rRNA methyltransferase GidB  28.39 
 
 
231 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0318  16S rRNA methyltransferase GidB  27.1 
 
 
228 aa  65.1  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.309267  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03624  glucose-inhibited division protein  28.74 
 
 
207 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0012473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4227  methyltransferase GidB  28.74 
 
 
207 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000380789  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3956  16S rRNA methyltransferase GidB  28.74 
 
 
207 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792968  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4181  16S rRNA methyltransferase GidB  28.74 
 
 
207 aa  65.1  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03568  hypothetical protein  28.74 
 
 
207 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00122769  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  32.65 
 
 
231 aa  65.1  0.0000000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0074  16S rRNA methyltransferase GidB  27.06 
 
 
226 aa  65.1  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5176  16S rRNA methyltransferase GidB  28.74 
 
 
207 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000263973  normal  0.0413042 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4108  16S rRNA methyltransferase GidB  28.74 
 
 
207 aa  64.7  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000252823  normal  0.110996 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4254  16S rRNA methyltransferase GidB  28.74 
 
 
207 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0110141  normal  0.0720919 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0111  16S rRNA methyltransferase GidB  27.33 
 
 
228 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0064  16S rRNA methyltransferase GidB  26.25 
 
 
221 aa  64.7  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.75809 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0002  glucose-inhibited division protein B  28.39 
 
 
205 aa  64.7  0.0000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.189717  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0016  methyltransferase GidB  28.49 
 
 
222 aa  64.7  0.0000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.525658  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4249  16S rRNA methyltransferase GidB  30.12 
 
 
206 aa  63.5  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4184  16S rRNA methyltransferase GidB  28.65 
 
 
206 aa  63.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000958004  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3356  16S rRNA methyltransferase GidB  28.12 
 
 
235 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0094  16S rRNA methyltransferase GidB  27.92 
 
 
228 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.978547  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4210  16S rRNA methyltransferase GidB  28.65 
 
 
206 aa  63.9  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00534269  normal  0.148659 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0221  methyltransferase GidB  32.09 
 
 
228 aa  63.5  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6482  methyltransferase GidB  37.38 
 
 
213 aa  63.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0936076 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0029  16S rRNA methyltransferase GidB  27.71 
 
 
227 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5091  methyltransferase GidB  28.93 
 
 
223 aa  62.8  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0046  16S rRNA methyltransferase GidB  26.74 
 
 
226 aa  62.4  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4859  methyltransferase GidB  31.78 
 
 
205 aa  62.4  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0223  methyltransferase GidB  30.27 
 
 
228 aa  62  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3038  16S rRNA methyltransferase GidB  26.32 
 
 
225 aa  62  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.631468  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4305  methyltransferase GidB  27.71 
 
 
212 aa  62.4  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.412707  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3084  16S rRNA methyltransferase GidB  30.43 
 
 
238 aa  62.4  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.247732  unclonable  0.0000000260442 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3374  methyltransferase GidB  26.14 
 
 
242 aa  62  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4909  16S rRNA methyltransferase GidB  27.53 
 
 
206 aa  61.6  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346301  hitchhiker  0.00404661 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0027  16S rRNA methyltransferase GidB  26.16 
 
 
226 aa  61.6  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.292216 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3315  glucose-inhibited division protein B  29.27 
 
 
210 aa  61.6  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.395697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>