More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1345 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1345  methyltransferase GidB  100 
 
 		 186 aa  384  1e-106  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000386189  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0882  methyltransferase GidB (glucose-inhibited divisionprotein B)  60.23 
 
 		 188 aa  221  4.9999999999999996e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1700  methyltransferase GidB  50.57 
 
 		 183 aa  189  2e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.916441  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1576  methyltransferase GidB  51.98 
 
 		 182 aa  183  1.0000000000000001e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.390365  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1127  glucose inhibited division protein B  47.16 
 
 		 197 aa  152  2.9999999999999998e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1015  methyltransferase GidB  43.93 
 
 		 188 aa  131  5e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0089498  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1077  methyltransferase GidB  43.35 
 
 		 188 aa  131  6e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.471113  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0792  methyltransferase GidB  44.12 
 
 		 188 aa  129  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00321601  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0383  16S rRNA methyltransferase GidB  36.11 
 
 		 193 aa  118  4.9999999999999996e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0376  methyltransferase GidB  38.76 
 
 		 189 aa  117  9e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.326616  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2807  16S rRNA methyltransferase GidB  32.42 
 
 		 208 aa  86.7  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.202155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52260  16S rRNA methyltransferase GidB  33.73 
 
 		 215 aa  85.9  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0001  methyltransferase GidB  32.1 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0073145  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5441  16S rRNA methyltransferase GidB  32.54 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5210  16S rRNA methyltransferase GidB  32.54 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0003  16S rRNA methyltransferase GidB  32.54 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113806  hitchhiker  0.000164452 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5305  16S rRNA methyltransferase GidB  32.54 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376618 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4617  16S rRNA methyltransferase GidB  32.54 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3885  methyltransferase GidB  33.11 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.124211  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0029  16S rRNA methyltransferase GidB  30.46 
 
 		 227 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0197  16S rRNA methyltransferase GidB  31.14 
 
 		 204 aa  77.8  0.00000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3213  methyltransferase GidB  33.78 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73360  16S rRNA methyltransferase GidB  31.52 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2817  methyltransferase GidB  33.78 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3904  16S rRNA methyltransferase GidB  29.31 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2754  methyltransferase GidB  29.5 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal  0.648083 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2126  16S rRNA methyltransferase GidB  30.54 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6366  16S rRNA methyltransferase GidB  30.72 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4197  16S rRNA methyltransferase GidB  28.93 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000264563 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5131  16S rRNA methyltransferase GidB  31.55 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3084  glucose inhibited division protein  34.38 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167506  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3038  16S rRNA methyltransferase GidB  30.77 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.631468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3276  16S rRNA methyltransferase GidB  30.38 
 
 		 228 aa  72  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606838  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4104  16S rRNA methyltransferase GidB  29.17 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0344821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4305  methyltransferase GidB  27.54 
 
 		 212 aa  71.2  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.412707  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5740  16S rRNA methyltransferase GidB  34 
 
 		 214 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0209353  normal  0.435335 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0095  16S rRNA methyltransferase GidB  30.38 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.706349 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0085  16S rRNA methyltransferase GidB  30.38 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446759  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04093  glucose-inhibited division protein B  25.82 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5609  glucose-inhibited division protein B  30.95 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  35.48 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2803  16S rRNA methyltransferase GidB  31.47 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2949  16S rRNA methyltransferase GidB  31.47 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0111  16S rRNA methyltransferase GidB  29.75 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2961  16S rRNA methyltransferase GidB  29.75 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0094  16S rRNA methyltransferase GidB  29.75 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1307  16S rRNA methyltransferase GidB  30.59 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0094  16S rRNA methyltransferase GidB  29.87 
 
 		 228 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.978547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4472  methyltransferase GidB  34.23 
 
 		 208 aa  67.8  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.374397  hitchhiker  0.00000000163094 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3319  16S rRNA methyltransferase GidB  32.43 
 
 		 231 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2847  methyltransferase GidB  31.75 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.165278 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0016  methyltransferase GidB  35.9 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.525658  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2147  methyltransferase GidB  29.52 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4100  16S rRNA methyltransferase GidB  30.34 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205274  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_682  methyltransferase  30.34 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6482  methyltransferase GidB  34.62 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0936076 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0044  16S rRNA methyltransferase GidB  30.71 
 
 		 236 aa  65.1  0.0000000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0013  methyltransferase GidB  37.04 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000119734  hitchhiker  0.00444257 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0177  16S rRNA methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4206  16S rRNA methyltransferase GidB  30.07 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0819041  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2945  16S rRNA methyltransferase GidB  31.76 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.373809  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3366  16S rRNA methyltransferase GidB  31.76 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0189  16S rRNA methyltransferase GidB  31.01 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4156  16S rRNA methyltransferase GidB  30.07 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00135676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4085  16S rRNA methyltransferase GidB  30.07 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0040729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3004  16S rRNA methyltransferase GidB  31.01 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1598  16S rRNA methyltransferase GidB  31.01 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.140153  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4220  methyltransferase GidB  26.49 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4265  16S rRNA methyltransferase GidB  30.07 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.286943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4055  16S rRNA methyltransferase GidB  31.76 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4124  16S rRNA methyltransferase GidB  28.66 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000172745  normal  0.0365925 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1605  glucose inhibited division protein  27.71 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3356  16S rRNA methyltransferase GidB  25.42 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4218  16S rRNA methyltransferase GidB  30.34 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00057334  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3762  16S rRNA methyltransferase GidB  27.56 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.247019  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4496  16S rRNA methyltransferase GidB  29.11 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.227983  hitchhiker  0.00000107328 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4185  methyltransferase GidB  26.51 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0282933  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0005  16S rRNA methyltransferase GidB  27.71 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.194064  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4184  16S rRNA methyltransferase GidB  30.34 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000958004  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3981  16S rRNA methyltransferase GidB  31.76 
 
 		 213 aa  62  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4210  16S rRNA methyltransferase GidB  30.34 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00534269  normal  0.148659 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5091  methyltransferase GidB  30.5 
 
 		 223 aa  62  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2879  methyltransferase GidB  27.12 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2156  methyltransferase GidB  34.62 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4695  methyltransferase GidB  37.04 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0675107  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3740  16S rRNA methyltransferase GidB  28.76 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258045  normal  0.158212 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2336  methyltransferase GidB  26.52 
 
 		 217 aa  62  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000208151  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0895  methyltransferase GidB  28.98 
 
 		 202 aa  62  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23430  16S rRNA methyltransferase GidB  31.86 
 
 		 241 aa  62  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03624  glucose-inhibited division protein  27.92 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0012473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4227  methyltransferase GidB  27.92 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000380789  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4254  16S rRNA methyltransferase GidB  27.92 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0110141  normal  0.0720919 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4108  16S rRNA methyltransferase GidB  27.92 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000252823  normal  0.110996 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4181  16S rRNA methyltransferase GidB  27.92 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3956  16S rRNA methyltransferase GidB  27.92 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792968  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5176  16S rRNA methyltransferase GidB  27.92 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000263973  normal  0.0413042 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03568  hypothetical protein  27.92 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00122769  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2769  16S rRNA methyltransferase GidB  30.47 
 
 		 216 aa  61.2  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.142379  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4908  16S rRNA methyltransferase GidB  30.83 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127096  normal  0.165929 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4909  16S rRNA methyltransferase GidB  30.14 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346301  hitchhiker  0.00404661 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>