More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0177 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0177  16S rRNA methyltransferase GidB  100 
 
 
208 aa  404  1.0000000000000001e-112  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3084  16S rRNA methyltransferase GidB  33.53 
 
 
238 aa  86.7  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.247732  unclonable  0.0000000260442 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0046  16S rRNA methyltransferase GidB  31.45 
 
 
213 aa  84  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3084  glucose inhibited division protein  32.24 
 
 
214 aa  82.4  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167506  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2769  16S rRNA methyltransferase GidB  31.75 
 
 
216 aa  82.8  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.142379  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3327  16S rRNA methyltransferase GidB  30.81 
 
 
223 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0247343  normal  0.297372 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0223  methyltransferase GidB  33.94 
 
 
228 aa  81.6  0.000000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2513  glucose-inhibited division protein B  31.66 
 
 
254 aa  80.9  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.551637  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2807  16S rRNA methyltransferase GidB  31.58 
 
 
208 aa  80.9  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.202155  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1057  16S rRNA methyltransferase GidB  34.48 
 
 
238 aa  80.5  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.904694 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4472  methyltransferase GidB  27.23 
 
 
208 aa  80.1  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.374397  hitchhiker  0.00000000163094 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0180  16S rRNA methyltransferase GidB  28.81 
 
 
236 aa  80.1  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235371  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52260  16S rRNA methyltransferase GidB  29.19 
 
 
215 aa  80.5  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4197  16S rRNA methyltransferase GidB  27.49 
 
 
218 aa  79.7  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000264563 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1321  16S rRNA methyltransferase GidB  34.48 
 
 
238 aa  79  0.00000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3356  16S rRNA methyltransferase GidB  26.03 
 
 
235 aa  79  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2601  methyltransferase GidB  27.08 
 
 
220 aa  79  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2754  methyltransferase GidB  29.08 
 
 
205 aa  78.6  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal  0.648083 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0001  methyltransferase GidB  26.29 
 
 
209 aa  78.6  0.00000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0073145  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4617  16S rRNA methyltransferase GidB  27.41 
 
 
214 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2336  methyltransferase GidB  28.99 
 
 
217 aa  76.6  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000208151  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  33.33 
 
 
216 aa  76.6  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0221  methyltransferase GidB  33.33 
 
 
228 aa  77  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0095  16S rRNA methyltransferase GidB  29.88 
 
 
228 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.706349 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2231  methyltransferase GidB  29.44 
 
 
240 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3197  16S rRNA methyltransferase GidB  30.77 
 
 
222 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1398  16S rRNA methyltransferase GidB  36.13 
 
 
225 aa  77  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00046822  hitchhiker  0.000739039 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3276  16S rRNA methyltransferase GidB  30.49 
 
 
228 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606838  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3522  16S rRNA methyltransferase GidB  30.77 
 
 
222 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0003474 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0085  16S rRNA methyltransferase GidB  29.88 
 
 
228 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446759  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002020  ribosomal RNA small subunit methyltransferase G  31.02 
 
 
211 aa  75.9  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000210084  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0111  16S rRNA methyltransferase GidB  33.06 
 
 
228 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0002  glucose-inhibited division protein B  35.54 
 
 
205 aa  75.5  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.189717  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3294  methyltransferase GidB  32.12 
 
 
208 aa  75.5  0.0000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2961  16S rRNA methyltransferase GidB  33.06 
 
 
228 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0094  16S rRNA methyltransferase GidB  33.06 
 
 
228 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4305  methyltransferase GidB  26.6 
 
 
212 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.412707  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3038  16S rRNA methyltransferase GidB  28.16 
 
 
225 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.631468  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2147  methyltransferase GidB  29.44 
 
 
241 aa  74.7  0.0000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00432  16S rRNA methyltransferase GidB  28.78 
 
 
211 aa  74.3  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0016  methyltransferase GidB  29.17 
 
 
222 aa  73.9  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.525658  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5210  16S rRNA methyltransferase GidB  31.29 
 
 
216 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4104  16S rRNA methyltransferase GidB  28.77 
 
 
205 aa  74.3  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0344821  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3315  glucose-inhibited division protein B  27.89 
 
 
210 aa  73.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.395697  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3754  methyltransferase GidB  31.67 
 
 
219 aa  73.9  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0139272 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0094  16S rRNA methyltransferase GidB  29.09 
 
 
228 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.978547  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0003  16S rRNA methyltransferase GidB  30.34 
 
 
216 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113806  hitchhiker  0.000164452 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5305  16S rRNA methyltransferase GidB  30.34 
 
 
216 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0376618 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0064  16S rRNA methyltransferase GidB  26.86 
 
 
221 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.75809 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5441  16S rRNA methyltransferase GidB  30.34 
 
 
216 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  30.46 
 
 
231 aa  72.8  0.000000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3786  16S rRNA methyltransferase GidB  26.92 
 
 
221 aa  72.8  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.393771  decreased coverage  0.000261644 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0911  16S rRNA methyltransferase GidB  27.83 
 
 
212 aa  72.8  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2216  16S rRNA methyltransferase GidB  27.14 
 
 
234 aa  72.8  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3904  16S rRNA methyltransferase GidB  30.99 
 
 
227 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0267  16S rRNA methyltransferase GidB  32.43 
 
 
242 aa  72.8  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0047  16S rRNA methyltransferase GidB  26.22 
 
 
219 aa  72.4  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2803  16S rRNA methyltransferase GidB  31.06 
 
 
208 aa  72.4  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0752  methyltransferase GidB  31.33 
 
 
251 aa  72.4  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3119  methyltransferase GidB  33.86 
 
 
213 aa  72  0.000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.101436  hitchhiker  0.000000233712 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0197  16S rRNA methyltransferase GidB  29.65 
 
 
204 aa  72  0.000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0029  16S rRNA methyltransferase GidB  27.86 
 
 
227 aa  72  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2126  16S rRNA methyltransferase GidB  29.65 
 
 
204 aa  72  0.000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0776  16S rRNA methyltransferase GidB  31.82 
 
 
253 aa  71.6  0.000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.115198  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2949  16S rRNA methyltransferase GidB  31.06 
 
 
208 aa  72  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5131  16S rRNA methyltransferase GidB  31.72 
 
 
214 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1064  16S rRNA methyltransferase GidB  25.93 
 
 
239 aa  71.6  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.482961  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3365  16S rRNA methyltransferase GidB  30.63 
 
 
234 aa  71.6  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1035  16S rRNA methyltransferase GidB  27.62 
 
 
238 aa  71.6  0.000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.943257  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3885  methyltransferase GidB  31.11 
 
 
214 aa  71.6  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.124211  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6366  16S rRNA methyltransferase GidB  31.51 
 
 
214 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4206  16S rRNA methyltransferase GidB  27.91 
 
 
207 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0819041  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5609  glucose-inhibited division protein B  31.72 
 
 
211 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3069  16S rRNA methyltransferase GidB  29.17 
 
 
209 aa  70.9  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3880  16S rRNA methyltransferase GidB  31.33 
 
 
245 aa  70.9  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.480171  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0895  methyltransferase GidB  36.99 
 
 
202 aa  71.2  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4156  16S rRNA methyltransferase GidB  27.91 
 
 
207 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00135676  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1345  methyltransferase GidB  34.07 
 
 
186 aa  70.9  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000386189  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4085  16S rRNA methyltransferase GidB  27.91 
 
 
207 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0040729  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4100  16S rRNA methyltransferase GidB  26.76 
 
 
207 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205274  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4265  16S rRNA methyltransferase GidB  27.91 
 
 
207 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.286943  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2879  methyltransferase GidB  29.73 
 
 
220 aa  70.9  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4517  16S rRNA methyltransferase GidB  29.48 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00289594 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4375  16S rRNA methyltransferase GidB  29.48 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321441  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2518  16S rRNA methyltransferase GidB  29.47 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015126  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4124  16S rRNA methyltransferase GidB  28.12 
 
 
207 aa  70.5  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000172745  normal  0.0365925 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4320  16S rRNA methyltransferase GidB  29.48 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000104223 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4376  16S rRNA methyltransferase GidB  29.48 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000253102  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03624  glucose-inhibited division protein  28.72 
 
 
207 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0012473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4227  methyltransferase GidB  28.72 
 
 
207 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000380789  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5176  16S rRNA methyltransferase GidB  28.72 
 
 
207 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000263973  normal  0.0413042 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03568  hypothetical protein  28.72 
 
 
207 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00122769  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3762  16S rRNA methyltransferase GidB  26.4 
 
 
208 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.247019  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3956  16S rRNA methyltransferase GidB  28.72 
 
 
207 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792968  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4254  16S rRNA methyltransferase GidB  28.72 
 
 
207 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0110141  normal  0.0720919 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4250  16S rRNA methyltransferase GidB  30.94 
 
 
207 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0702  16S rRNA methyltransferase GidB  29.82 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4108  16S rRNA methyltransferase GidB  28.72 
 
 
207 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000252823  normal  0.110996 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2084  methyltransferase GidB  31.28 
 
 
240 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4181  16S rRNA methyltransferase GidB  28.72 
 
 
207 aa  69.7  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>