More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0376 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0376  methyltransferase GidB  100 
 
 
189 aa  395  1e-109  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.326616  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0882  methyltransferase GidB (glucose-inhibited divisionprotein B)  43.18 
 
 
188 aa  144  6e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0383  16S rRNA methyltransferase GidB  39.89 
 
 
193 aa  141  5e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1576  methyltransferase GidB  40.76 
 
 
182 aa  137  8.999999999999999e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.390365  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1700  methyltransferase GidB  40.44 
 
 
183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.916441  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1345  methyltransferase GidB  38.76 
 
 
186 aa  126  2.0000000000000002e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000386189  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1127  glucose inhibited division protein B  33.7 
 
 
197 aa  124  8.000000000000001e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1015  methyltransferase GidB  32.97 
 
 
188 aa  105  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0089498  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1077  methyltransferase GidB  32.43 
 
 
188 aa  105  4e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.471113  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0792  methyltransferase GidB  32.97 
 
 
188 aa  105  5e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00321601  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2817  methyltransferase GidB  35.15 
 
 
221 aa  91.7  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3213  methyltransferase GidB  35.15 
 
 
221 aa  91.7  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0001  methyltransferase GidB  33.13 
 
 
209 aa  91.3  7e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0073145  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0197  16S rRNA methyltransferase GidB  34.21 
 
 
204 aa  89  3e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3276  16S rRNA methyltransferase GidB  30.64 
 
 
228 aa  88.2  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606838  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0095  16S rRNA methyltransferase GidB  30.64 
 
 
228 aa  87.4  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.706349 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0094  16S rRNA methyltransferase GidB  30.46 
 
 
228 aa  87.4  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.978547  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2961  16S rRNA methyltransferase GidB  32.48 
 
 
228 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0094  16S rRNA methyltransferase GidB  32.48 
 
 
228 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0085  16S rRNA methyltransferase GidB  30.06 
 
 
228 aa  86.3  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446759  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2126  16S rRNA methyltransferase GidB  33.55 
 
 
204 aa  85.9  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4108  16S rRNA methyltransferase GidB  28.43 
 
 
207 aa  85.5  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000252823  normal  0.110996 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0111  16S rRNA methyltransferase GidB  32.48 
 
 
228 aa  85.5  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3319  16S rRNA methyltransferase GidB  32.5 
 
 
231 aa  85.1  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3985  methyltransferase GidB  32.32 
 
 
206 aa  84.3  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03624  glucose-inhibited division protein  30.3 
 
 
207 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0012473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4227  methyltransferase GidB  30.3 
 
 
207 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000380789  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4206  16S rRNA methyltransferase GidB  31.61 
 
 
207 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0819041  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4156  16S rRNA methyltransferase GidB  31.61 
 
 
207 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00135676  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3956  16S rRNA methyltransferase GidB  30.3 
 
 
207 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792968  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2807  16S rRNA methyltransferase GidB  32.67 
 
 
208 aa  83.6  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.202155  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4100  16S rRNA methyltransferase GidB  31.61 
 
 
207 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205274  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4181  16S rRNA methyltransferase GidB  30.3 
 
 
207 aa  83.6  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03568  hypothetical protein  30.3 
 
 
207 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00122769  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0895  methyltransferase GidB  36.31 
 
 
202 aa  83.6  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5176  16S rRNA methyltransferase GidB  30.3 
 
 
207 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000263973  normal  0.0413042 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4265  16S rRNA methyltransferase GidB  31.61 
 
 
207 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.286943  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4254  16S rRNA methyltransferase GidB  30.3 
 
 
207 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0110141  normal  0.0720919 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4305  methyltransferase GidB  32.03 
 
 
212 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.412707  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5410  methyltransferase GidB  42.86 
 
 
262 aa  82.4  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2754  methyltransferase GidB  29.7 
 
 
205 aa  82  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal  0.648083 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4085  16S rRNA methyltransferase GidB  31.61 
 
 
207 aa  82  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0040729  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3004  16S rRNA methyltransferase GidB  33.54 
 
 
230 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0189  16S rRNA methyltransferase GidB  33.54 
 
 
232 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1598  16S rRNA methyltransferase GidB  33.54 
 
 
232 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.140153  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2945  16S rRNA methyltransferase GidB  33.33 
 
 
213 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.373809  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3084  glucose inhibited division protein  34.64 
 
 
214 aa  81.3  0.000000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167506  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4055  16S rRNA methyltransferase GidB  33.33 
 
 
213 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3366  16S rRNA methyltransferase GidB  33.33 
 
 
213 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3981  16S rRNA methyltransferase GidB  33.33 
 
 
213 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1704  16S rRNA methyltransferase GidB  33.55 
 
 
212 aa  80.9  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4104  16S rRNA methyltransferase GidB  33.54 
 
 
205 aa  79.7  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0344821  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4249  16S rRNA methyltransferase GidB  32.26 
 
 
206 aa  80.1  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  31.06 
 
 
216 aa  79  0.00000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4011  glucose inhibited division protein B  32.9 
 
 
223 aa  79  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.256555 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4980  methyltransferase GidB  39.42 
 
 
210 aa  79  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4539  16S rRNA methyltransferase GidB  32.69 
 
 
206 aa  78.2  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0125661  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6482  methyltransferase GidB  40.38 
 
 
213 aa  78.2  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0936076 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3038  16S rRNA methyltransferase GidB  31.06 
 
 
225 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.631468  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4909  16S rRNA methyltransferase GidB  31.36 
 
 
206 aa  77.8  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346301  hitchhiker  0.00404661 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3069  16S rRNA methyltransferase GidB  33.33 
 
 
209 aa  77.8  0.00000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04093  glucose-inhibited division protein B  30.77 
 
 
211 aa  77.8  0.00000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2665  methyltransferase GidB  34.84 
 
 
208 aa  77.8  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.102332  normal  0.865597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9385  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in cell division-like protein  32.1 
 
 
236 aa  77.8  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2847  methyltransferase GidB  31.33 
 
 
217 aa  77.8  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.165278 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0016  methyltransferase GidB  30.86 
 
 
222 aa  77.4  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.525658  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4197  16S rRNA methyltransferase GidB  28.57 
 
 
218 aa  76.6  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000264563 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4375  16S rRNA methyltransferase GidB  30.06 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321441  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4218  16S rRNA methyltransferase GidB  30.18 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00057334  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4320  16S rRNA methyltransferase GidB  30.06 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000104223 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4376  16S rRNA methyltransferase GidB  30.06 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000253102  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4517  16S rRNA methyltransferase GidB  30.06 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00289594 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3885  methyltransferase GidB  32.65 
 
 
214 aa  76.6  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.124211  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03243  16S rRNA methyltransferase GidB  31.17 
 
 
212 aa  75.5  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4185  methyltransferase GidB  30.92 
 
 
206 aa  75.5  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0282933  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0201  methyltransferase GidB  34.39 
 
 
211 aa  75.5  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4124  16S rRNA methyltransferase GidB  29.76 
 
 
207 aa  75.9  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000172745  normal  0.0365925 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23430  16S rRNA methyltransferase GidB  38.83 
 
 
241 aa  75.9  0.0000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4184  16S rRNA methyltransferase GidB  30.18 
 
 
206 aa  75.5  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000958004  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5046  16S rRNA methyltransferase GidB  32.7 
 
 
209 aa  75.1  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7094  methyltransferase GidB  37.38 
 
 
223 aa  75.5  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4210  16S rRNA methyltransferase GidB  30.18 
 
 
206 aa  75.5  0.0000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00534269  normal  0.148659 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  26.9 
 
 
231 aa  75.1  0.0000000000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0029  16S rRNA methyltransferase GidB  30.3 
 
 
227 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6890  methyltransferase GidB  31.69 
 
 
211 aa  74.7  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3762  16S rRNA methyltransferase GidB  29.03 
 
 
208 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.247019  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2803  16S rRNA methyltransferase GidB  32.08 
 
 
208 aa  74.7  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3322  methyltransferase GidB  31.93 
 
 
240 aa  74.3  0.0000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2949  16S rRNA methyltransferase GidB  32.08 
 
 
208 aa  74.3  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0911  16S rRNA methyltransferase GidB  31.58 
 
 
212 aa  73.6  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0046  16S rRNA methyltransferase GidB  29.65 
 
 
213 aa  73.9  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3740  16S rRNA methyltransferase GidB  32.89 
 
 
207 aa  73.9  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258045  normal  0.158212 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5633  16S rRNA methyltransferase GidB  29.94 
 
 
239 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5335  16S rRNA methyltransferase GidB  29.94 
 
 
239 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5179  16S rRNA methyltransferase GidB  29.94 
 
 
239 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5732  16S rRNA methyltransferase GidB  29.94 
 
 
239 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4588  16S rRNA methyltransferase GidB  36.94 
 
 
242 aa  73.2  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.188204  hitchhiker  0.000465387 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4617  16S rRNA methyltransferase GidB  31.41 
 
 
214 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5592  16S rRNA methyltransferase GidB  29.94 
 
 
239 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000593206 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3935  16S rRNA methyltransferase GidB  30.06 
 
 
206 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.387591  hitchhiker  0.000403371 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>