More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3546 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5200  serine hydroxymethyltransferase  96.7 
 
 
424 aa  842    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0828  serine hydroxymethyltransferase  93.4 
 
 
424 aa  812    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0055  serine hydroxymethyltransferase  91.98 
 
 
424 aa  812    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0740  serine hydroxymethyltransferase  93.4 
 
 
424 aa  812    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1006  serine hydroxymethyltransferase  93.16 
 
 
424 aa  811    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0471  serine hydroxymethyltransferase  93.16 
 
 
424 aa  811    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6867  glycine hydroxymethyltransferase  76.18 
 
 
431 aa  672    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.592385 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3303  serine hydroxymethyltransferase  91.27 
 
 
424 aa  813    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282627  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4822  serine hydroxymethyltransferase  91.04 
 
 
424 aa  801    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5063  serine hydroxymethyltransferase  88.92 
 
 
424 aa  782    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0644659  normal  0.0156096 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2106  serine hydroxymethyltransferase  93.4 
 
 
424 aa  812    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0571  serine hydroxymethyltransferase  96.93 
 
 
424 aa  842    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3546  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 
424 aa  868    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1868  serine hydroxymethyltransferase  94.1 
 
 
424 aa  818    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5022  serine hydroxymethyltransferase  97.64 
 
 
424 aa  846    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1585  serine hydroxymethyltransferase  89.62 
 
 
424 aa  790    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.592814  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5085  serine hydroxymethyltransferase  96.7 
 
 
424 aa  842    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.750126 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1979  serine hydroxymethyltransferase  93.16 
 
 
424 aa  811    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00954911  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3283  serine hydroxymethyltransferase  96.46 
 
 
424 aa  839    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0710  serine hydroxymethyltransferase  92.92 
 
 
424 aa  809    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4497  serine hydroxymethyltransferase  97.17 
 
 
424 aa  845    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5759  glycine hydroxymethyltransferase  70.52 
 
 
431 aa  627  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000232  serine hydroxymethyltransferase  72.14 
 
 
431 aa  615  1e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0952  serine hydroxymethyltransferase  71.43 
 
 
435 aa  613  9.999999999999999e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05971  serine hydroxymethyltransferase  71.19 
 
 
431 aa  614  9.999999999999999e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3844  serine hydroxymethyltransferase  69.76 
 
 
431 aa  602  1.0000000000000001e-171  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.988817  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  67.53 
 
 
437 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2481  serine hydroxymethyltransferase  68.74 
 
 
431 aa  598  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.938329  normal  0.172432 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0821  serine hydroxymethyltransferase  68.74 
 
 
431 aa  599  1e-170  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0823  serine hydroxymethyltransferase  68.5 
 
 
431 aa  597  1e-169  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1537  serine hydroxymethyltransferase  67.54 
 
 
435 aa  595  1e-169  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0106  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2908  serine hydroxymethyltransferase  67.69 
 
 
438 aa  592  1e-168  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000280655  hitchhiker  0.00545149 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1827  serine hydroxymethyltransferase  68.42 
 
 
430 aa  592  1e-168  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.752619  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3956  serine hydroxymethyltransferase  67.54 
 
 
434 aa  593  1e-168  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2283  glycine hydroxymethyltransferase  68.4 
 
 
425 aa  587  1e-167  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90339 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0354  serine hydroxymethyltransferase  67.54 
 
 
431 aa  591  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0389221  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3366  serine hydroxymethyltransferase  66.43 
 
 
434 aa  585  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113105  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3495  serine hydroxymethyltransferase  66.04 
 
 
434 aa  585  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3171  serine hydroxymethyltransferase  66.04 
 
 
434 aa  585  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188905  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0791  serine hydroxymethyltransferase  69.5 
 
 
435 aa  587  1e-166  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0375384  normal  0.0421873 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3354  serine hydroxymethyltransferase  67.45 
 
 
432 aa  584  1.0000000000000001e-165  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0554425  normal  0.88347 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2634  serine hydroxymethyltransferase  66.75 
 
 
433 aa  579  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2671  serine hydroxymethyltransferase  66.98 
 
 
433 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163758  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1579  serine hydroxymethyltransferase  67.54 
 
 
431 aa  580  1e-164  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  64.94 
 
 
438 aa  575  1.0000000000000001e-163  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  65.48 
 
 
439 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  64.71 
 
 
438 aa  573  1.0000000000000001e-162  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2659  serine hydroxymethyltransferase  66.19 
 
 
440 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.719136  normal  0.877467 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3004  serine hydroxymethyltransferase  66.98 
 
 
432 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21133  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2991  serine hydroxymethyltransferase  66.59 
 
 
439 aa  570  1e-161  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.406931  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0920  serine hydroxymethyltransferase  64.71 
 
 
427 aa  569  1e-161  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455334  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1610  serine hydroxymethyltransferase  64.32 
 
 
429 aa  570  1e-161  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1131  serine hydroxymethyltransferase  67.45 
 
 
438 aa  568  1e-161  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.584691  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0816  serine hydroxymethyltransferase  64.3 
 
 
431 aa  566  1e-160  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.38724 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3104  serine hydroxymethyltransferase  66.82 
 
 
433 aa  566  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.425727  decreased coverage  0.00549191 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2113  serine hydroxymethyltransferase  67.73 
 
 
424 aa  566  1e-160  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332542  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1177  serine hydroxymethyltransferase  64 
 
 
432 aa  565  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0289619  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2110  serine hydroxymethyltransferase  64.69 
 
 
434 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8588  serine hydroxymethyltransferase  67.56 
 
 
420 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1266  serine hydroxymethyltransferase  63.29 
 
 
432 aa  558  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0458809  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1814  serine hydroxymethyltransferase  65.33 
 
 
434 aa  558  1e-158  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4649  serine hydroxymethyltransferase  65.57 
 
 
434 aa  557  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.863224  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1225  serine hydroxymethyltransferase  64.85 
 
 
433 aa  555  1e-157  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1727  serine hydroxymethyltransferase  64.86 
 
 
433 aa  551  1e-156  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.130178 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0870  glycine hydroxymethyltransferase  67.95 
 
 
424 aa  552  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3047  serine hydroxymethyltransferase  66.51 
 
 
434 aa  551  1e-156  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.302237  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4270  serine hydroxymethyltransferase  68.27 
 
 
423 aa  553  1e-156  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.978969  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4276  glycine hydroxymethyltransferase  66.35 
 
 
451 aa  548  1e-155  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.514948  normal  0.0110039 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5297  serine hydroxymethyltransferase  66.98 
 
 
433 aa  544  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3404  serine hydroxymethyltransferase  66.98 
 
 
433 aa  544  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2123  serine hydroxymethyltransferase  65.88 
 
 
432 aa  547  1e-154  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.607283  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0169  serine hydroxymethyltransferase  63.77 
 
 
422 aa  547  1e-154  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2240  serine hydroxymethyltransferase  62.05 
 
 
436 aa  540  9.999999999999999e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.435156  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1035  serine hydroxymethyltransferase  61.26 
 
 
425 aa  537  1e-151  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0692  serine hydroxymethyltransferase  61.22 
 
 
421 aa  528  1e-149  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.414357  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0629  serine hydroxymethyltransferase  60.9 
 
 
432 aa  527  1e-148  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2305  serine hydroxymethyltransferase  63.11 
 
 
434 aa  518  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  60.77 
 
 
427 aa  515  1.0000000000000001e-145  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0311  serine hydroxymethyltransferase  60.73 
 
 
420 aa  512  1e-144  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1887  Glycine hydroxymethyltransferase  61.02 
 
 
419 aa  513  1e-144  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.409267  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  61.5 
 
 
411 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  59.08 
 
 
413 aa  505  9.999999999999999e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  59.32 
 
 
431 aa  506  9.999999999999999e-143  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3135  serine hydroxymethyltransferase  63.68 
 
 
434 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 
412 aa  499  1e-140  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  58.6 
 
 
429 aa  498  1e-140  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1142  serine hydroxymethyltransferase  62.5 
 
 
434 aa  500  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4132  serine hydroxymethyltransferase  59.76 
 
 
417 aa  496  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000588766  normal  0.517769 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0322  serine hydroxymethyltransferase  60 
 
 
417 aa  495  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.457346  decreased coverage  0.0000286459 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  59.81 
 
 
413 aa  494  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  59.56 
 
 
413 aa  495  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1871  Glycine hydroxymethyltransferase  59.71 
 
 
417 aa  497  1e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0163056  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0344  serine hydroxymethyltransferase  60 
 
 
417 aa  495  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.963128 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0345  serine hydroxymethyltransferase  60 
 
 
417 aa  495  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.911009 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  56.14 
 
 
423 aa  495  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  57.52 
 
 
412 aa  494  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  58.11 
 
 
425 aa  497  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  59.81 
 
 
413 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  58.94 
 
 
416 aa  491  9.999999999999999e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  55.9 
 
 
423 aa  492  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>