261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2675 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2675  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  496  1e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.49786 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0760  hypothetical protein  47.68 
 
 
244 aa  234  9e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0906  protein of unknown function DUF45  47.68 
 
 
244 aa  234  9e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.876537  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2198  hypothetical protein  47.06 
 
 
247 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.403347  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4620  protein of unknown function DUF45  46.67 
 
 
242 aa  232  4.0000000000000004e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.212345 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0860  hypothetical protein  46.15 
 
 
238 aa  230  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0947  hypothetical protein  44.4 
 
 
245 aa  218  5e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000214537 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1774  zinc metalloprotease  44.92 
 
 
238 aa  217  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0401  hypothetical protein  44.3 
 
 
233 aa  205  4e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0365  hypothetical protein  40.79 
 
 
232 aa  203  2e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0669057  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0431  protein of unknown function DUF45  42.31 
 
 
239 aa  194  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0555  zinc metalloprotease  41.67 
 
 
239 aa  190  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0652798  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0244  hypothetical protein  39.74 
 
 
253 aa  188  7e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0435  hypothetical protein  36.05 
 
 
235 aa  168  8e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0459  hypothetical protein  36.05 
 
 
235 aa  166  4e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0543  peptidase S26A, signal peptidase I  36.28 
 
 
236 aa  165  5.9999999999999996e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00150578  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1098  hypothetical protein  33.03 
 
 
222 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0617  hypothetical protein  32.89 
 
 
222 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0949  hypothetical protein  31.9 
 
 
219 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0658473  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1858  protein of unknown function DUF45  30.66 
 
 
226 aa  122  5e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000912457  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0984  zinc metalloprotease  31.51 
 
 
221 aa  121  9e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1819  hypothetical protein  32.57 
 
 
222 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0083  hypothetical protein  31.11 
 
 
222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.000843512  decreased coverage  0.0000753316 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0977  protein of unknown function DUF45  30.41 
 
 
259 aa  113  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1591  protein of unknown function DUF45  41.1 
 
 
153 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.961397  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1114  hypothetical protein  30.49 
 
 
254 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04860  predicted metal-dependent hydrolase  30 
 
 
184 aa  108  1e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1894  hypothetical protein  31.76 
 
 
242 aa  106  4e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470997  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4201  protein of unknown function DUF45  30.04 
 
 
245 aa  106  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1632  protein of unknown function DUF45  26.54 
 
 
232 aa  103  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0156  hypothetical protein  30.99 
 
 
270 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06805  hypothetical protein  31.73 
 
 
258 aa  98.2  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  27.62 
 
 
237 aa  96.3  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07420  predicted metal-dependent hydrolase  27.11 
 
 
198 aa  96.3  4e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.654381  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2343  hypothetical protein  30 
 
 
238 aa  94.7  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.781257  normal  0.0217963 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1416  putative metal-dependent hydrolase  29.29 
 
 
268 aa  95.1  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2542  protein of unknown function DUF45  26.64 
 
 
242 aa  94.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.65103  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  28.57 
 
 
245 aa  91.7  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  28.5 
 
 
234 aa  90.1  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2141  hypothetical protein  29.65 
 
 
233 aa  89.7  4e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0199813 
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  29.44 
 
 
240 aa  88.6  8e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  25.25 
 
 
244 aa  87.8  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  32.46 
 
 
236 aa  87  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0015  hypothetical protein  32.65 
 
 
247 aa  85.9  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000114472  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0843  hypothetical protein  31.79 
 
 
246 aa  84.7  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335069  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0791  hypothetical protein  31.79 
 
 
246 aa  84.7  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2595  hypothetical protein  24.88 
 
 
238 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23171  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2274  protein of unknown function DUF45  28.42 
 
 
243 aa  84.7  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  26.24 
 
 
243 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  24.67 
 
 
244 aa  83.2  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05618  hypothetical protein  30.41 
 
 
226 aa  83.2  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3548  hypothetical protein  30.05 
 
 
242 aa  82.8  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.405363  normal  0.224983 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  24.61 
 
 
238 aa  82.8  0.000000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2550  hypothetical protein  24.66 
 
 
231 aa  82  0.000000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.52441  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2668  protein of unknown function DUF45  39.08 
 
 
202 aa  81.6  0.000000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.255358  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  27.27 
 
 
261 aa  80.9  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0794  conserved hypothetical protein (DUF45 domain protein)  27.19 
 
 
221 aa  80.1  0.00000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.308629  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  25.79 
 
 
235 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  27.71 
 
 
240 aa  79.7  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  27.22 
 
 
240 aa  79.3  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  25.13 
 
 
240 aa  78.6  0.00000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0568  hypothetical protein  25.64 
 
 
235 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000566322 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0535  hypothetical protein  27.27 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  28.08 
 
 
288 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  29.24 
 
 
241 aa  78.2  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2082  hypothetical protein  27.23 
 
 
222 aa  77.8  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2928  hypothetical protein  28.16 
 
 
219 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1843  protein of unknown function DUF45  24.88 
 
 
254 aa  78.2  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224767 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1800  hypothetical protein  24.2 
 
 
222 aa  77  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.404735  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  28.29 
 
 
237 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1292  hypothetical protein  28.37 
 
 
308 aa  75.5  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.232025 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0079  zinc metalloprotease  23.83 
 
 
230 aa  75.5  0.0000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0200194  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  23.96 
 
 
224 aa  75.1  0.0000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  25.44 
 
 
241 aa  75.1  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1951  hypothetical protein  35.24 
 
 
481 aa  74.7  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  28.89 
 
 
227 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1069  hypothetical protein  24.78 
 
 
225 aa  74.3  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.887273  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  29.76 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2794  protein of unknown function DUF45  29.41 
 
 
242 aa  73.2  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182535  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  29.06 
 
 
285 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  26.6 
 
 
292 aa  72.4  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  32.71 
 
 
245 aa  72.4  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0100  hypothetical protein  26.48 
 
 
231 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58057  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1049  hypothetical protein  24.17 
 
 
215 aa  72.4  0.000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  28.33 
 
 
227 aa  72.4  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  26.6 
 
 
292 aa  72.4  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0443  hypothetical protein  28.57 
 
 
292 aa  72  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  24.75 
 
 
243 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  24.49 
 
 
224 aa  71.6  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3538  hypothetical protein  25.99 
 
 
239 aa  70.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739224  normal  0.0386409 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0727  protein of unknown function DUF45  24.2 
 
 
223 aa  70.9  0.00000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2255  zinc metalloprotease  29.44 
 
 
227 aa  70.5  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0406  hypothetical protein  26.34 
 
 
257 aa  71.2  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.317112  normal  0.0115722 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0309  zinc metalloprotease  23.61 
 
 
235 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  23.56 
 
 
242 aa  70.1  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  27.54 
 
 
300 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0723  hypothetical protein  22.75 
 
 
220 aa  69.7  0.00000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.835761  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  23.04 
 
 
224 aa  69.7  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1661  protein of unknown function DUF45  26.8 
 
 
244 aa  69.3  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.843742  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  27.05 
 
 
300 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>