286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1312 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  100 
 
 
234 aa  490  9.999999999999999e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  36.71 
 
 
241 aa  160  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0800  hypothetical protein  35.81 
 
 
237 aa  158  5e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0356506  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  34.62 
 
 
243 aa  157  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2595  hypothetical protein  32.62 
 
 
238 aa  155  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23171  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1843  protein of unknown function DUF45  33.2 
 
 
254 aa  143  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224767 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  34.19 
 
 
224 aa  143  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  33.63 
 
 
224 aa  142  5e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  35.09 
 
 
244 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  32.74 
 
 
224 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  33.62 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  35.32 
 
 
237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0309  zinc metalloprotease  32.59 
 
 
235 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0431  hypothetical protein  32.14 
 
 
235 aa  138  7e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0322  hypothetical protein  32.14 
 
 
235 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000118894  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0369  hypothetical protein  32.14 
 
 
235 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0337  hypothetical protein  32.14 
 
 
235 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000389941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0306  zinc metalloprotease  32.14 
 
 
235 aa  136  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0568  hypothetical protein  34.76 
 
 
235 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000566322 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  35.48 
 
 
252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  34.76 
 
 
245 aa  135  5e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  34.48 
 
 
223 aa  135  7.000000000000001e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  34.21 
 
 
238 aa  134  8e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0384  zinc metalloprotease  31.7 
 
 
235 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0625718  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0317  hypothetical protein  31.25 
 
 
235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0431  hypothetical protein  31.25 
 
 
235 aa  133  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00811962  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  33.66 
 
 
235 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  31.42 
 
 
244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  30.4 
 
 
237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05618  hypothetical protein  34.04 
 
 
226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4036  hypothetical protein  32.51 
 
 
234 aa  126  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  33.06 
 
 
261 aa  125  7e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  31.98 
 
 
236 aa  122  4e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  31.11 
 
 
242 aa  122  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  33.33 
 
 
223 aa  120  9.999999999999999e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  31.86 
 
 
292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  31.86 
 
 
292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  31.86 
 
 
292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  31.86 
 
 
292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  31.86 
 
 
292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  31.86 
 
 
292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  31.86 
 
 
292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  31.25 
 
 
295 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  31.51 
 
 
243 aa  119  6e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  30.84 
 
 
301 aa  118  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0547  hypothetical protein  29.86 
 
 
218 aa  118  7e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.825313  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  34.27 
 
 
238 aa  118  7.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2274  protein of unknown function DUF45  33.18 
 
 
243 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4740  protein of unknown function DUF45  28.39 
 
 
318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.677282  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  30.13 
 
 
300 aa  116  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  31.14 
 
 
300 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0406  hypothetical protein  29.33 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.317112  normal  0.0115722 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  32.61 
 
 
227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  30.8 
 
 
285 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  30.84 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  32.61 
 
 
227 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  30.84 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  30.84 
 
 
303 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  30.84 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4173  hypothetical protein  27.27 
 
 
303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.282875 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  30.84 
 
 
316 aa  113  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3235  hypothetical protein  29.3 
 
 
251 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2166  hypothetical protein  27.35 
 
 
310 aa  112  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  29.51 
 
 
251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  30.6 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  29.5 
 
 
240 aa  109  3e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0448  hypothetical protein  28.88 
 
 
319 aa  110  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3354  hypothetical protein  30.41 
 
 
265 aa  109  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  30.22 
 
 
285 aa  108  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0604  protein of unknown function DUF45  31.58 
 
 
241 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.068795 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4199  hypothetical protein  28.29 
 
 
340 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3692  hypothetical protein  28.22 
 
 
314 aa  106  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.349516  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0505  hypothetical protein  28.57 
 
 
233 aa  106  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.722938 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0593  hypothetical protein  30.62 
 
 
260 aa  105  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0332404  normal  0.0318611 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2928  hypothetical protein  30.48 
 
 
219 aa  104  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  31.22 
 
 
240 aa  104  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  29.65 
 
 
241 aa  104  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0531  hypothetical protein  25.43 
 
 
306 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.10161 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  31 
 
 
240 aa  103  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3493  hypothetical protein  30.14 
 
 
244 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.718444  normal  0.055231 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2642  hypothetical protein  30.73 
 
 
228 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2255  zinc metalloprotease  32.61 
 
 
227 aa  103  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0010  hypothetical protein  28.51 
 
 
270 aa  103  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000896967 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0982  zinc metallopeptidase-like protein  30.24 
 
 
228 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0212  hypothetical protein  27.16 
 
 
321 aa  102  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0964391 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2986  conserved hypothetical protein DUF45  28.71 
 
 
230 aa  101  8e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  28.37 
 
 
245 aa  100  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0547  protein of unknown function DUF45  25 
 
 
306 aa  101  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3676  hypothetical protein  27.94 
 
 
227 aa  101  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3377  hypothetical protein  27.83 
 
 
320 aa  101  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  27.63 
 
 
288 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2794  protein of unknown function DUF45  27.68 
 
 
242 aa  100  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182535  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  28.57 
 
 
240 aa  100  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0015  hypothetical protein  29.91 
 
 
247 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000114472  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2293  hypothetical protein  31.7 
 
 
227 aa  100  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  27.11 
 
 
292 aa  99.8  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0508  hypothetical protein  28.99 
 
 
233 aa  100  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  27.11 
 
 
292 aa  99.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1858  protein of unknown function DUF45  26.91 
 
 
226 aa  98.6  7e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000912457  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3952  protein of unknown function DUF45  36.04 
 
 
252 aa  98.2  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>