273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3789 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  479  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  66.24 
 
 
238 aa  337  5.9999999999999996e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  61.37 
 
 
237 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  59.11 
 
 
244 aa  290  9e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  57.33 
 
 
237 aa  282  3.0000000000000004e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  42.15 
 
 
241 aa  177  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0568  hypothetical protein  40 
 
 
235 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000566322 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0843  hypothetical protein  35.78 
 
 
246 aa  152  5e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335069  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0791  hypothetical protein  35.78 
 
 
246 aa  152  5e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  31.43 
 
 
244 aa  150  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05618  hypothetical protein  35.35 
 
 
226 aa  150  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2595  hypothetical protein  35.87 
 
 
238 aa  149  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23171  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0800  hypothetical protein  35.43 
 
 
237 aa  146  3e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0356506  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0505  hypothetical protein  40 
 
 
233 aa  146  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.722938 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4036  hypothetical protein  36.32 
 
 
234 aa  145  6e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  33.33 
 
 
224 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  34.51 
 
 
224 aa  143  2e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1843  protein of unknown function DUF45  33.33 
 
 
254 aa  143  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224767 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2794  protein of unknown function DUF45  40.45 
 
 
242 aa  142  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182535  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  35.24 
 
 
227 aa  142  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  35.24 
 
 
227 aa  142  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  33.78 
 
 
234 aa  141  7e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2255  zinc metalloprotease  36.89 
 
 
227 aa  142  7e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  39 
 
 
238 aa  140  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  33.94 
 
 
223 aa  140  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  35.62 
 
 
243 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0100  hypothetical protein  35.48 
 
 
231 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58057  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  33.64 
 
 
223 aa  136  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  34.62 
 
 
252 aa  135  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  32.88 
 
 
224 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  30.54 
 
 
239 aa  134  9e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  36.75 
 
 
261 aa  133  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  33.18 
 
 
245 aa  132  6e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  30.61 
 
 
243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2274  protein of unknown function DUF45  37.09 
 
 
243 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  32.75 
 
 
245 aa  125  7e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0309  zinc metalloprotease  33.65 
 
 
235 aa  124  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  29.49 
 
 
242 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  31.96 
 
 
254 aa  124  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  31.58 
 
 
241 aa  123  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0369  hypothetical protein  33.18 
 
 
235 aa  121  8e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0322  hypothetical protein  33.18 
 
 
235 aa  121  9e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000118894  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0337  hypothetical protein  33.18 
 
 
235 aa  121  9e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000389941  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0807  hypothetical protein  33.33 
 
 
253 aa  121  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0306  zinc metalloprotease  32.7 
 
 
235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  29.36 
 
 
301 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0431  hypothetical protein  32.7 
 
 
235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  31.95 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0431  hypothetical protein  31.75 
 
 
235 aa  119  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00811962  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0384  zinc metalloprotease  31.75 
 
 
235 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0625718  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  26.97 
 
 
251 aa  117  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0317  hypothetical protein  32.55 
 
 
235 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0406  hypothetical protein  30.53 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.317112  normal  0.0115722 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06805  hypothetical protein  33.76 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0984  zinc metalloprotease  33.5 
 
 
221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3354  hypothetical protein  31.3 
 
 
265 aa  116  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2113  hypothetical protein  31.58 
 
 
253 aa  115  5e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301869  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2029  hypothetical protein  31.58 
 
 
255 aa  115  5e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.611915  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0668  hypothetical protein  30.9 
 
 
251 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1951  hypothetical protein  31.22 
 
 
481 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  29.49 
 
 
292 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  29.49 
 
 
292 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  28.77 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  28.77 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  28.77 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  29.22 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  28.77 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  28.96 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  28.96 
 
 
303 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  28.77 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  28.77 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  28.77 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  28.51 
 
 
295 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  30.73 
 
 
288 aa  112  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  28.51 
 
 
295 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  28.51 
 
 
295 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  29.28 
 
 
240 aa  112  6e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  28.05 
 
 
316 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  28.25 
 
 
300 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0949  hypothetical protein  33.97 
 
 
219 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0658473  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4010  hypothetical protein  28.63 
 
 
253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3493  hypothetical protein  29.03 
 
 
244 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.718444  normal  0.055231 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0413  hypothetical protein  30.8 
 
 
249 aa  109  5e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2542  protein of unknown function DUF45  32.85 
 
 
242 aa  109  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.65103  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0156  hypothetical protein  30.42 
 
 
270 aa  108  6e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1114  hypothetical protein  32.48 
 
 
254 aa  108  6e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0010  hypothetical protein  29.74 
 
 
270 aa  108  7.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000896967 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  27.85 
 
 
300 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1292  hypothetical protein  30.53 
 
 
308 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.232025 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1894  hypothetical protein  32.47 
 
 
242 aa  107  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470997  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  28.11 
 
 
285 aa  106  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3548  hypothetical protein  36 
 
 
242 aa  106  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.405363  normal  0.224983 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4173  hypothetical protein  30.8 
 
 
303 aa  106  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.282875 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3235  hypothetical protein  25.31 
 
 
251 aa  105  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3952  protein of unknown function DUF45  28.27 
 
 
252 aa  105  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  28.24 
 
 
286 aa  105  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0604  protein of unknown function DUF45  29.3 
 
 
241 aa  105  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.068795 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2986  conserved hypothetical protein DUF45  28.81 
 
 
230 aa  104  9e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2642  hypothetical protein  29.6 
 
 
228 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1084  protein of unknown function DUF45  34.39 
 
 
221 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>