278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3493 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3493  hypothetical protein  100 
 
 
244 aa  484  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.718444  normal  0.055231 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0568  protein of unknown function DUF45  68.03 
 
 
241 aa  332  2e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0593  hypothetical protein  66.8 
 
 
260 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0332404  normal  0.0318611 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0604  protein of unknown function DUF45  66.39 
 
 
241 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.068795 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1837  protein of unknown function DUF45  62.5 
 
 
247 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4887  hypothetical protein  61.32 
 
 
243 aa  264  8.999999999999999e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.334239  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1260  hypothetical protein  56.52 
 
 
256 aa  259  2e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.017504 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0125  hypothetical protein  50.41 
 
 
256 aa  228  7e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84591  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0064  hypothetical protein  50.83 
 
 
278 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0303  hypothetical protein  48.59 
 
 
266 aa  223  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0131  hypothetical protein  50.83 
 
 
278 aa  223  2e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.249542 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0324  protein of unknown function DUF45  51.27 
 
 
263 aa  223  3e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00482569 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0228  hypothetical protein  51.24 
 
 
278 aa  222  3e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31038  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0355  hypothetical protein  49.17 
 
 
279 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0579  protein of unknown function DUF45  49.17 
 
 
249 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7655  putative metal-dependent hydrolase  52.31 
 
 
198 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0668  hypothetical protein  42.29 
 
 
251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3354  hypothetical protein  45.58 
 
 
265 aa  191  7e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2113  hypothetical protein  42.79 
 
 
253 aa  191  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301869  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2029  hypothetical protein  42.79 
 
 
255 aa  191  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.611915  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0010  hypothetical protein  42.98 
 
 
270 aa  190  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000896967 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0018  hypothetical protein  39.83 
 
 
254 aa  190  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3235  hypothetical protein  40.51 
 
 
251 aa  188  7e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4279  protein of unknown function DUF45  40.51 
 
 
252 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3952  protein of unknown function DUF45  41.03 
 
 
252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0807  hypothetical protein  41.89 
 
 
253 aa  178  5.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0982  zinc metallopeptidase-like protein  45.25 
 
 
228 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2642  hypothetical protein  45.25 
 
 
228 aa  162  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0508  hypothetical protein  41.63 
 
 
233 aa  157  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0839  hypothetical protein  40.72 
 
 
237 aa  156  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0094  hypothetical protein  45.7 
 
 
228 aa  153  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0430  hypothetical protein  43.94 
 
 
241 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1339  hypothetical protein  36.79 
 
 
243 aa  152  5e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1800  protein of unknown function DUF45  42.44 
 
 
240 aa  148  7e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.322708  normal  0.410252 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2986  conserved hypothetical protein DUF45  38.36 
 
 
230 aa  146  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3676  hypothetical protein  44.04 
 
 
227 aa  146  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  29.18 
 
 
244 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  30.25 
 
 
252 aa  129  6e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2855  hypothetical protein  36.89 
 
 
252 aa  125  9e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  39.89 
 
 
236 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2977  hypothetical protein  38.43 
 
 
227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0331949 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  29.55 
 
 
224 aa  120  3e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4654  hypothetical protein  38.33 
 
 
239 aa  119  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.791009  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  29.86 
 
 
224 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  30.27 
 
 
261 aa  117  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  27.88 
 
 
239 aa  118  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1480  hypothetical protein  36.28 
 
 
268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  32.08 
 
 
241 aa  115  5e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  32.44 
 
 
240 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  35.24 
 
 
285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  28.88 
 
 
262 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  34.76 
 
 
238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  25.21 
 
 
251 aa  112  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  30.67 
 
 
240 aa  112  6e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  29.49 
 
 
237 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  33.05 
 
 
301 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  32.78 
 
 
286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2344  hypothetical protein  36.06 
 
 
217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  36.98 
 
 
300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  27.52 
 
 
238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  34.5 
 
 
245 aa  110  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  27.8 
 
 
240 aa  110  3e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  34.41 
 
 
300 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  32.48 
 
 
295 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  33.19 
 
 
246 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  29 
 
 
224 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  34.09 
 
 
295 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  34.09 
 
 
295 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  27.23 
 
 
241 aa  106  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  35.2 
 
 
303 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  34.69 
 
 
316 aa  105  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  35.2 
 
 
285 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  30.04 
 
 
223 aa  105  8e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2818  hypothetical protein  37.24 
 
 
240 aa  105  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608131  normal  0.17098 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  33.49 
 
 
288 aa  104  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0413  hypothetical protein  30.7 
 
 
249 aa  104  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0443  hypothetical protein  35.68 
 
 
292 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  29.03 
 
 
235 aa  104  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  31.88 
 
 
292 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  31.88 
 
 
292 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  30.14 
 
 
234 aa  103  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2255  zinc metalloprotease  44.44 
 
 
227 aa  103  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  31.58 
 
 
295 aa  102  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  27.65 
 
 
244 aa  102  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  31.58 
 
 
292 aa  101  9e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  31.58 
 
 
292 aa  101  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  31.58 
 
 
292 aa  101  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  31.6 
 
 
292 aa  101  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  31.58 
 
 
292 aa  101  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  31.58 
 
 
292 aa  101  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  31.58 
 
 
292 aa  101  9e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  34.36 
 
 
240 aa  100  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  31.36 
 
 
243 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1084  protein of unknown function DUF45  36.42 
 
 
221 aa  99.8  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  27.06 
 
 
237 aa  99.4  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4199  hypothetical protein  31.47 
 
 
340 aa  99.4  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  35.25 
 
 
223 aa  99  7e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0547  hypothetical protein  31.34 
 
 
218 aa  98.2  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.825313  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1181  protein of unknown function DUF45  36.45 
 
 
242 aa  97.8  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  38.53 
 
 
227 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>