299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0683 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  100 
 
 
300 aa  608  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  96.67 
 
 
300 aa  552  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  77 
 
 
285 aa  462  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  68.77 
 
 
295 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  68.44 
 
 
295 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  68.44 
 
 
295 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  68.11 
 
 
316 aa  401  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  68.11 
 
 
295 aa  404  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  68.2 
 
 
303 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  67.44 
 
 
292 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  67.44 
 
 
292 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  68.98 
 
 
301 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  67.44 
 
 
292 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  67.44 
 
 
292 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  67.44 
 
 
292 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  67.44 
 
 
292 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  67.11 
 
 
292 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  75.82 
 
 
285 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  59.86 
 
 
292 aa  358  7e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0443  hypothetical protein  61.27 
 
 
292 aa  356  2.9999999999999997e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  68.67 
 
 
288 aa  355  5e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  59.53 
 
 
292 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  57.75 
 
 
286 aa  341  9e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3377  hypothetical protein  44.05 
 
 
320 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4740  protein of unknown function DUF45  45.39 
 
 
318 aa  232  6e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.677282  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4199  hypothetical protein  46.28 
 
 
340 aa  222  7e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4173  hypothetical protein  46.25 
 
 
303 aa  218  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.282875 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0448  hypothetical protein  45.06 
 
 
319 aa  217  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0212  hypothetical protein  46.12 
 
 
321 aa  216  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0964391 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0547  protein of unknown function DUF45  46.22 
 
 
306 aa  216  4e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0531  hypothetical protein  46.22 
 
 
306 aa  216  5e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.10161 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2166  hypothetical protein  46.69 
 
 
310 aa  210  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3692  hypothetical protein  45.73 
 
 
314 aa  205  7e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.349516  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  43.69 
 
 
236 aa  176  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1292  hypothetical protein  40.93 
 
 
308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.232025 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0547  hypothetical protein  44.95 
 
 
218 aa  168  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.825313  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3538  hypothetical protein  40.53 
 
 
239 aa  159  4e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739224  normal  0.0386409 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  36.17 
 
 
244 aa  157  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  34.62 
 
 
252 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  35.04 
 
 
240 aa  142  8e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  33.2 
 
 
261 aa  142  9e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  31.3 
 
 
243 aa  136  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1181  protein of unknown function DUF45  36.79 
 
 
242 aa  135  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  28.57 
 
 
241 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0593  hypothetical protein  34.78 
 
 
260 aa  127  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0332404  normal  0.0318611 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0604  protein of unknown function DUF45  34.55 
 
 
241 aa  125  7e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.068795 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2344  hypothetical protein  37.88 
 
 
217 aa  125  9e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  30.52 
 
 
251 aa  124  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  32.05 
 
 
242 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  29.91 
 
 
240 aa  124  2e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  30.29 
 
 
262 aa  123  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  35.98 
 
 
243 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3354  hypothetical protein  36.6 
 
 
265 aa  120  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  29.49 
 
 
240 aa  120  3e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  31.22 
 
 
238 aa  120  3.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  30.34 
 
 
240 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0568  protein of unknown function DUF45  34.68 
 
 
241 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  33.78 
 
 
224 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05618  hypothetical protein  31.28 
 
 
226 aa  117  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4279  protein of unknown function DUF45  28.87 
 
 
252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0303  hypothetical protein  34.8 
 
 
266 aa  115  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  30.4 
 
 
234 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  27.71 
 
 
237 aa  115  7.999999999999999e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  27.75 
 
 
237 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3952  protein of unknown function DUF45  27.95 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0018  hypothetical protein  31.51 
 
 
254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0508  hypothetical protein  35.78 
 
 
233 aa  112  9e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  29.69 
 
 
239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1800  protein of unknown function DUF45  34.81 
 
 
240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.322708  normal  0.410252 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0839  hypothetical protein  32.42 
 
 
237 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  29.22 
 
 
227 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3493  hypothetical protein  34.41 
 
 
244 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.718444  normal  0.055231 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0100  hypothetical protein  29.24 
 
 
231 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58057  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  28.77 
 
 
227 aa  108  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4887  hypothetical protein  34.04 
 
 
243 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.334239  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2794  protein of unknown function DUF45  28.87 
 
 
242 aa  108  9.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182535  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  30.54 
 
 
245 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  33.18 
 
 
246 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3235  hypothetical protein  28.57 
 
 
251 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  29.69 
 
 
223 aa  107  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0668  hypothetical protein  29.63 
 
 
251 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0843  hypothetical protein  29.52 
 
 
246 aa  107  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335069  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0413  hypothetical protein  29.39 
 
 
249 aa  107  3e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0791  hypothetical protein  29.52 
 
 
246 aa  107  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1837  protein of unknown function DUF45  35.4 
 
 
247 aa  106  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  30.09 
 
 
224 aa  106  5e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  31.92 
 
 
241 aa  106  6e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  31.53 
 
 
223 aa  105  9e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  31.02 
 
 
224 aa  105  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3676  hypothetical protein  33.93 
 
 
227 aa  103  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0125  hypothetical protein  31.19 
 
 
256 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84591  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1339  hypothetical protein  29.05 
 
 
243 aa  102  6e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  32.11 
 
 
254 aa  102  6e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  27.8 
 
 
235 aa  102  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4036  hypothetical protein  28.07 
 
 
234 aa  102  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0064  hypothetical protein  31.68 
 
 
278 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0010  hypothetical protein  28.85 
 
 
270 aa  101  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000896967 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2274  protein of unknown function DUF45  32.12 
 
 
243 aa  99.8  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0579  protein of unknown function DUF45  31.19 
 
 
249 aa  99.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1951  hypothetical protein  31.22 
 
 
481 aa  99.4  6e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>