264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2595 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2595  hypothetical protein  100 
 
 
238 aa  491  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23171  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0800  hypothetical protein  42.44 
 
 
237 aa  194  9e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0356506  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1843  protein of unknown function DUF45  36.08 
 
 
254 aa  190  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224767 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2794  protein of unknown function DUF45  35.68 
 
 
242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182535  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  36.4 
 
 
241 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  36.25 
 
 
243 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  34.32 
 
 
244 aa  161  6e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4036  hypothetical protein  35.19 
 
 
234 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0309  zinc metalloprotease  34.25 
 
 
235 aa  159  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0322  hypothetical protein  33.79 
 
 
235 aa  158  7e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000118894  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0369  hypothetical protein  33.79 
 
 
235 aa  158  7e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0337  hypothetical protein  33.79 
 
 
235 aa  158  7e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000389941  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0384  zinc metalloprotease  33.79 
 
 
235 aa  157  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0625718  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0568  hypothetical protein  33.76 
 
 
235 aa  156  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000566322 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  32.44 
 
 
244 aa  156  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0431  hypothetical protein  33.79 
 
 
235 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00811962  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0431  hypothetical protein  33.79 
 
 
235 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0317  hypothetical protein  33.79 
 
 
235 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  32.62 
 
 
234 aa  155  6e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  32.35 
 
 
243 aa  154  8e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0306  zinc metalloprotease  33.03 
 
 
235 aa  154  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  34.07 
 
 
238 aa  154  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0843  hypothetical protein  33.62 
 
 
246 aa  151  8e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335069  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0791  hypothetical protein  33.62 
 
 
246 aa  151  8e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05618  hypothetical protein  34.33 
 
 
226 aa  148  7e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  33.33 
 
 
237 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  34.96 
 
 
227 aa  145  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  34.96 
 
 
227 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  32.49 
 
 
261 aa  144  9e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  35.14 
 
 
235 aa  144  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  32.73 
 
 
238 aa  142  6e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2542  protein of unknown function DUF45  32.59 
 
 
242 aa  135  5e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.65103  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  32.88 
 
 
237 aa  135  8e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2343  hypothetical protein  31.76 
 
 
238 aa  134  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.781257  normal  0.0217963 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  32.58 
 
 
224 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  31.05 
 
 
224 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  32.91 
 
 
245 aa  133  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1894  hypothetical protein  29.49 
 
 
242 aa  132  6e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470997  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  29.95 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0505  hypothetical protein  29.18 
 
 
233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.722938 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1114  hypothetical protein  30.71 
 
 
254 aa  129  3e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  32.11 
 
 
223 aa  129  6e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0617  hypothetical protein  33.8 
 
 
222 aa  128  8.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  30.73 
 
 
224 aa  128  9.000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  28.27 
 
 
252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3548  hypothetical protein  27.98 
 
 
242 aa  123  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.405363  normal  0.224983 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0100  hypothetical protein  25.91 
 
 
231 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58057  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0949  hypothetical protein  34.25 
 
 
219 aa  120  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0658473  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4010  hypothetical protein  26.29 
 
 
253 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  28.28 
 
 
251 aa  116  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2274  protein of unknown function DUF45  29.63 
 
 
243 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06805  hypothetical protein  32.21 
 
 
258 aa  115  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2255  zinc metalloprotease  28.84 
 
 
227 aa  115  5e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0156  hypothetical protein  29.78 
 
 
270 aa  115  6e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  26.97 
 
 
242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  27.59 
 
 
262 aa  111  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  25.43 
 
 
240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1858  protein of unknown function DUF45  29.11 
 
 
226 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000912457  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0083  hypothetical protein  29.95 
 
 
222 aa  108  5e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.000843512  decreased coverage  0.0000753316 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  27.45 
 
 
241 aa  109  5e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1819  hypothetical protein  30.92 
 
 
222 aa  109  5e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0443  hypothetical protein  24.68 
 
 
292 aa  107  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  28.11 
 
 
223 aa  107  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1084  protein of unknown function DUF45  30.86 
 
 
221 aa  106  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0984  zinc metalloprotease  30.99 
 
 
221 aa  105  7e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1098  hypothetical protein  29.47 
 
 
222 aa  105  9e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  25.59 
 
 
245 aa  104  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  24.68 
 
 
286 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  25.96 
 
 
246 aa  102  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2552  hypothetical protein  23.65 
 
 
217 aa  102  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000141461  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4173  hypothetical protein  22.98 
 
 
303 aa  102  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.282875 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3538  hypothetical protein  23.35 
 
 
239 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739224  normal  0.0386409 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  25.81 
 
 
239 aa  100  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  27.1 
 
 
236 aa  99  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  25.53 
 
 
240 aa  98.6  8e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0212  hypothetical protein  23.05 
 
 
321 aa  98.6  8e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0964391 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0413  hypothetical protein  29.31 
 
 
249 aa  97.1  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0579  protein of unknown function DUF45  27 
 
 
249 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  22.75 
 
 
292 aa  96.7  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3493  hypothetical protein  25.45 
 
 
244 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.718444  normal  0.055231 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  22.75 
 
 
292 aa  96.7  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0355  hypothetical protein  27 
 
 
279 aa  96.3  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0010  hypothetical protein  30.97 
 
 
270 aa  95.9  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000896967 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3354  hypothetical protein  23.11 
 
 
265 aa  95.1  8e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2166  hypothetical protein  21.1 
 
 
310 aa  94.4  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1292  hypothetical protein  22.13 
 
 
308 aa  93.2  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.232025 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1661  protein of unknown function DUF45  22.88 
 
 
244 aa  92.8  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.843742  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  25 
 
 
240 aa  92.4  6e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2986  conserved hypothetical protein DUF45  30 
 
 
230 aa  92  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  21.82 
 
 
301 aa  91.7  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3377  hypothetical protein  24.68 
 
 
320 aa  91.7  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  22.08 
 
 
288 aa  90.5  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  23.36 
 
 
295 aa  90.1  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0125  hypothetical protein  25.5 
 
 
256 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84591  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2344  hypothetical protein  25.13 
 
 
217 aa  89.4  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0547  protein of unknown function DUF45  21.16 
 
 
306 aa  89.4  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  24.68 
 
 
240 aa  89.7  4e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  22.22 
 
 
285 aa  89  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0064  hypothetical protein  26.79 
 
 
278 aa  89  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  21.88 
 
 
285 aa  89.4  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>