285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05618 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05618  hypothetical protein  100 
 
 
226 aa  471  1e-132  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4036  hypothetical protein  53.07 
 
 
234 aa  248  8e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0568  hypothetical protein  50.22 
 
 
235 aa  234  6e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000566322 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  41.4 
 
 
224 aa  180  1e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  41.4 
 
 
224 aa  176  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  38.5 
 
 
238 aa  169  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  39.53 
 
 
224 aa  169  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  38.05 
 
 
244 aa  169  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  38.57 
 
 
223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  35.5 
 
 
237 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0100  hypothetical protein  33.63 
 
 
231 aa  158  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58057  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  37.67 
 
 
227 aa  156  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  36.36 
 
 
237 aa  156  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  37.62 
 
 
223 aa  155  4e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  37.21 
 
 
227 aa  155  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  35.4 
 
 
243 aa  154  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0800  hypothetical protein  39.47 
 
 
237 aa  151  8e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0356506  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  34.91 
 
 
243 aa  150  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0505  hypothetical protein  34.38 
 
 
233 aa  149  4e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.722938 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2595  hypothetical protein  34.33 
 
 
238 aa  148  7e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23171  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  34.19 
 
 
241 aa  148  9e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4010  hypothetical protein  32 
 
 
253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1843  protein of unknown function DUF45  34.04 
 
 
254 aa  145  7.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224767 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2255  zinc metalloprotease  35.29 
 
 
227 aa  144  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0843  hypothetical protein  33.48 
 
 
246 aa  142  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335069  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0791  hypothetical protein  33.48 
 
 
246 aa  142  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  32 
 
 
244 aa  142  6e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  33.33 
 
 
235 aa  137  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  33.48 
 
 
241 aa  137  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  32.3 
 
 
252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2794  protein of unknown function DUF45  32.74 
 
 
242 aa  134  8e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182535  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  33.07 
 
 
261 aa  133  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  32.24 
 
 
240 aa  133  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  36 
 
 
238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0431  hypothetical protein  31.51 
 
 
235 aa  129  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00811962  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  34.93 
 
 
254 aa  128  7.000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0309  zinc metalloprotease  30.41 
 
 
235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  34.04 
 
 
234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0306  zinc metalloprotease  31.05 
 
 
235 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0322  hypothetical protein  30.41 
 
 
235 aa  126  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000118894  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0337  hypothetical protein  30.41 
 
 
235 aa  126  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000389941  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0369  hypothetical protein  30.41 
 
 
235 aa  126  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0431  hypothetical protein  30.59 
 
 
235 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0384  zinc metalloprotease  29.95 
 
 
235 aa  124  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0625718  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0317  hypothetical protein  29.03 
 
 
235 aa  121  8e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  32.61 
 
 
262 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  32.16 
 
 
242 aa  119  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  31.56 
 
 
285 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2343  hypothetical protein  31.22 
 
 
238 aa  117  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.781257  normal  0.0217963 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  31.72 
 
 
300 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  31.28 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  33.48 
 
 
245 aa  116  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3538  hypothetical protein  29.47 
 
 
239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739224  normal  0.0386409 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2986  conserved hypothetical protein DUF45  31.22 
 
 
230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  31.84 
 
 
295 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  30.45 
 
 
292 aa  112  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  29.6 
 
 
292 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  29.6 
 
 
292 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  30.04 
 
 
301 aa  113  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  29.6 
 
 
292 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  30.45 
 
 
292 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  29.6 
 
 
292 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0212  hypothetical protein  31.93 
 
 
321 aa  113  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0964391 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  29.6 
 
 
292 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  28.5 
 
 
240 aa  112  3e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  29.6 
 
 
292 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  29.6 
 
 
292 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  26.64 
 
 
240 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  28.04 
 
 
240 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3354  hypothetical protein  29.91 
 
 
265 aa  111  9e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0413  hypothetical protein  26.67 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3548  hypothetical protein  28.5 
 
 
242 aa  109  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.405363  normal  0.224983 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  29.09 
 
 
295 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  29.09 
 
 
316 aa  107  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  29.09 
 
 
303 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1084  protein of unknown function DUF45  35.33 
 
 
221 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0547  hypothetical protein  29.09 
 
 
218 aa  107  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.825313  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  28.64 
 
 
285 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  28.64 
 
 
295 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  28.64 
 
 
295 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  28.37 
 
 
288 aa  105  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  28.03 
 
 
245 aa  104  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  27.57 
 
 
286 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0443  hypothetical protein  26.27 
 
 
292 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4173  hypothetical protein  27.98 
 
 
303 aa  103  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.282875 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06805  hypothetical protein  28.7 
 
 
258 aa  102  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0011  hypothetical protein  30.39 
 
 
236 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0010  hypothetical protein  28.44 
 
 
270 aa  100  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000896967 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  27.08 
 
 
251 aa  99.8  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0083  hypothetical protein  32.85 
 
 
222 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.000843512  decreased coverage  0.0000753316 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2274  protein of unknown function DUF45  30.53 
 
 
243 aa  100  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0839  hypothetical protein  28.38 
 
 
237 aa  98.6  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1894  hypothetical protein  28.31 
 
 
242 aa  97.8  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470997  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4740  protein of unknown function DUF45  28.25 
 
 
318 aa  97.4  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.677282  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  25.99 
 
 
239 aa  97.8  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2542  protein of unknown function DUF45  28.84 
 
 
242 aa  98.2  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.65103  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0617  hypothetical protein  29 
 
 
222 aa  97.4  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3676  hypothetical protein  28.57 
 
 
227 aa  97.8  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0303  hypothetical protein  27.85 
 
 
266 aa  97.1  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0324  protein of unknown function DUF45  27.16 
 
 
263 aa  95.1  8e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00482569 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>