295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0402 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  32.46 
 
 
237 aa  129  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  29.54 
 
 
241 aa  121  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  30.54 
 
 
242 aa  119  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  32.37 
 
 
262 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  30.47 
 
 
239 aa  117  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  30.13 
 
 
238 aa  116  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  32.75 
 
 
235 aa  116  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  31.93 
 
 
244 aa  115  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  29.33 
 
 
237 aa  115  5e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0413  hypothetical protein  27.39 
 
 
249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3363  hypothetical protein  33.19 
 
 
249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  30.17 
 
 
243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2274  protein of unknown function DUF45  35.11 
 
 
243 aa  113  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  29.65 
 
 
224 aa  113  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0800  hypothetical protein  27.47 
 
 
237 aa  113  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0356506  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  26.42 
 
 
251 aa  112  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  31.3 
 
 
252 aa  112  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3354  hypothetical protein  34.48 
 
 
265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3493  hypothetical protein  34.5 
 
 
244 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.718444  normal  0.055231 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  29.69 
 
 
245 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  28.32 
 
 
224 aa  105  4e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  27.48 
 
 
244 aa  106  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1661  protein of unknown function DUF45  32.58 
 
 
244 aa  105  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.843742  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  30.43 
 
 
241 aa  105  8e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2595  hypothetical protein  25.59 
 
 
238 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23171  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05618  hypothetical protein  28.03 
 
 
226 aa  104  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0010  hypothetical protein  29.88 
 
 
270 aa  103  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000896967 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  32.3 
 
 
240 aa  103  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4173  hypothetical protein  34.93 
 
 
303 aa  102  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.282875 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1858  protein of unknown function DUF45  30.45 
 
 
226 aa  102  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000912457  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3235  hypothetical protein  29.31 
 
 
251 aa  102  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1292  hypothetical protein  35.5 
 
 
308 aa  102  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.232025 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  31 
 
 
295 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  31 
 
 
295 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  29.44 
 
 
243 aa  101  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0807  hypothetical protein  31.9 
 
 
253 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  30.34 
 
 
316 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  31.88 
 
 
285 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  29.83 
 
 
240 aa  101  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  30.57 
 
 
295 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0431  hypothetical protein  27.65 
 
 
235 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00811962  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2113  hypothetical protein  30.6 
 
 
253 aa  100  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301869  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1843  protein of unknown function DUF45  26.2 
 
 
254 aa  100  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224767 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2029  hypothetical protein  30.6 
 
 
255 aa  100  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.611915  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  31.44 
 
 
303 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  28.37 
 
 
234 aa  100  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1260  hypothetical protein  33.33 
 
 
256 aa  99.8  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.017504 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0306  zinc metalloprotease  27.19 
 
 
235 aa  99.4  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03844  hypothetical protein  31.42 
 
 
263 aa  99.8  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0369  hypothetical protein  27.65 
 
 
235 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  30.67 
 
 
301 aa  99.8  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0431  hypothetical protein  26.13 
 
 
235 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  29.78 
 
 
300 aa  99.4  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  31.17 
 
 
240 aa  99  6e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  29.57 
 
 
292 aa  99  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  29.57 
 
 
292 aa  99  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  26.67 
 
 
224 aa  98.6  7e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3538  hypothetical protein  32.88 
 
 
239 aa  99  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739224  normal  0.0386409 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0384  zinc metalloprotease  27.65 
 
 
235 aa  99  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0625718  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0322  hypothetical protein  27.19 
 
 
235 aa  98.2  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000118894  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0337  hypothetical protein  27.19 
 
 
235 aa  98.2  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000389941  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  28.89 
 
 
295 aa  97.4  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  29.33 
 
 
300 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0317  hypothetical protein  27.4 
 
 
235 aa  97.4  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0309  zinc metalloprotease  26.73 
 
 
235 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0060  protein of unknown function DUF45  30.84 
 
 
259 aa  96.7  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0543  peptidase S26A, signal peptidase I  32.43 
 
 
236 aa  96.7  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00150578  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0443  hypothetical protein  30.25 
 
 
292 aa  96.7  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  29.34 
 
 
261 aa  96.7  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1084  protein of unknown function DUF45  34.12 
 
 
221 aa  96.3  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0531  hypothetical protein  32.61 
 
 
306 aa  96.3  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.10161 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3952  protein of unknown function DUF45  28.63 
 
 
252 aa  96.3  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0125  hypothetical protein  31.88 
 
 
256 aa  96.3  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84591  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  26.85 
 
 
223 aa  95.5  6e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0668  hypothetical protein  29.91 
 
 
251 aa  95.5  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4279  protein of unknown function DUF45  30.34 
 
 
252 aa  95.9  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2109  protein of unknown function DUF45  30.53 
 
 
249 aa  95.5  7e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4036  hypothetical protein  26.5 
 
 
234 aa  95.1  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0604  protein of unknown function DUF45  33.77 
 
 
241 aa  95.1  9e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.068795 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0547  protein of unknown function DUF45  32.17 
 
 
306 aa  94.7  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0579  protein of unknown function DUF45  29.69 
 
 
249 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  31 
 
 
288 aa  94.4  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  30.65 
 
 
286 aa  94  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1561  zinc protease, putative  28.14 
 
 
244 aa  94  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1951  hypothetical protein  29.11 
 
 
481 aa  93.6  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0593  hypothetical protein  32.89 
 
 
260 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0332404  normal  0.0318611 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2986  conserved hypothetical protein DUF45  32.19 
 
 
230 aa  93.2  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0064  hypothetical protein  30.13 
 
 
278 aa  93.2  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  29.33 
 
 
285 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0568  hypothetical protein  33.56 
 
 
235 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000566322 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4201  protein of unknown function DUF45  28.18 
 
 
245 aa  92.8  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  28.82 
 
 
292 aa  92.8  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  28.82 
 
 
292 aa  92.8  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  28.82 
 
 
292 aa  92.8  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  28.82 
 
 
292 aa  92.8  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  28.82 
 
 
292 aa  92.8  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  28.82 
 
 
292 aa  92.8  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  28.82 
 
 
292 aa  92.8  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  44.23 
 
 
246 aa  92  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>