240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03844 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03844  hypothetical protein  100 
 
 
263 aa  524  1e-148  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0060  protein of unknown function DUF45  71.81 
 
 
259 aa  354  8.999999999999999e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1663  hypothetical protein  61.69 
 
 
264 aa  306  2.0000000000000002e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1735  hypothetical protein  61.69 
 
 
264 aa  306  3e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  31.42 
 
 
245 aa  99.8  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0568  protein of unknown function DUF45  29.24 
 
 
241 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0604  protein of unknown function DUF45  29.66 
 
 
241 aa  95.1  9e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.068795 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3538  hypothetical protein  29.96 
 
 
239 aa  95.1  9e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739224  normal  0.0386409 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0593  hypothetical protein  29.66 
 
 
260 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0332404  normal  0.0318611 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1837  protein of unknown function DUF45  33.99 
 
 
247 aa  94  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3363  hypothetical protein  29.57 
 
 
249 aa  92.4  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4887  hypothetical protein  31.84 
 
 
243 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.334239  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3493  hypothetical protein  28.21 
 
 
244 aa  92  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.718444  normal  0.055231 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0125  hypothetical protein  30.81 
 
 
256 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84591  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0579  protein of unknown function DUF45  29.52 
 
 
249 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0982  zinc metallopeptidase-like protein  32.29 
 
 
228 aa  89  7e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0064  hypothetical protein  29.67 
 
 
278 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0668  hypothetical protein  26.18 
 
 
251 aa  87.8  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2642  hypothetical protein  32.29 
 
 
228 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  28.84 
 
 
295 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1339  hypothetical protein  27.01 
 
 
243 aa  84.7  0.000000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0018  hypothetical protein  27.54 
 
 
254 aa  84  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  27.59 
 
 
292 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0839  hypothetical protein  30.53 
 
 
237 aa  82.8  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_004310  BR2113  hypothetical protein  24.24 
 
 
253 aa  82  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301869  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  27.39 
 
 
292 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  27.39 
 
 
292 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2029  hypothetical protein  24.24 
 
 
255 aa  81.6  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.611915  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  28.15 
 
 
303 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  27.39 
 
 
292 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  27.43 
 
 
301 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4279  protein of unknown function DUF45  27.85 
 
 
252 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  27.39 
 
 
292 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  27.39 
 
 
292 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  27.39 
 
 
292 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1181  protein of unknown function DUF45  34.34 
 
 
242 aa  80.9  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  28.15 
 
 
285 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3676  hypothetical protein  32.05 
 
 
227 aa  81.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  28.38 
 
 
292 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  27.85 
 
 
316 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2986  conserved hypothetical protein DUF45  31 
 
 
230 aa  79.7  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  28.38 
 
 
292 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  27.8 
 
 
295 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  24 
 
 
234 aa  80.1  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2595  hypothetical protein  20.25 
 
 
238 aa  79.7  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23171  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  29.76 
 
 
235 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  27.8 
 
 
295 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  27.8 
 
 
295 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1260  hypothetical protein  26.44 
 
 
256 aa  79.3  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.017504 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0807  hypothetical protein  24.68 
 
 
253 aa  79  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  25.85 
 
 
239 aa  78.6  0.00000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0355  hypothetical protein  27.52 
 
 
279 aa  78.6  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3235  hypothetical protein  26.54 
 
 
251 aa  78.2  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0508  hypothetical protein  29.78 
 
 
233 aa  78.2  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  28.14 
 
 
240 aa  78.2  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  24.57 
 
 
252 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  27.03 
 
 
243 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  24.42 
 
 
237 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  23.55 
 
 
244 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  23.89 
 
 
238 aa  77.8  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0413  hypothetical protein  23.27 
 
 
249 aa  77.8  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1480  hypothetical protein  28.88 
 
 
268 aa  77  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3952  protein of unknown function DUF45  26.97 
 
 
252 aa  76.3  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0094  hypothetical protein  32.59 
 
 
228 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0228  hypothetical protein  29.63 
 
 
278 aa  76.3  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31038  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  28.88 
 
 
288 aa  75.9  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  23.47 
 
 
245 aa  75.5  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0303  hypothetical protein  27.85 
 
 
266 aa  75.5  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  26.58 
 
 
286 aa  75.5  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0324  protein of unknown function DUF45  30.13 
 
 
263 aa  75.5  0.0000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00482569 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0131  hypothetical protein  29.1 
 
 
278 aa  75.1  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.249542 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0010  hypothetical protein  23.08 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000896967 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  23.98 
 
 
262 aa  74.7  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0459  hypothetical protein  24.66 
 
 
235 aa  73.9  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  22.17 
 
 
237 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3354  hypothetical protein  29.77 
 
 
265 aa  74.3  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  21.59 
 
 
244 aa  74.3  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  24.02 
 
 
241 aa  73.9  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4036  hypothetical protein  27.08 
 
 
234 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0435  hypothetical protein  23.98 
 
 
235 aa  73.6  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0365  hypothetical protein  25.13 
 
 
232 aa  73.2  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0669057  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0568  hypothetical protein  26.24 
 
 
235 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000566322 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  24.36 
 
 
241 aa  72.8  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0443  hypothetical protein  26.38 
 
 
292 aa  72.4  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1894  hypothetical protein  48.48 
 
 
242 aa  71.6  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470997  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1114  hypothetical protein  25.88 
 
 
254 aa  71.6  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  24.34 
 
 
242 aa  71.6  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1951  hypothetical protein  25.33 
 
 
481 aa  71.2  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  26.51 
 
 
300 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  26.51 
 
 
300 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7655  putative metal-dependent hydrolase  29.89 
 
 
198 aa  70.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  25.69 
 
 
223 aa  71.2  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0369  hypothetical protein  27.27 
 
 
235 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0322  hypothetical protein  27.27 
 
 
235 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000118894  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0337  hypothetical protein  27.27 
 
 
235 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000389941  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0543  peptidase S26A, signal peptidase I  25.53 
 
 
236 aa  69.3  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00150578  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0212  hypothetical protein  36.7 
 
 
321 aa  69.3  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0964391 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2552  hypothetical protein  26.47 
 
 
217 aa  68.9  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000141461  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0431  hypothetical protein  26.15 
 
 
235 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00811962  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  25.94 
 
 
285 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>