More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3363 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3363  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  498  1e-140  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  28.82 
 
 
242 aa  118  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  33.19 
 
 
245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  30.67 
 
 
241 aa  108  6e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  28.63 
 
 
251 aa  106  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  27.93 
 
 
239 aa  105  7e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0668  hypothetical protein  28.7 
 
 
251 aa  103  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0604  protein of unknown function DUF45  29.61 
 
 
241 aa  102  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.068795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0593  hypothetical protein  30.9 
 
 
260 aa  102  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0332404  normal  0.0318611 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0839  hypothetical protein  31.78 
 
 
237 aa  102  8e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0508  hypothetical protein  32.17 
 
 
233 aa  101  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3354  hypothetical protein  33.91 
 
 
265 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  29.06 
 
 
252 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2642  hypothetical protein  32.2 
 
 
228 aa  99.8  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0060  protein of unknown function DUF45  29.63 
 
 
259 aa  100  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0982  zinc metallopeptidase-like protein  31.36 
 
 
228 aa  99.4  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  26.64 
 
 
238 aa  98.2  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0807  hypothetical protein  28.7 
 
 
253 aa  98.2  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0568  protein of unknown function DUF45  30.04 
 
 
241 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_004310  BR2113  hypothetical protein  27.97 
 
 
253 aa  97.4  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301869  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2029  hypothetical protein  27.97 
 
 
255 aa  97.4  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.611915  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1951  hypothetical protein  26.29 
 
 
481 aa  97.4  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1260  hypothetical protein  31.91 
 
 
256 aa  97.1  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.017504 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  31.46 
 
 
246 aa  97.4  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1735  hypothetical protein  29.05 
 
 
264 aa  95.5  6e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4173  hypothetical protein  32.44 
 
 
303 aa  95.9  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.282875 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  31.52 
 
 
261 aa  95.1  8e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  26.46 
 
 
237 aa  94.7  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3493  hypothetical protein  29.26 
 
 
244 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.718444  normal  0.055231 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1663  hypothetical protein  28.03 
 
 
264 aa  94.7  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0018  hypothetical protein  29.67 
 
 
254 aa  94  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  28.05 
 
 
237 aa  94  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3235  hypothetical protein  28.33 
 
 
251 aa  94  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  25.54 
 
 
262 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  27.11 
 
 
244 aa  93.2  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4279  protein of unknown function DUF45  28.45 
 
 
252 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0010  hypothetical protein  30.04 
 
 
270 aa  93.2  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000896967 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3952  protein of unknown function DUF45  28.03 
 
 
252 aa  93.2  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03844  hypothetical protein  29.11 
 
 
263 aa  92.8  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0661  zinc protease, putative  31.71 
 
 
243 aa  92.8  5e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.792264  normal  0.0577046 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0443  hypothetical protein  29.07 
 
 
292 aa  92  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0303  hypothetical protein  32.1 
 
 
266 aa  92  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  30.81 
 
 
254 aa  91.3  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  31.43 
 
 
288 aa  90.9  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  26.79 
 
 
244 aa  89.7  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  27.23 
 
 
243 aa  89  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  24.35 
 
 
243 aa  88.6  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0430  hypothetical protein  28.78 
 
 
241 aa  88.2  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  27.43 
 
 
286 aa  88.6  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  27.93 
 
 
295 aa  87.8  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0094  hypothetical protein  31.78 
 
 
228 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0324  protein of unknown function DUF45  28.88 
 
 
263 aa  87.4  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00482569 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0406  hypothetical protein  24.58 
 
 
257 aa  87.4  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.317112  normal  0.0115722 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0977  protein of unknown function DUF45  26.79 
 
 
259 aa  87  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1480  hypothetical protein  32.35 
 
 
268 aa  86.7  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3676  hypothetical protein  33.04 
 
 
227 aa  86.7  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  42.86 
 
 
224 aa  86.3  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3538  hypothetical protein  28.38 
 
 
239 aa  85.9  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739224  normal  0.0386409 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  28.89 
 
 
241 aa  85.9  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1339  hypothetical protein  28.83 
 
 
243 aa  85.9  6e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1843  protein of unknown function DUF45  35.11 
 
 
254 aa  85.5  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224767 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0064  hypothetical protein  28.44 
 
 
278 aa  85.5  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  30 
 
 
300 aa  85.5  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0125  hypothetical protein  29.91 
 
 
256 aa  85.5  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84591  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2986  conserved hypothetical protein DUF45  28.82 
 
 
230 aa  84.7  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  30 
 
 
300 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  27.73 
 
 
292 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1800  protein of unknown function DUF45  31.19 
 
 
240 aa  84.3  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.322708  normal  0.410252 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0355  hypothetical protein  28.04 
 
 
279 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  27.73 
 
 
292 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0131  hypothetical protein  29.91 
 
 
278 aa  83.2  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.249542 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0579  protein of unknown function DUF45  30.37 
 
 
249 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4887  hypothetical protein  30.88 
 
 
243 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.334239  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0228  hypothetical protein  29.44 
 
 
278 aa  83.6  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31038  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2595  hypothetical protein  23.11 
 
 
238 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23171  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0609  hypothetical protein  35.56 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  48.61 
 
 
224 aa  83.6  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0401  hypothetical protein  26.44 
 
 
233 aa  83.2  0.000000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2344  hypothetical protein  30.23 
 
 
217 aa  83.2  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0800  hypothetical protein  23.98 
 
 
237 aa  82.8  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0356506  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  41.3 
 
 
235 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7655  putative metal-dependent hydrolase  29.35 
 
 
198 aa  82.4  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0100  hypothetical protein  29.78 
 
 
231 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58057  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  29.2 
 
 
292 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  29.2 
 
 
292 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0547  protein of unknown function DUF45  30.09 
 
 
306 aa  82  0.000000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  29.2 
 
 
292 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  29.2 
 
 
292 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  29.2 
 
 
292 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  29.2 
 
 
292 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  29.2 
 
 
292 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2794  protein of unknown function DUF45  29 
 
 
242 aa  82  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182535  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1837  protein of unknown function DUF45  28.04 
 
 
247 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  27.03 
 
 
301 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0531  hypothetical protein  30.09 
 
 
306 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.10161 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  35.29 
 
 
245 aa  81.3  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2732  hypothetical protein  30.62 
 
 
240 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0317  hypothetical protein  25 
 
 
235 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0015  hypothetical protein  30.64 
 
 
247 aa  81.3  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000114472  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0788  protein of unknown function DUF45  28.57 
 
 
241 aa  80.5  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>