266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7655 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7655  putative metal-dependent hydrolase  100 
 
 
198 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0131  hypothetical protein  82.83 
 
 
278 aa  346  1e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.249542 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0228  hypothetical protein  83.33 
 
 
278 aa  345  2e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31038  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0125  hypothetical protein  83.33 
 
 
256 aa  339  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84591  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0579  protein of unknown function DUF45  82.83 
 
 
249 aa  339  2e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0355  hypothetical protein  81.31 
 
 
279 aa  335  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0064  hypothetical protein  82.32 
 
 
278 aa  334  5e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0604  protein of unknown function DUF45  53.85 
 
 
241 aa  218  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.068795 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0303  hypothetical protein  54.08 
 
 
266 aa  218  5e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0593  hypothetical protein  53.85 
 
 
260 aa  216  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0332404  normal  0.0318611 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0568  protein of unknown function DUF45  54.87 
 
 
241 aa  217  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1260  hypothetical protein  54 
 
 
256 aa  215  2.9999999999999998e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.017504 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4887  hypothetical protein  51.53 
 
 
243 aa  200  9e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.334239  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0324  protein of unknown function DUF45  51.26 
 
 
263 aa  201  9e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00482569 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3493  hypothetical protein  52.31 
 
 
244 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.718444  normal  0.055231 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1837  protein of unknown function DUF45  51.53 
 
 
247 aa  197  6e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0668  hypothetical protein  48.15 
 
 
251 aa  191  6e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0018  hypothetical protein  43.92 
 
 
254 aa  176  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4279  protein of unknown function DUF45  44.9 
 
 
252 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2029  hypothetical protein  45.83 
 
 
255 aa  172  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.611915  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2113  hypothetical protein  45.83 
 
 
253 aa  172  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301869  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3354  hypothetical protein  46.91 
 
 
265 aa  171  5e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3952  protein of unknown function DUF45  43.88 
 
 
252 aa  169  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0807  hypothetical protein  45.83 
 
 
253 aa  169  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0010  hypothetical protein  45.1 
 
 
270 aa  168  6e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000896967 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3235  hypothetical protein  42.93 
 
 
251 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1339  hypothetical protein  41.12 
 
 
243 aa  152  2e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0982  zinc metallopeptidase-like protein  41.92 
 
 
228 aa  136  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2642  hypothetical protein  41.41 
 
 
228 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0839  hypothetical protein  39.89 
 
 
237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1800  protein of unknown function DUF45  39.9 
 
 
240 aa  132  3.9999999999999996e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.322708  normal  0.410252 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0508  hypothetical protein  40.4 
 
 
233 aa  131  5e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2986  conserved hypothetical protein DUF45  40.91 
 
 
230 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0430  hypothetical protein  37.31 
 
 
241 aa  129  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0094  hypothetical protein  41.94 
 
 
228 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2977  hypothetical protein  36.41 
 
 
227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0331949 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3676  hypothetical protein  36.6 
 
 
227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  41.44 
 
 
252 aa  108  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2818  hypothetical protein  33.16 
 
 
240 aa  104  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608131  normal  0.17098 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4654  hypothetical protein  35.08 
 
 
239 aa  104  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.791009  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1181  protein of unknown function DUF45  35.96 
 
 
242 aa  103  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  40.74 
 
 
227 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1480  hypothetical protein  33 
 
 
268 aa  102  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  37.58 
 
 
240 aa  101  6e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  39.81 
 
 
227 aa  101  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  36.3 
 
 
236 aa  100  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  32.9 
 
 
241 aa  100  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0413  hypothetical protein  40.68 
 
 
249 aa  98.6  6e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  34.62 
 
 
300 aa  98.6  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  36.36 
 
 
239 aa  97.8  8e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  33.97 
 
 
300 aa  97.4  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  34.59 
 
 
246 aa  97.8  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  29.83 
 
 
238 aa  97.4  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  30.98 
 
 
244 aa  96.7  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2855  hypothetical protein  31.61 
 
 
252 aa  96.3  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  41.12 
 
 
286 aa  95.1  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  25.62 
 
 
241 aa  95.5  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  41.38 
 
 
238 aa  94.7  8e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  36.04 
 
 
242 aa  94.4  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0547  hypothetical protein  28.28 
 
 
218 aa  94.4  9e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.825313  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  39.56 
 
 
243 aa  94  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2255  zinc metalloprotease  41.51 
 
 
227 aa  94.4  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  32.97 
 
 
240 aa  93.2  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  40.19 
 
 
288 aa  92.8  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  41.12 
 
 
285 aa  92.4  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  36.79 
 
 
262 aa  92.4  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  30 
 
 
224 aa  92.4  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  33.59 
 
 
243 aa  91.7  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  34.78 
 
 
234 aa  91.7  6e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  39.13 
 
 
292 aa  91.7  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0443  hypothetical protein  40.19 
 
 
292 aa  91.7  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  39.13 
 
 
292 aa  91.3  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  36.15 
 
 
261 aa  90.9  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  37.86 
 
 
235 aa  90.5  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  34.43 
 
 
244 aa  90.5  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  37.72 
 
 
295 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  37.72 
 
 
316 aa  89.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  37.72 
 
 
295 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  37.72 
 
 
295 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  37.72 
 
 
303 aa  89.4  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  30.39 
 
 
240 aa  89  4e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  37.84 
 
 
285 aa  89  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3377  hypothetical protein  41.84 
 
 
320 aa  89  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  32.43 
 
 
292 aa  88.6  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  32.43 
 
 
292 aa  88.6  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  32.43 
 
 
292 aa  88.6  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  32.43 
 
 
292 aa  88.6  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  32.43 
 
 
292 aa  88.6  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  32.43 
 
 
292 aa  88.6  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  32.43 
 
 
292 aa  88.6  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  29.38 
 
 
223 aa  88.2  7e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  31.76 
 
 
295 aa  87.8  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  38.32 
 
 
301 aa  87.8  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3538  hypothetical protein  29.89 
 
 
239 aa  87.4  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739224  normal  0.0386409 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  32.97 
 
 
240 aa  87.8  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1084  protein of unknown function DUF45  33.91 
 
 
221 aa  87.4  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  33.96 
 
 
251 aa  87  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  33.33 
 
 
237 aa  87  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  35.58 
 
 
224 aa  86.7  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  38.38 
 
 
223 aa  85.9  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>