232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4654 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4654  hypothetical protein  100 
 
 
239 aa  471  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.791009  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0839  hypothetical protein  41.67 
 
 
237 aa  145  7.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3676  hypothetical protein  40.28 
 
 
227 aa  136  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2642  hypothetical protein  38.53 
 
 
228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0982  zinc metallopeptidase-like protein  38.07 
 
 
228 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3354  hypothetical protein  37.33 
 
 
265 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0094  hypothetical protein  38.99 
 
 
228 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0303  hypothetical protein  35.66 
 
 
266 aa  124  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0604  protein of unknown function DUF45  37.55 
 
 
241 aa  124  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.068795 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0568  protein of unknown function DUF45  37.97 
 
 
241 aa  124  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0018  hypothetical protein  33.33 
 
 
254 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3952  protein of unknown function DUF45  33.04 
 
 
252 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0010  hypothetical protein  35.08 
 
 
270 aa  123  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000896967 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0593  hypothetical protein  37.55 
 
 
260 aa  122  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0332404  normal  0.0318611 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1837  protein of unknown function DUF45  37.74 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4279  protein of unknown function DUF45  34.18 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3493  hypothetical protein  38.33 
 
 
244 aa  119  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.718444  normal  0.055231 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2986  conserved hypothetical protein DUF45  34.86 
 
 
230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0508  hypothetical protein  36.28 
 
 
233 aa  116  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4887  hypothetical protein  37.74 
 
 
243 aa  115  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.334239  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0807  hypothetical protein  31.67 
 
 
253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2818  hypothetical protein  36.1 
 
 
240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608131  normal  0.17098 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1339  hypothetical protein  32.88 
 
 
243 aa  113  3e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2113  hypothetical protein  31.56 
 
 
253 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301869  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2029  hypothetical protein  31.56 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.611915  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3235  hypothetical protein  31.39 
 
 
251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0579  protein of unknown function DUF45  32.86 
 
 
249 aa  108  5e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0064  hypothetical protein  34.11 
 
 
278 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0668  hypothetical protein  30.26 
 
 
251 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0324  protein of unknown function DUF45  34.07 
 
 
263 aa  107  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00482569 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0125  hypothetical protein  33.18 
 
 
256 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84591  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0228  hypothetical protein  33.33 
 
 
278 aa  104  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31038  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7655  putative metal-dependent hydrolase  35.08 
 
 
198 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0131  hypothetical protein  33.33 
 
 
278 aa  103  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.249542 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2977  hypothetical protein  34.84 
 
 
227 aa  103  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0331949 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  29.87 
 
 
262 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0355  hypothetical protein  30.81 
 
 
279 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1260  hypothetical protein  33.07 
 
 
256 aa  98.2  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.017504 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3538  hypothetical protein  34.62 
 
 
239 aa  96.7  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739224  normal  0.0386409 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2855  hypothetical protein  31.58 
 
 
252 aa  96.7  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  44.25 
 
 
240 aa  94.4  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  29.36 
 
 
237 aa  93.2  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  28.38 
 
 
252 aa  93.2  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  31.12 
 
 
261 aa  92.4  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0505  hypothetical protein  29.22 
 
 
233 aa  89  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.722938 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2255  zinc metalloprotease  29.26 
 
 
227 aa  88.6  7e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  32.39 
 
 
236 aa  88.2  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05618  hypothetical protein  26.03 
 
 
226 aa  86.7  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  27.54 
 
 
239 aa  86.3  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  25.68 
 
 
224 aa  86.3  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  28.91 
 
 
241 aa  85.9  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0430  hypothetical protein  35.58 
 
 
241 aa  85.5  6e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0547  hypothetical protein  29.76 
 
 
218 aa  85.1  8e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.825313  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  26.13 
 
 
227 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  25.68 
 
 
227 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  32.14 
 
 
246 aa  83.6  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  31.53 
 
 
238 aa  82.8  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  25 
 
 
238 aa  82.8  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1800  protein of unknown function DUF45  34.45 
 
 
240 aa  81.6  0.000000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.322708  normal  0.410252 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  24.4 
 
 
241 aa  81.3  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1951  hypothetical protein  26.43 
 
 
481 aa  80.9  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  33.03 
 
 
254 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  27.59 
 
 
235 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  23.51 
 
 
244 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  26.15 
 
 
224 aa  79.3  0.00000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  26.91 
 
 
237 aa  79  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  27.38 
 
 
223 aa  79  0.00000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  34.86 
 
 
224 aa  78.2  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2344  hypothetical protein  35.65 
 
 
217 aa  78.2  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0413  hypothetical protein  36.52 
 
 
249 aa  78.2  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0443  hypothetical protein  30.12 
 
 
292 aa  77.8  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0100  hypothetical protein  28.89 
 
 
231 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58057  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  27.66 
 
 
244 aa  75.1  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0843  hypothetical protein  27.93 
 
 
246 aa  74.7  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335069  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0791  hypothetical protein  27.93 
 
 
246 aa  74.7  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1181  protein of unknown function DUF45  32.43 
 
 
242 aa  75.1  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  30.21 
 
 
316 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  29.34 
 
 
301 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  29.54 
 
 
295 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  29.13 
 
 
242 aa  73.9  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  29.79 
 
 
303 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  29.79 
 
 
295 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  29.79 
 
 
285 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1843  protein of unknown function DUF45  23.9 
 
 
254 aa  73.6  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224767 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  25.95 
 
 
223 aa  72.8  0.000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  28.96 
 
 
300 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  29.36 
 
 
295 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  29.36 
 
 
295 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3363  hypothetical protein  30.6 
 
 
249 aa  72.4  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  28.27 
 
 
292 aa  72  0.000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  28.27 
 
 
292 aa  72  0.000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  28.27 
 
 
292 aa  72  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  28.27 
 
 
292 aa  72  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  28.27 
 
 
292 aa  72  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  28.27 
 
 
292 aa  72  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1084  protein of unknown function DUF45  32.56 
 
 
221 aa  72  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  28.27 
 
 
292 aa  72  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  28.96 
 
 
300 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  37.72 
 
 
286 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0800  hypothetical protein  23.33 
 
 
237 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0356506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>