260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1800 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1800  protein of unknown function DUF45  100 
 
 
240 aa  472  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.322708  normal  0.410252 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0430  hypothetical protein  50.66 
 
 
241 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3354  hypothetical protein  43.44 
 
 
265 aa  180  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0303  hypothetical protein  41.18 
 
 
266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0807  hypothetical protein  38.81 
 
 
253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3235  hypothetical protein  38.94 
 
 
251 aa  161  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0010  hypothetical protein  35.92 
 
 
270 aa  160  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000896967 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0668  hypothetical protein  39.91 
 
 
251 aa  160  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2113  hypothetical protein  38.36 
 
 
253 aa  159  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301869  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2029  hypothetical protein  38.36 
 
 
255 aa  159  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.611915  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4279  protein of unknown function DUF45  40.09 
 
 
252 aa  158  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3952  protein of unknown function DUF45  38.05 
 
 
252 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3493  hypothetical protein  40.35 
 
 
244 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.718444  normal  0.055231 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0604  protein of unknown function DUF45  42.38 
 
 
241 aa  155  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.068795 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0568  protein of unknown function DUF45  43.33 
 
 
241 aa  155  6e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0593  hypothetical protein  42.38 
 
 
260 aa  154  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0332404  normal  0.0318611 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1260  hypothetical protein  39.13 
 
 
256 aa  149  5e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.017504 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0324  protein of unknown function DUF45  40.91 
 
 
263 aa  148  6e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00482569 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2642  hypothetical protein  42.52 
 
 
228 aa  148  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0982  zinc metallopeptidase-like protein  42.06 
 
 
228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0064  hypothetical protein  41.06 
 
 
278 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0018  hypothetical protein  34.98 
 
 
254 aa  145  6e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0125  hypothetical protein  40.58 
 
 
256 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84591  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0228  hypothetical protein  39.61 
 
 
278 aa  144  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31038  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0579  protein of unknown function DUF45  39.61 
 
 
249 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0131  hypothetical protein  39.13 
 
 
278 aa  142  5e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.249542 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0355  hypothetical protein  38.65 
 
 
279 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0508  hypothetical protein  42.4 
 
 
233 aa  137  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1339  hypothetical protein  34.73 
 
 
243 aa  133  3e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7655  putative metal-dependent hydrolase  39.9 
 
 
198 aa  132  6.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1837  protein of unknown function DUF45  39.15 
 
 
247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4887  hypothetical protein  38.94 
 
 
243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.334239  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0094  hypothetical protein  41.59 
 
 
228 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0839  hypothetical protein  36.87 
 
 
237 aa  123  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3676  hypothetical protein  38.91 
 
 
227 aa  122  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  37.28 
 
 
236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  35.21 
 
 
246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  29.92 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2855  hypothetical protein  34.33 
 
 
252 aa  116  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2986  conserved hypothetical protein DUF45  38.53 
 
 
230 aa  115  7.999999999999999e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  33.63 
 
 
300 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  33.73 
 
 
243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  31.15 
 
 
300 aa  113  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  27.23 
 
 
224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  29.49 
 
 
252 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  30.53 
 
 
239 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  27.9 
 
 
244 aa  110  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  32.65 
 
 
295 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  32.65 
 
 
295 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  31.67 
 
 
285 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  32.24 
 
 
295 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  33.47 
 
 
285 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  32.37 
 
 
295 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  33.47 
 
 
303 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  32.48 
 
 
316 aa  106  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2977  hypothetical protein  33.8 
 
 
227 aa  106  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0331949 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  32.51 
 
 
286 aa  105  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  31.54 
 
 
292 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  31.54 
 
 
292 aa  105  9e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  31.54 
 
 
292 aa  105  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  31.54 
 
 
292 aa  105  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  31.54 
 
 
292 aa  105  9e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  31.54 
 
 
292 aa  105  9e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  31.54 
 
 
292 aa  105  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  25.83 
 
 
241 aa  104  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2818  hypothetical protein  36.11 
 
 
240 aa  103  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608131  normal  0.17098 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  31.84 
 
 
301 aa  102  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  34.08 
 
 
292 aa  102  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  34.08 
 
 
292 aa  102  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0413  hypothetical protein  41.67 
 
 
249 aa  101  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0443  hypothetical protein  31.12 
 
 
292 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2794  protein of unknown function DUF45  32.35 
 
 
242 aa  100  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182535  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1480  hypothetical protein  32.73 
 
 
268 aa  100  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  29.91 
 
 
240 aa  100  3e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  29.61 
 
 
240 aa  99.8  4e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  41.24 
 
 
243 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  32.05 
 
 
245 aa  99  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  27.92 
 
 
242 aa  99  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  30.74 
 
 
241 aa  98.2  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  26.17 
 
 
224 aa  97.1  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  33.93 
 
 
251 aa  96.7  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  32.2 
 
 
288 aa  96.3  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  31.25 
 
 
238 aa  96.3  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  23.98 
 
 
223 aa  95.9  5e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  27.47 
 
 
240 aa  94.4  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  25.34 
 
 
224 aa  94.7  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3363  hypothetical protein  32.76 
 
 
249 aa  94  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4654  hypothetical protein  34.16 
 
 
239 aa  94  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.791009  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0568  hypothetical protein  35.25 
 
 
235 aa  92  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000566322 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2293  hypothetical protein  34.82 
 
 
227 aa  91.7  9e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3538  hypothetical protein  31.36 
 
 
239 aa  90.9  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739224  normal  0.0386409 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2344  hypothetical protein  46.36 
 
 
217 aa  90.9  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0547  hypothetical protein  29.49 
 
 
218 aa  90.9  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.825313  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  32.41 
 
 
254 aa  90.1  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0800  hypothetical protein  23.5 
 
 
237 aa  90.1  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0356506  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  23.39 
 
 
223 aa  89.4  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  26.15 
 
 
237 aa  89.7  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3377  hypothetical protein  32.13 
 
 
320 aa  89  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  25.76 
 
 
237 aa  88.6  7e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1951  hypothetical protein  27.83 
 
 
481 aa  89  7e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>